More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1413 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1413  ABC transporter related  100 
 
 		 247 aa  484  1e-136  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.139475 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  52.08 
 
 		 265 aa  204  7e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  47.6 
 
 		 264 aa  200  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  48.13 
 
 		 260 aa  199  1.9999999999999998e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  52.15 
 
 		 278 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0826  ABC transporter, ATPase subunit  49.3 
 
 		 273 aa  195  7e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.617854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  49.18 
 
 		 251 aa  194  1e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  56.35 
 
 		 264 aa  194  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  50.47 
 
 		 264 aa  191  7e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  48.31 
 
 		 263 aa  191  9e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  53.55 
 
 		 292 aa  191  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  50 
 
 		 280 aa  190  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1183  ABC transporter related  42.79 
 
 		 279 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  48.42 
 
 		 253 aa  188  8e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  47.78 
 
 		 297 aa  187  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  47.4 
 
 		 252 aa  187  1e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  47.89 
 
 		 254 aa  186  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  48.42 
 
 		 260 aa  186  2e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1433  ABC transporter related  45.45 
 
 		 292 aa  186  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.567066  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1321  ABC transporter-like protein  50.91 
 
 		 288 aa  186  4e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.251104 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  51.37 
 
 		 288 aa  185  6e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  44.3 
 
 		 278 aa  185  6e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  44.34 
 
 		 254 aa  184  9e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  51.71 
 
 		 273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  50.26 
 
 		 282 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  45.28 
 
 		 254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  44.34 
 
 		 254 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0429  ABC transporter related  46.95 
 
 		 313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0115377  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3277  translation initiation factor IF-2  44.92 
 
 		 261 aa  183  3e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00123612  normal  0.0327391 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  45.13 
 
 		 258 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2120  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  45.54 
 
 		 380 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0674614  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2434  ABC transporter related protein  51.81 
 
 		 276 aa  182  4.0000000000000006e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0618237 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0347  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.42 
 
 		 384 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.89864 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  50.52 
 
 		 271 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9277  ABC transporter, ATPase subunit  47.68 
 
 		 263 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  49.22 
 
 		 283 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3148  ABC transporter related  42.48 
 
 		 266 aa  180  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1132  ABC transporter related  47.37 
 
 		 301 aa  179  2e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  46.31 
 
 		 274 aa  179  2e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2104  ABC transporter related  42.8 
 
 		 282 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0748494  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0671  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  42.36 
 
 		 279 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299048  normal  0.328803 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2273  ABC transporter related  42.92 
 
 		 275 aa  179  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4331  alkanesulfonate ABC transporter ATP-binding protein  49.2 
 
 		 256 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5062  ABC transporter related  48.72 
 
 		 272 aa  179  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.948706 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5342  ABC transporter related  48.72 
 
 		 272 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.682879 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3796  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  50.48 
 
 		 360 aa  178  5.999999999999999e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.327654  normal  0.344897 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0762  ABC transporter related  47.47 
 
 		 278 aa  178  7e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.289343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  43.58 
 
 		 258 aa  178  7e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6359  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein  48.11 
 
 		 274 aa  178  8e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5403  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  43.3 
 
 		 380 aa  178  8e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000274828 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  45.95 
 
 		 271 aa  178  8e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4112  ABC transporter-related protein  46.12 
 
 		 311 aa  178  9e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.607237  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  44.09 
 
 		 289 aa  178  9e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  47.14 
 
 		 287 aa  177  9e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3499  ABC transporter related  47.09 
 
 		 265 aa  177  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.14517  normal  0.695761 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0284  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.75 
 
 		 380 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.688295  normal  0.586195 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  46.92 
 
 		 269 aa  177  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7050  ABC transporter related  49.52 
 
 		 356 aa  177  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4373  ABC transporter related  46.95 
 
 		 297 aa  176  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.403478  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5179  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  43.3 
 
 		 380 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4457  ABC transporter related  46.64 
 
 		 265 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0721203  normal  0.624279 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  49.48 
 
 		 271 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5239  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.3 
 
 		 380 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3229  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.29 
 
 		 408 aa  177  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0393  polyamine transport protein PotG  44.2 
 
 		 384 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5086  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.3 
 
 		 380 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.162626  normal  0.269362 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4591  ABC transporter related  46.64 
 
 		 265 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3862  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.81 
 
 		 360 aa  177  2e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000929662  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0028  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.05 
 
 		 378 aa  177  2e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0855838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1296  ABC transporter related  48.33 
 
 		 265 aa  176  2e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0036  ABC transporter, ATP-binding protein  46.88 
 
 		 265 aa  176  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03940  polyamine transport protein PotG  43.75 
 
 		 384 aa  176  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5009  ABC transporter related  48.7 
 
 		 285 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  41.98 
 
 		 254 aa  176  3e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  43.58 
 
 		 261 aa  176  3e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3524  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  41.28 
 
 		 337 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2679  ABC transporter, ATP-binding protein  46.88 
 
 		 265 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3997  ABC transporter, ATPase subunit  45.25 
 
 		 311 aa  176  4e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.734003  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1039  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  45.32 
 
 		 377 aa  176  4e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251214  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  50.27 
 
 		 272 aa  176  4e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1854  ABC transporter, ATP-binding protein  46.88 
 
 		 265 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.812783  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0039  ABC transporter, ATP-binding protein  46.88 
 
 		 265 aa  176  4e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0039  ABC transporter, ATP-binding protein  46.88 
 
 		 265 aa  176  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0252  ABC transporter, ATP-binding protein  46.88 
 
 		 288 aa  175  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.616609  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2698  ABC transporter, ATP-binding protein  46.88 
 
 		 288 aa  175  5e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3273  ABC transporter, ATP-binding protein  46.88 
 
 		 288 aa  175  5e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0232  taurine transporter ATP-binding subunit  46.31 
 
 		 262 aa  175  6e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000657345 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3061  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  38.57 
 
 		 259 aa  175  6e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00453099  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4848  Sigma 54 interacting domain protein  50.98 
 
 		 253 aa  175  6e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.627338 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3115  ABC transporter related  46.15 
 
 		 272 aa  175  6e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.200151  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16920  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  45.98 
 
 		 269 aa  175  6e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.407228  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1200  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.08 
 
 		 378 aa  175  6e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0439594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3191  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.08 
 
 		 378 aa  175  6e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00351311 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1167  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.08 
 
 		 378 aa  175  6e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0114763  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4372  ABC transporter related  50.98 
 
 		 253 aa  175  6e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.191075 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  45.67 
 
 		 246 aa  175  6e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1109  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.08 
 
 		 378 aa  175  6e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000609618  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2449  ABC transporter related  52.72 
 
 		 255 aa  175  8e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.259885 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0508  ABC transporter related  47.92 
 
 		 265 aa  175  8e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0576814 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  43.27 
 
 		 256 aa  174  8e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>