159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1082 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1082  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  100 
 
 
225 aa  468  1.0000000000000001e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0153652  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0891  hydrolase  49.02 
 
 
214 aa  208  6e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1944  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.22 
 
 
222 aa  86.7  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2670  hydrolase  25 
 
 
224 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0163319  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2871  putative MTA/SAH nucleosidase / phosphatase  25.35 
 
 
220 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000413304 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1092  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.65 
 
 
212 aa  70.9  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2625  MTA/SAH nucleosidase, C-terminal region (5-methylthioadenosine nucleosidase/S-adenosylhomocysteine nucleosidase, C-terminal region)  25.35 
 
 
265 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000238008  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2362  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  25.35 
 
 
466 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2882  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  25.25 
 
 
219 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2594  phosphatase, C-terminal region  25 
 
 
264 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.131304  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2914  phosphatase, C- region  25 
 
 
219 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.204279  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2673  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  24.88 
 
 
459 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0852435  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2866  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  24.88 
 
 
459 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2897  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  24.53 
 
 
458 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000336981  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00363  putative hydrolase phosphatase protein  28.12 
 
 
205 aa  62.8  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0200608  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1157  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  30.37 
 
 
198 aa  61.6  0.000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3246  phosphoglycolate phosphatase  25.91 
 
 
227 aa  60.1  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.181824  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2847  phosphoglycolate phosphatase  25.91 
 
 
227 aa  60.1  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.212796  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3850  phosphoglycolate phosphatase  26.74 
 
 
252 aa  58.2  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3754  phosphoglycolate phosphatase  26.74 
 
 
252 aa  58.2  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3679  phosphoglycolate phosphatase  26.74 
 
 
252 aa  58.2  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966867  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3681  phosphoglycolate phosphatase  26.74 
 
 
252 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123155  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2832  HAD superfamily hydrolase  32.02 
 
 
211 aa  57.8  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2479  phosphoglycolate phosphatase  24.51 
 
 
228 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0669626  normal  0.547058 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3605  HAD family hydrolase  27.4 
 
 
236 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4762  HAD family hydrolase  27.4 
 
 
236 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.201991 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5953  phosphoglycolate phosphatase  25.59 
 
 
257 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0174691 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2192  phosphoglycolate phosphatase  24.07 
 
 
217 aa  56.2  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  25.83 
 
 
252 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3788  phosphoglycolate phosphatase  26.36 
 
 
252 aa  55.8  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  26.25 
 
 
252 aa  55.8  0.0000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  26.25 
 
 
252 aa  55.8  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  26.25 
 
 
252 aa  55.8  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0328  phosphoglycolate phosphatase  26.25 
 
 
252 aa  55.8  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372389  normal  0.201922 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  26.25 
 
 
252 aa  55.5  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03237  phosphoglycolate phosphatase  26.89 
 
 
252 aa  55.1  0.0000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  26.89 
 
 
252 aa  55.1  0.0000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03189  hypothetical protein  26.89 
 
 
252 aa  55.1  0.0000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5521  HAD family hydrolase  26.92 
 
 
236 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.743773 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1621  TatD-related deoxyribonuclease  27.48 
 
 
214 aa  53.5  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0243824  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2228  HAD family hydrolase  27.86 
 
 
212 aa  53.1  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.375493  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0343  phosphoglycolate phosphatase  27.43 
 
 
233 aa  53.5  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0962  haloacid dehalogenase-like hydrolase  28.71 
 
 
230 aa  53.1  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0625  HAD family hydrolase  23.86 
 
 
221 aa  52.8  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1212  hypothetical protein  26.79 
 
 
219 aa  52.8  0.000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0173059  normal  0.0170431 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0567  phosphoglycolate phosphatase  26.15 
 
 
266 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3084  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.67 
 
 
218 aa  52.8  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1102  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  29.06 
 
 
219 aa  52.8  0.000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1198  phosphoglycolate phosphatase  25.11 
 
 
223 aa  52.4  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.042458  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002270  phosphoglycolate phosphatase  29.13 
 
 
228 aa  52.4  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0414  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.51 
 
 
217 aa  52.4  0.000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0595  HAD family hydrolase  29.08 
 
 
215 aa  52  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0609  HAD family hydrolase  29.08 
 
 
215 aa  52  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3114  HAD family hydrolase  25.37 
 
 
216 aa  51.6  0.000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2003  phosphoglycolate phosphatase  31.9 
 
 
221 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.196564  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4610  phosphoglycolate phosphatase  24.77 
 
 
272 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4023  phosphoglycolate phosphatase  26.02 
 
 
227 aa  51.6  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3798  phosphoglycolate phosphatase  25.56 
 
 
253 aa  51.6  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  24.62 
 
 
214 aa  51.2  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2727  phosphoglycolate phosphatase  27.43 
 
 
227 aa  50.4  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3961  phosphoglycolate phosphatase  25.11 
 
 
232 aa  50.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.512442  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4600  phosphoglycolate phosphatase  32.79 
 
 
232 aa  50.4  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.383007  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3722  phosphoglycolate phosphatase  25.11 
 
 
232 aa  50.4  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0244843  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0230  phosphoglycolate phosphatase  25.11 
 
 
232 aa  50.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.135549  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4055  phosphoglycolate phosphatase  26.82 
 
 
234 aa  49.7  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0278697  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0265  phosphoglycolate phosphatase  28.99 
 
 
232 aa  49.7  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.210779  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1191  HAD family hydrolase  25.63 
 
 
214 aa  50.1  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3061  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.25 
 
 
216 aa  50.1  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2768  HAD family hydrolase  26.52 
 
 
237 aa  49.3  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.654297  normal  0.45248 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  25 
 
 
272 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3878  phosphoglycolate phosphatase  26.82 
 
 
234 aa  49.3  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0791  HAD family hydrolase  25 
 
 
220 aa  49.3  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226537  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  29 
 
 
226 aa  49.3  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0537  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.37 
 
 
260 aa  48.9  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2370  phosphoglycolate phosphatase  25.82 
 
 
227 aa  48.9  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1973  phosphoglycolate phosphatase  26.13 
 
 
213 aa  48.9  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.662433 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20950  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  26.87 
 
 
216 aa  48.5  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  23.61 
 
 
223 aa  48.5  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2955  phosphoglycolate phosphatase  23.91 
 
 
241 aa  48.5  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07130  predicted phosphatase  26.4 
 
 
219 aa  48.5  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.273384 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3004  phosphoglycolate phosphatase  24.35 
 
 
241 aa  48.5  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2697  phosphoglycolate phosphatase  28.71 
 
 
240 aa  48.1  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2893  phosphoglycolate phosphatase  24.35 
 
 
241 aa  48.5  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0438  phosphoglycolate phosphatase  23.91 
 
 
241 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2583  phosphoglycolate phosphatase  23.91 
 
 
241 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0957  phosphoglycolate phosphatase  23.91 
 
 
241 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.753227  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0190  phosphoglycolate phosphatase  23.91 
 
 
241 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2111  phosphoglycolate phosphatase  25.34 
 
 
228 aa  48.1  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2064  HAD superfamily hydrolase  30.95 
 
 
221 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2220  HAD superfamily hydrolase  30.95 
 
 
221 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1985  phosphoglycolate phosphatase  27.67 
 
 
223 aa  47.4  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.554471  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2248  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.95 
 
 
221 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.2381099999999995e-27 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3839  HAD-superfamily hydrolase  24.54 
 
 
220 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0865807  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2004  phosphoglycolate phosphatase  30.95 
 
 
221 aa  47  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000935232  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1932  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.71 
 
 
218 aa  47  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0209  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  22.97 
 
 
235 aa  46.6  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.415502  normal  0.0513274 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2274  phosphoglycolate phosphatase  25.65 
 
 
216 aa  46.6  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1089  phosphoglycolate phosphatase  25.11 
 
 
227 aa  47  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396739  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8278  virP  27.52 
 
 
207 aa  46.2  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  24.76 
 
 
224 aa  46.2  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>