More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0733 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0733  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 		 232 aa  480  1e-135  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0709  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.09 
 
 		 231 aa  186  3e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0503167  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0687  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.39 
 
 		 228 aa  180  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2618  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.46 
 
 		 228 aa  172  5e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0714  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.87 
 
 		 232 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3227  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 232 aa  95.9  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2750  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.14 
 
 		 222 aa  72.4  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000354449  normal  0.602467 
 
 
-
 
NC_002936  DET0299  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 247 aa  69.3  0.00000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.65 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.65 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1724  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.73 
 
 		 230 aa  68.6  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8112  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.5 
 
 		 229 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2082  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.56 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2058  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.56 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1853  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.73 
 
 		 240 aa  65.5  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4779  cAMP-regulatory protein  22.54 
 
 		 214 aa  65.1  0.0000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.345439 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2076  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.83 
 
 		 234 aa  64.7  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.398696  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2600  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.34 
 
 		 229 aa  64.3  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0103419  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0372  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.04 
 
 		 225 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2737  cAMP-regulatory protein  22.75 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1945  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.51 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1010  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 257 aa  63.5  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  19.59 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5111  cAMP-regulatory protein  22.17 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 226 aa  62.4  0.000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3945  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 240 aa  62.4  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0000374248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2775  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.68 
 
 		 232 aa  61.6  0.000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.9012  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0755  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.46 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.125698 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1123  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.23 
 
 		 220 aa  61.6  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.244021  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8981  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.96 
 
 		 222 aa  61.6  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2023  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.99 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0496812 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0454  cAMP-regulatory protein  22.54 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.993891  normal  0.32004 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002279  cyclic AMP receptor protein  21.81 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2191  cAMP-regulatory protein  22.22 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00075  cAMP-regulatory protein  21.81 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0457  cAMP-regulatory protein  22.73 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.89409  normal  0.110467 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0602  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.11 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.628877 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.34 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4277  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.35 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6276  CRP/FNR family transcriptional regulator  22.01 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.298402  normal  0.17195 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0424  cAMP-regulatory protein  21.96 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.328198  normal  0.870698 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1444  Crp/Fnr family transcriptional regulator  21.13 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.920255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3283  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.99 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7216  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.07 
 
 		 246 aa  58.9  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.726682  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  21.65 
 
 		 226 aa  58.5  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.13 
 
 		 226 aa  58.5  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  20.28 
 
 		 227 aa  58.5  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0851  CRP/FNR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0183246  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26880  cAMP-binding protein  23.29 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.452605 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2803  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0662  cAMP-regulatory protein  20.63 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000339306  hitchhiker  0.000137041 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2417  cyclic nucleotide-binding protein  22.94 
 
 		 250 aa  57  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.034588  normal  0.0382931 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0092  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.49 
 
 		 230 aa  57  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000552774  hitchhiker  0.0000198015 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0463  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.03 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.607183  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0548  cAMP-regulatory protein  23.4 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.549862  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.79 
 
 		 239 aa  57.4  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000625437  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3853  cAMP-regulatory protein  21.81 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0781  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.22 
 
 		 236 aa  57  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0113537  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0757  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.22 
 
 		 236 aa  57  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0100726  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3943  cAMP-regulatory protein  20.51 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3029  CRP/FNR family transcriptional regulator  21.2 
 
 		 228 aa  57  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0369  cAMP-regulatory protein  21.81 
 
 		 210 aa  57  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3784  cAMP-regulatory protein  21.81 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0916512  hitchhiker  0.00483948 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1465  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 236 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.342125  normal  0.439299 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4032  cAMP-regulatory protein  21.81 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.203601  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0293  cAMP-regulatory protein  21.81 
 
 		 210 aa  57  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160804  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20120  cAMP-binding protein  21.74 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00290987  normal  0.0142715 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3702  cAMP-regulatory protein  21.81 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4580  cAMP-regulatory protein  21.81 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0550419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3834  cAMP-regulatory protein  21.81 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.429858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3945  cAMP-regulatory protein  21.81 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3737  cAMP-regulatory protein  21.81 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0176942 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0248  cAMP-regulatory protein  21.81 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3663  cAMP-regulatory protein  21.81 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3771  cAMP-regulatory protein  21.81 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.275024  normal  0.523362 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3663  cAMP-regulatory protein  21.81 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.185514  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03208  DNA-binding transcriptional dual regulator  21.81 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0355  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.81 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000236327  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0345  Crp family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.254354  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3639  cAMP-regulatory protein  21.81 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000269957 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4667  cAMP-regulatory protein  21.81 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00224827  normal  0.233908 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0127  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.63 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.867755  normal  0.325855 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0355  cAMP-regulatory protein  21.81 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0526852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3554  cAMP-regulatory protein  21.81 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0106  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.34 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3733  cAMP-regulatory protein  21.81 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03160  hypothetical protein  21.81 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0202429  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3421  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.31 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0262  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.23 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2755  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  18.86 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3865  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0238  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.23 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3827  cAMP-regulatory protein  21.81 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46100  cAMP-regulatory protein  20 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3873  cAMP-regulatory protein  20.11 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000105148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4621  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.73 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0411  transcriptional regulator, Crp family  27.36 
 
 		 229 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000553573 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3725  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.38 
 
 		 237 aa  55.1  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0054318  normal  0.342144 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3550  cAMP-regulatory protein  21.81 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>