62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1922 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1922  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
400 aa  800    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0200  protein of unknown function DUF214  32.75 
 
 
400 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3474  protein of unknown function DUF214  32.99 
 
 
399 aa  199  7.999999999999999e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2006  hypothetical protein  27.83 
 
 
395 aa  136  6.0000000000000005e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.151013  normal  0.929725 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1562  hypothetical protein  27.19 
 
 
403 aa  134  3.9999999999999996e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00597787  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0166  hypothetical protein  27.38 
 
 
395 aa  129  6e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1518  permease, putative  27.38 
 
 
403 aa  123  6e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000418137  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0625  ABC-type transport system for lysophospholipase L1 biosynthesis permease  25.69 
 
 
405 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0260119  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0367  efflux ABC transporter, permease protein  28.51 
 
 
403 aa  104  2e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3893  protein of unknown function DUF214  25.24 
 
 
406 aa  92.8  9e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2015  hypothetical protein  24.04 
 
 
411 aa  75.9  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0449562 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1371  protein of unknown function DUF214  23.87 
 
 
386 aa  55.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.381039  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  23.35 
 
 
399 aa  54.7  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2195  hypothetical protein  22.58 
 
 
389 aa  53.9  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2168  protein of unknown function DUF214  22.76 
 
 
386 aa  52.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  31.41 
 
 
853 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0545  protein of unknown function DUF214  21.55 
 
 
386 aa  51.2  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  22.16 
 
 
391 aa  51.2  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  20.94 
 
 
387 aa  51.2  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1893  permease  24.24 
 
 
805 aa  50.8  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.628552  normal  0.326735 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1515  permease domain protein  21.3 
 
 
373 aa  50.1  0.00006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000964832  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3471  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.58 
 
 
893 aa  50.1  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440617  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0916  hypothetical protein  22.26 
 
 
385 aa  49.3  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  39.08 
 
 
855 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1894  permease  28.57 
 
 
802 aa  48.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.180891 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  37.37 
 
 
841 aa  47.8  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0754  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.07 
 
 
878 aa  47.8  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.535392  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  19.13 
 
 
402 aa  47.4  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0721  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.89 
 
 
410 aa  47.8  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2054  protein of unknown function DUF214  22.25 
 
 
386 aa  47.4  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.01978e-17 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  28.28 
 
 
854 aa  47.4  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1372  protein of unknown function DUF214  22.61 
 
 
378 aa  47.4  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.669142  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  21.63 
 
 
401 aa  47  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4105  protein of unknown function DUF214  23.68 
 
 
403 aa  46.6  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0276302 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1669  hypothetical protein  29.27 
 
 
421 aa  46.2  0.0009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0748  protein of unknown function DUF214  22.87 
 
 
1068 aa  46.2  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0457  protein of unknown function DUF214  27.67 
 
 
407 aa  46.2  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2846  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.88 
 
 
408 aa  45.8  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1933  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.17 
 
 
805 aa  45.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  24.31 
 
 
821 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3777  hypothetical protein  23.76 
 
 
383 aa  45.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2079  hypothetical protein  25.9 
 
 
896 aa  45.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0252842  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  24.69 
 
 
849 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1152  protein of unknown function DUF214  26.53 
 
 
833 aa  45.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3314  protein of unknown function DUF214  27.07 
 
 
806 aa  44.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1965  protein of unknown function DUF214  22.77 
 
 
449 aa  44.7  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.103284  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1553  hypothetical protein  21.15 
 
 
386 aa  45.1  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  23.01 
 
 
400 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3643  hypothetical protein  20.94 
 
 
386 aa  44.3  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0495  hypothetical protein  22.92 
 
 
397 aa  44.7  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  23.94 
 
 
409 aa  44.3  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1348  protein of unknown function DUF214  31.91 
 
 
846 aa  44.3  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0426  predicted permease  32.26 
 
 
419 aa  44.3  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01125  ABC transporter, permease protein, putative  27.01 
 
 
419 aa  44.3  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3519  protein of unknown function DUF214  23.44 
 
 
416 aa  43.9  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.225235  normal  0.132299 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1201  putative permease  26.58 
 
 
431 aa  43.9  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0390517  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4556  ABC transporter, permease  25.23 
 
 
634 aa  43.9  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  28.91 
 
 
842 aa  43.9  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02560  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  28.79 
 
 
406 aa  43.5  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000006972  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  30.56 
 
 
847 aa  43.5  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02570  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  25.75 
 
 
417 aa  43.1  0.008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000358315  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1025  protein of unknown function DUF214  26.9 
 
 
397 aa  43.1  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.347391 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>