208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4403 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4403  methylaspartate mutase subunit S  100 
 
 		 136 aa  275  1e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2692  methylaspartate mutase subunit S  78.46 
 
 		 144 aa  216  1e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15460  methylaspartate mutase subunit S  72.52 
 
 		 146 aa  201  2e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107349  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1023  methylaspartate mutase subunit S  68.22 
 
 		 139 aa  187  4e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0266173  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1347  methylaspartate mutase subunit S  63.24 
 
 		 137 aa  186  1e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0752  methylaspartate mutase subunit S  58.21 
 
 		 149 aa  170  5.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0832  methylaspartate mutase subunit S  57.46 
 
 		 149 aa  167  3e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1594  methylaspartate mutase, S subunit  51.13 
 
 		 146 aa  140  5e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3334  methylaspartate mutase, S subunit  50.38 
 
 		 151 aa  138  3e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2980  methylaspartate mutase subunit S  48.12 
 
 		 146 aa  135  2e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2791  methylaspartate mutase, S subunit  49.62 
 
 		 149 aa  134  5e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3405  methylaspartate mutase, E subunit  35.04 
 
 		 646 aa  77  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.70543 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4358  cobalamin B12-binding domain protein  33.33 
 
 		 159 aa  64.7  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.554272  normal  0.47471 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1548  cobalamin B12-binding domain protein  31.01 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000166361 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2929  cobalamin B12-binding domain protein  29.73 
 
 		 216 aa  57.8  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000012726  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2369  methylmalonyl-CoA mutase-like protein  35.16 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.308524  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2238  methylmalonyl-CoA mutase  34.62 
 
 		 722 aa  57  0.00000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6168  hypothetical protein  33.94 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.807131  decreased coverage  0.00427364 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2638  methylmalonyl-CoA mutase  34.88 
 
 		 720 aa  56.2  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3188  Methylmalonyl-CoA mutase  33.58 
 
 		 725 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.36577  normal  0.670701 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0081  cobalamin B12-binding domain protein  29.69 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6418  methylmalonyl-CoA mutase  32.31 
 
 		 729 aa  54.7  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2691  cobalamin B12-binding domain protein  29.46 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0118523  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2199  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  34.19 
 
 		 727 aa  54.3  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11523  methylmalonyl-CoA mutase  33.33 
 
 		 750 aa  53.9  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.26728 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1927  methylmalonyl-CoA mutase  32.54 
 
 		 719 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.273596  normal  0.727114 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2039  methylmalonyl-CoA mutase  32.54 
 
 		 719 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3021  methylmalonyl-CoA mutase  32.54 
 
 		 718 aa  53.9  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.954275 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2763  methylmalonyl-CoA mutase  34.11 
 
 		 751 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0863781  normal  0.728933 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0289  cobalamin B12-binding domain protein  30.4 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1488  methionine synthase  42.37 
 
 		 1156 aa  52  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.128181  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2479  methylmalonyl-CoA mutase  34.75 
 
 		 732 aa  51.6  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3538  methylmalonyl-CoA mutase  31.75 
 
 		 736 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.162308  normal  0.256268 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1760  methylmalonyl-CoA mutase  30.95 
 
 		 718 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.226069 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2951  methylaspartate mutase subunit S  32.46 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0872778  normal  0.0119232 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0510  cobalamin B12-binding domain protein  30.4 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.736031  normal  0.90311 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1920  methylmalonyl-CoA mutase large subunit  33.08 
 
 		 720 aa  51.2  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0552222  normal  0.617547 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21070  cobalamin B12-binding domain protein  34.04 
 
 		 730 aa  50.4  0.000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3649  methylmalonyl-CoA mutase  32.56 
 
 		 752 aa  50.1  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.808365 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0900  cobalamin B12-binding domain protein  28.46 
 
 		 138 aa  50.1  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1574  methylmalonyl-CoA mutase-like  29.32 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000332572  normal  0.305791 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2751  cobalamin B12-binding protein  36.36 
 
 		 236 aa  49.7  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4872  cobalamin B12-binding domain protein  29.7 
 
 		 210 aa  50.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2510  methylmalonyl-CoA mutase  31.58 
 
 		 722 aa  48.9  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.178476 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2505  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  31.01 
 
 		 736 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000422516  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2026  cobalamin B12-binding domain-containing protein  28.46 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000113125  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4794  methylmalonyl-CoA mutase  31.75 
 
 		 721 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.134601  normal  0.670991 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0582  cobalamin B12-binding domain-containing protein  30.08 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5261  methylmalonyl-CoA mutase  31.75 
 
 		 721 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.145645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0195  cobalamin B12-binding domain protein  31 
 
 		 218 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00543164  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3005  methylmalonyl-CoA mutase  32.54 
 
 		 754 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.598546  normal  0.356991 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2420  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  32.56 
 
 		 763 aa  48.5  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5337  methylmalonyl-CoA mutase  31.75 
 
 		 721 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.759699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2104  cobalamin B12-binding domain protein  31.63 
 
 		 228 aa  48.5  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0454156  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1849  methylmalonyl-CoA mutase  32.28 
 
 		 720 aa  48.5  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2040  methylmalonyl-CoA mutase  32.28 
 
 		 720 aa  48.5  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0545  methylmalonyl-CoA mutase  34.59 
 
 		 740 aa  48.9  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1418  methionine synthase  37.8 
 
 		 1181 aa  48.1  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.156555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3042  methylmalonyl-CoA mutase  32.77 
 
 		 720 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.057217 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0856  methylmalonyl-CoA mutase  32.58 
 
 		 714 aa  48.1  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0726  methylmalonyl-CoA mutase  33.33 
 
 		 712 aa  48.1  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.999011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0388  cobalamin B12-binding domain-containing protein  30 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000031654  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1702  methylmalonyl-CoA mutase  34.43 
 
 		 718 aa  47.8  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0321557 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1359  cobalamin B12-binding domain protein  29.01 
 
 		 128 aa  47.8  0.00005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000160657  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1541  methylmalonyl-CoA mutase, alpha subunit  30 
 
 		 151 aa  47.8  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0770461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4325  methyltransferase cognate corrinoid protein  33.75 
 
 		 214 aa  47.4  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0909  cobalamin B12-binding domain-containing protein  35.11 
 
 		 728 aa  47.4  0.00006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1316  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  29.67 
 
 		 207 aa  47.4  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.518339 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1481  cobalamin B12-binding domain-containing protein  32.98 
 
 		 734 aa  47.4  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00108773  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3627  methionine synthase (B12-dependent)  34.94 
 
 		 1216 aa  47  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2383  methylmalonyl-CoA mutase  29.37 
 
 		 718 aa  47.4  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22170  methylmalonyl-CoA mutase  30.95 
 
 		 754 aa  47  0.00008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.366718  normal  0.398515 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3753  methylmalonyl-CoA mutase  31.5 
 
 		 738 aa  47.4  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.801598  normal  0.879758 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2105  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  30.47 
 
 		 745 aa  47  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2294  methylmalonyl-CoA mutase  30.66 
 
 		 731 aa  47  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.895743  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0867  methylmalonyl-CoA mutase  33.61 
 
 		 709 aa  47  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.134958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1642  cobalamin B12-binding domain-containing protein  33.67 
 
 		 733 aa  47  0.00009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1578  B12-binding protein  28.57 
 
 		 134 aa  47  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.432317  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1173  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  25.98 
 
 		 1106 aa  46.2  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00593374 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2192  methylmalonyl-CoA mutase  33.61 
 
 		 709 aa  47  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.172259  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2031  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  32.97 
 
 		 1163 aa  46.6  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4573  methylmalonyl-CoA mutase  31.93 
 
 		 720 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0387  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  29.67 
 
 		 207 aa  46.6  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.682962  normal  0.201782 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2161  methylmalonyl-CoA mutase  28.57 
 
 		 723 aa  46.2  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.385791  normal  0.481947 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2127  methylmalonyl-CoA mutase  29.92 
 
 		 720 aa  46.2  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.063815  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3122  methylmalonyl-CoA mutase  30.51 
 
 		 760 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.203405  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16010  methionine synthase (B12-dependent)  35.37 
 
 		 1176 aa  46.2  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.471767  normal  0.0779461 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1468  methionine synthase  26.53 
 
 		 218 aa  46.6  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.543896  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3183  methylmalonyl-CoA mutase  30.51 
 
 		 760 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0724467 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3398  methylmalonyl-CoA mutase  33.59 
 
 		 731 aa  47  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.526303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3133  methylmalonyl-CoA mutase  30.51 
 
 		 760 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2300  methylmalonyl-CoA mutase  33.61 
 
 		 709 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3872  methylmalonyl-CoA mutase  33.33 
 
 		 740 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.231489  normal  0.125312 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3075  methylmalonyl-CoA mutase  30.77 
 
 		 714 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2472  cobalamin B12-binding domain protein  27.41 
 
 		 152 aa  46.2  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0241  cobalamin B12-binding domain protein  28.95 
 
 		 139 aa  46.2  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1574  cobalamin B12-binding domain-containing protein  29.75 
 
 		 137 aa  46.2  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0630027 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2582  Methionine synthase  29.55 
 
 		 213 aa  46.2  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.242133  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2805  methylmalonyl-CoA mutase  28.57 
 
 		 719 aa  46.2  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147831  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4260  cobalamin B12-binding domain-containing protein  30.58 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.480541 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>