More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2117 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2117  ABC transporter related  100 
 
 		 244 aa  504  9.999999999999999e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.101378  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1757  ABC transporter related protein  56.41 
 
 		 242 aa  278  7e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2598  ABC transporter, ATP-binding protein  53.62 
 
 		 241 aa  268  5e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2817  ABC transporter, ATP-binding protein  53.19 
 
 		 241 aa  266  2e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000055969 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2506  ABC transporter, ATP-binding protein  53.19 
 
 		 241 aa  266  2e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2555  ABC transporter, ATP-binding protein  52.34 
 
 		 241 aa  263  1e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.14155e-24 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2351  ABC transporter related  52.1 
 
 		 241 aa  262  3e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0357705  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2322  ABC transporter, ATP-binding protein  53.39 
 
 		 248 aa  261  4.999999999999999e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00275185  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2280  ABC transporter, ATP-binding protein  51.91 
 
 		 248 aa  259  4e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.163067  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2543  ABC transporter, ATP-binding protein  51.91 
 
 		 241 aa  258  6e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0189029  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2364  ABC transporter ATP-binding protein  51.63 
 
 		 222 aa  243  3e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2541  ABC transporter ATP-binding protein  51.63 
 
 		 222 aa  243  3e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.534953  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0260  ABC transporter, ATP-binding protein  47.66 
 
 		 238 aa  225  4e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000146773  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0738  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  46.67 
 
 		 245 aa  225  6e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.032696  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0257  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  45.26 
 
 		 248 aa  222  4e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0018  ABC transporter, ATP-binding protein  44.21 
 
 		 234 aa  214  9.999999999999999e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1264  putative ABC transporter, ATP-binding protein  44.98 
 
 		 308 aa  207  1e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000993133  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001403  ABC-type multidrug transport system ATPase component  44.54 
 
 		 308 aa  203  2e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0813  ABC transporter, ATP-binding protein  42.92 
 
 		 248 aa  202  4e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06358  ABC transporter component  45.41 
 
 		 308 aa  201  7e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3538  ABC transporter related  42.79 
 
 		 323 aa  201  8e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2641  ABC transporter related  42.98 
 
 		 346 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1367  ABC transporter related  42.86 
 
 		 254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.181085  normal  0.116332 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0874  ABC transporter related  42.86 
 
 		 313 aa  196  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.32724 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2574  ABC transporter related  42.98 
 
 		 346 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2749  ABC transporter related  42.54 
 
 		 346 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0733  ABC transporter related  41.77 
 
 		 248 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0344871  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2809  ABC transporter related  39.92 
 
 		 255 aa  196  3e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_717  ABC transporter, ATP-binding protein  42.98 
 
 		 248 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.308097  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1304  ABC transporter related  41.84 
 
 		 590 aa  195  5.000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0426  ABC transporter-related protein  43.04 
 
 		 340 aa  195  6e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3001  ABC transporter related  41.53 
 
 		 585 aa  195  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1341  ABC transporter related  45.78 
 
 		 317 aa  195  7e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4202  ABC transporter related  43.18 
 
 		 335 aa  195  7e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.933672  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3706  ABC transporter related  41.39 
 
 		 594 aa  194  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4362  ABC transporter related  40.62 
 
 		 322 aa  193  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1019  ABC transporter related  41 
 
 		 590 aa  191  6e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1523  ABC transporter related  43.24 
 
 		 318 aa  191  6e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2832  ABC transporter related  43.24 
 
 		 318 aa  191  7e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.442904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1514  ABC transporter related  43.24 
 
 		 318 aa  191  7e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1452  ABC transporter-like  40.36 
 
 		 297 aa  191  8e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218663  hitchhiker  0.00673378 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1745  ABC transporter, ATPase subunit  43.18 
 
 		 322 aa  190  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0173616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1550  ABC transporter related  43.24 
 
 		 318 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1670  ABC transporter related  42.79 
 
 		 286 aa  190  1e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0417  ABC transporter related protein  41.74 
 
 		 251 aa  189  2e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1421  ABC transporter related  42.34 
 
 		 317 aa  190  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0260  ABC transporter, ATP-binding protein  37.97 
 
 		 551 aa  190  2e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0714  hypothetical protein  39.59 
 
 		 580 aa  189  2.9999999999999997e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4163  ABC transporter related  42.73 
 
 		 323 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.417858  normal  0.351966 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3402  ABC transporter related  42.17 
 
 		 245 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.273251  normal  0.796609 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4697  ABC transporter related  41.1 
 
 		 582 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793973  normal  0.717601 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3690  ABC transporter related  42.73 
 
 		 323 aa  189  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0586  ABC transporter-related protein  40.97 
 
 		 327 aa  189  5e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.737047  hitchhiker  0.000179773 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1479  ABC transporter related protein  41.96 
 
 		 589 aa  188  7e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0696  hypothetical protein  39.59 
 
 		 580 aa  188  7e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  40.08 
 
 		 510 aa  188  8e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22040  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  44.24 
 
 		 283 aa  188  8e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0971989 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3251  ABC transporter related  40.25 
 
 		 581 aa  187  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1036  ABC transporter related  42.34 
 
 		 328 aa  186  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3588  putative ABC-type multidrug transport system, ATPase component  41.74 
 
 		 322 aa  186  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4062  ABC transporter related protein  41.05 
 
 		 583 aa  186  3e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1792  ABC transporter component  41.56 
 
 		 580 aa  186  4e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.380874  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4664  ABC transporter related  39.47 
 
 		 318 aa  185  5e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.019733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0130  ABC transporter related  40.68 
 
 		 576 aa  185  5e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  41.05 
 
 		 323 aa  185  7e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  40.61 
 
 		 320 aa  184  8e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3177  ABC transporter related  41.3 
 
 		 245 aa  184  8e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.449821 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0478  ABC transporter related  40.26 
 
 		 249 aa  184  9e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0210  ABC transporter related  38.49 
 
 		 916 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10228  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2421  ABC transporter related  39.11 
 
 		 582 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.259147  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  37.9 
 
 		 512 aa  182  3e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0578  ABC transporter related  41.55 
 
 		 238 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1328  ABC transporter-related protein  39.39 
 
 		 576 aa  182  4.0000000000000006e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0036  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.85 
 
 		 325 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03336  fused ribosome-associated ATPase: ATP-binding protein/ATP-binding protein/predicted membrane protein  37.4 
 
 		 911 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0228  ABC transporter related protein  37.4 
 
 		 911 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3775  ABC transporter, ATP binding protein  37.4 
 
 		 911 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3836  ABC transporter, ATP binding protein  37.4 
 
 		 911 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.932304  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4831  ABC transporter, ATP binding protein  37.4 
 
 		 911 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3968  ABC transporter, ATP binding protein  37.4 
 
 		 911 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03288  hypothetical protein  37.4 
 
 		 911 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3685  ABC transporter, ATP binding protein  37.4 
 
 		 911 aa  181  6e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0350  ABC transporter, ATP-binding protein  37.67 
 
 		 541 aa  182  6e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0229  ABC transporter related  37.4 
 
 		 911 aa  181  6e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4328  ABC transporter related  40.91 
 
 		 318 aa  182  6e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.786292 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5104  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.6 
 
 		 324 aa  181  6e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0010745  normal  0.559357 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2813  ABC transporter, ATP-binding protein  38.4 
 
 		 580 aa  181  8.000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2901  ABC transporter related  38.4 
 
 		 580 aa  181  8.000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3896  ABC transporter related  38.79 
 
 		 901 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.184002 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0809  ABC transporter-related protein  35.02 
 
 		 257 aa  181  1e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3790  ABC transporter related  37.24 
 
 		 912 aa  181  1e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3159  ABC transporter, 2 fused ATPase and 1 inner membrane subunits  38.79 
 
 		 901 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.827226  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0439  ABC transporter related  43.13 
 
 		 283 aa  181  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1207  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.77 
 
 		 279 aa  180  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2578  ABC transporter related protein  44.5 
 
 		 282 aa  179  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2369  ABC transporter related  39.26 
 
 		 575 aa  179  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.296305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  40.65 
 
 		 315 aa  180  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1720  ABC transporter, ATPase subunit  40.91 
 
 		 315 aa  179  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.062047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2108  ABC transporter related  38.86 
 
 		 325 aa  179  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.947862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2957  ABC transporter related  39.21 
 
 		 253 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.428203  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>