More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2617 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2617  N-6 DNA methylase  100 
 
 		 673 aa  1375    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  23.88 
 
 		 950 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1902  hypothetical protein  24.09 
 
 		 404 aa  90.1  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000664391  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2778  N-6 DNA methylase  26.83 
 
 		 405 aa  88.2  5e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.63238e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  23.52 
 
 		 1041 aa  86.7  0.000000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2995  N-6 DNA methylase  23.76 
 
 		 707 aa  86.3  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00439445  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0792  hypothetical protein  23.77 
 
 		 573 aa  84.7  0.000000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1174  N-6 DNA methylase  24.92 
 
 		 493 aa  82  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0879909  normal  0.322631 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2746  type I restriction-modification system, M subunit  29.29 
 
 		 480 aa  75.5  0.000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.453882  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3672  type I restriction-modification system, M subunit  27.5 
 
 		 910 aa  72.8  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3354  type I restriction-modification system, M subunit  26.38 
 
 		 528 aa  71.6  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.501947  normal  0.0329699 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02073  type I restriction enzyme EcoEI M protein  28.8 
 
 		 489 aa  71.6  0.00000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4082  type I restriction-modification system, M subunit  26.79 
 
 		 863 aa  71.2  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5860  type I restriction-modification system, M subunit  29.95 
 
 		 493 aa  71.2  0.00000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.822857 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3006  N-6 DNA methylase  29.81 
 
 		 520 aa  71.2  0.00000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.809429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0993  Eco57I restriction endonuclease  25.49 
 
 		 595 aa  70.9  0.00000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.544878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3536  type I restriction-modification system, M subunit  27.14 
 
 		 863 aa  70.1  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2789  N-6 DNA methylase  29.19 
 
 		 532 aa  70.1  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17670  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  27.33 
 
 		 503 aa  70.1  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1539  type I restriction-modification system, M subunit  27.51 
 
 		 500 aa  69.3  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000154488  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6045  type I restriction-modification system subunit M  29.32 
 
 		 489 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0475301  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1415  N-6 DNA methylase  28.18 
 
 		 477 aa  68.9  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0877265  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0286  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  29.19 
 
 		 497 aa  68.9  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3148  N-6 DNA methylase  29.65 
 
 		 540 aa  68.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.303766 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1644  N-6 DNA methylase  29.19 
 
 		 498 aa  68.6  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3758  N-6 DNA methylase  28.99 
 
 		 511 aa  68.6  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.921564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0869  N-6 DNA methylase  24.17 
 
 		 510 aa  68.6  0.0000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3128  N-6 DNA methylase  29.81 
 
 		 518 aa  68.6  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.465456  decreased coverage  0.00982418 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  19.97 
 
 		 995 aa  67.8  0.0000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2017  N-6 DNA methylase  29.81 
 
 		 517 aa  67.8  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.54323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2149  restriction endonuclease  23.53 
 
 		 629 aa  67.4  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0865  type I restriction-modification system, M subunit  26.03 
 
 		 814 aa  67.4  0.0000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173727  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0508  type I restriction-modification system, M subunit  26.85 
 
 		 814 aa  67  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1086  type I restriction-modification system, M subunit  27.65 
 
 		 576 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2498  type I restriction-modification system, M subunit  32.04 
 
 		 488 aa  66.6  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.095428  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2743  type I restriction system adenine methylase  29.19 
 
 		 518 aa  67  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4612  N-6 DNA methylase  29.84 
 
 		 489 aa  67  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000590691 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20220  N-6 DNA methylase  29.17 
 
 		 484 aa  67  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.644983  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1133  N-6 DNA methylase  28.28 
 
 		 490 aa  66.6  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.813419  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1457  type I restriction-modification system, M subunit, putative  24.51 
 
 		 684 aa  66.2  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0877  putative type I restriction-modification system, M subunit  29.2 
 
 		 529 aa  66.2  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.528701 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3767  N-6 DNA methylase  28.4 
 
 		 564 aa  65.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1359  N-6 DNA methylase  29.2 
 
 		 529 aa  66.6  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.315285 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3155  N-6 DNA methylase  26.72 
 
 		 498 aa  66.2  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5445  methyltransferase small  22.7 
 
 		 552 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4881  type I restriction-modification system M subunit  29.95 
 
 		 489 aa  66.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.900731 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4741  type I restriction-modification system, M subunit  29.29 
 
 		 489 aa  65.9  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410686 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0019  N-6 DNA methylase  28.83 
 
 		 501 aa  65.5  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00151011 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2908  N-6 DNA methylase  27.92 
 
 		 523 aa  65.1  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1120  type I restriction-modification system specificity subunit  30.43 
 
 		 527 aa  64.7  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2863  N-6 DNA methylase  30.54 
 
 		 500 aa  64.7  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2725  N-6 DNA methylase  26.25 
 
 		 554 aa  64.7  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0353  N-6 DNA methylase  31.49 
 
 		 488 aa  64.7  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2509  site-specific DNA-methyltransferase  29.73 
 
 		 540 aa  64.7  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.642426 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1915  type I restriction-modification system, M subunit  25.18 
 
 		 853 aa  64.3  0.000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.93858  hitchhiker  0.00587021 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2793  type I restriction-modification system, M subunit  28.57 
 
 		 525 aa  63.5  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3271  putative RNA methylase  32.42 
 
 		 479 aa  63.9  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11081  normal  0.0311183 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20400  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  25.93 
 
 		 654 aa  63.2  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0518055 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4458  type I restriction-modification system, M subunit  26.43 
 
 		 863 aa  63.5  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0224  Type I restriction-modification system, M subunit  27.92 
 
 		 519 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2418  N-6 DNA methylase  28.57 
 
 		 525 aa  63.5  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.572428  normal  0.0719197 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1454  N-6 DNA methylase  26.36 
 
 		 553 aa  63.5  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.330488  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4241  N-6 DNA methylase  24.58 
 
 		 570 aa  63.5  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1130  N-6 DNA methylase  25.52 
 
 		 553 aa  63.9  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1072  type I restriction-modification system, M subunit  25.58 
 
 		 815 aa  63.2  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3178  N-6 DNA methylase  27.78 
 
 		 498 aa  62.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0125713  hitchhiker  0.0000000000157011 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0022  N-6 DNA methylase  30.26 
 
 		 495 aa  63.2  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.204705  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0039  N-6 DNA methylase  28.22 
 
 		 501 aa  62.4  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.250679  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0030  N-6 DNA methylase  30.26 
 
 		 495 aa  63.2  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0191758 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0502  N-6 DNA methylase  29.8 
 
 		 493 aa  63.2  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.173184 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0161  type I restriction-modification system, M subunit  25.16 
 
 		 506 aa  62  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01115  type I restriction-modification system, methyltransferase subunit  25.06 
 
 		 862 aa  62  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4819  N-6 DNA methylase  26.48 
 
 		 499 aa  62.4  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4931  type I restriction-modification system, M subunit  26.76 
 
 		 539 aa  62.4  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.748503  normal  0.593383 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1959  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  25.68 
 
 		 855 aa  61.6  0.00000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3192  N-6 DNA methylase  23.28 
 
 		 605 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3981  N-6 DNA methylase  26.48 
 
 		 499 aa  61.6  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.625863  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0988  N-6 DNA methylase  32.59 
 
 		 527 aa  61.6  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4162  type I restriction-modification system, M subunit  27.01 
 
 		 874 aa  61.2  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.235487 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05613  type I restriction-modification system specificity subunit  26.42 
 
 		 873 aa  61.2  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4777  N-6 DNA methylase  26.62 
 
 		 517 aa  61.2  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.797401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1940  N-6 DNA methylase  26.62 
 
 		 535 aa  61.2  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0625168  normal  0.0625802 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0032  N-6 DNA methylase  30.92 
 
 		 544 aa  60.8  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.885751  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0079  type I restriction-modification system, M subunit  26.2 
 
 		 520 aa  61.2  0.00000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4043  N-6 DNA methylase  25.1 
 
 		 824 aa  60.8  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3519  N-6 DNA methylase  22.08 
 
 		 694 aa  60.8  0.00000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0267  putative modification methyltransferase  24.26 
 
 		 524 aa  60.8  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3088  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  28.51 
 
 		 502 aa  60.8  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143322  normal  0.282714 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0005  type I restriction-modification system, M subunit  27.27 
 
 		 528 aa  60.8  0.00000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1977  N-6 DNA methylase  31.19 
 
 		 500 aa  60.8  0.00000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.850783  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1222  N-6 DNA methylase  28.66 
 
 		 519 aa  60.5  0.00000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0895  N-6 DNA methylase  28.37 
 
 		 834 aa  60.8  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0972  N-6 DNA methylase  23.29 
 
 		 911 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.91965 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2087  N-6 DNA methylase  29.19 
 
 		 509 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000122296 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2003  type I restriction-modification system, M subunit  29.47 
 
 		 537 aa  60.5  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3226  N-6 DNA methylase  25.82 
 
 		 481 aa  60.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1843  type I restriction-modification system, M subunit  25 
 
 		 554 aa  60.1  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2372  type I restriction-modification system, M subunit  29.47 
 
 		 537 aa  60.5  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.728855  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0034  N-6 DNA methylase  29.93 
 
 		 544 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966218 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3610  N-6 DNA methylase  27.78 
 
 		 500 aa  60.1  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578876  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>