214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0488 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0488  Allergen V5/Tpx-1 related  100 
 
 
299 aa  602  1.0000000000000001e-171  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3350  Allergen V5/Tpx-1 related  47.73 
 
 
293 aa  132  6e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688686  normal  0.0178942 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3384  Allergen V5/Tpx-1-like  50 
 
 
294 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3579  hypothetical protein  48.48 
 
 
293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.38499  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3169  Allergen V5/Tpx-1 family protein  49.25 
 
 
279 aa  130  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.635999  normal  0.126682 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2104  Allergen V5/Tpx-1-like  47.83 
 
 
288 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233408  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49660  hypothetical protein  48.87 
 
 
282 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3565  hypothetical protein  47.06 
 
 
206 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.727767  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2649  hypothetical protein  49.21 
 
 
320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00790253  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001041  hypothetical protein  43.61 
 
 
179 aa  125  9e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1690  SCP-like extracellular protein  46.51 
 
 
200 aa  124  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2381  Allergen V5/Tpx-1 related  48.41 
 
 
310 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0357627 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3457  Allergen V5/Tpx-1 related  46.51 
 
 
338 aa  121  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1805  SCP-like extracellular  47.58 
 
 
222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000690986 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0219  SCP-like extracellular  53.85 
 
 
495 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2817  SCP-like extracellular  44.53 
 
 
249 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18350  hypothetical protein  45.86 
 
 
301 aa  119  4.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0167  SCP-like extracellular  50 
 
 
209 aa  118  9e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.119271  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5005  SCP-like extracellular  45.52 
 
 
254 aa  118  9e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.342918  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2424  SCP-like extracellular  44.19 
 
 
200 aa  118  9e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.572617  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4392  SCP-like extracellular  46.92 
 
 
180 aa  119  9e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2358  SCP-like extracellular  46.21 
 
 
283 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.678269  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4238  hypothetical protein  50 
 
 
282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569543  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3563  hypothetical protein  45.45 
 
 
283 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3687  SCP-like extracellular  39.74 
 
 
167 aa  116  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00687212  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2217  SCP-like extracellular  43.94 
 
 
162 aa  115  6.9999999999999995e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4591  Allergen V5/Tpx-1 family protein  46.21 
 
 
213 aa  115  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.39255  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1557  Allergen V5/Tpx-1 related  40.98 
 
 
331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  0.411468 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2211  SCP-like extracellular protein  44.7 
 
 
283 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3137  SCP-like extracellular  44.12 
 
 
286 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2482  SCP-like extracellular  43.94 
 
 
283 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.897986  normal  0.230524 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4362  Allergen V5/Tpx-1 related  50 
 
 
264 aa  109  6e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328838  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2074  SCP-like extracellular  45.11 
 
 
222 aa  109  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2270  SCP-like extracellular  45.32 
 
 
212 aa  108  8.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00083862  normal  0.0734842 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8056  hypothetical protein  42.36 
 
 
305 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1282  SCP-like extracellular  38.99 
 
 
317 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38670  uncharacterized protein with SCP/PR1 domains  43.24 
 
 
260 aa  107  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1705  Allergen V5/Tpx-1 related  44.36 
 
 
245 aa  107  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000015674  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5290  SCP-like extracellular  45.38 
 
 
211 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0827  SCP-like extracellular  37.88 
 
 
157 aa  106  4e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274249  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0268  SCP-like extracellular  40.14 
 
 
347 aa  101  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1373  hypothetical protein  38.81 
 
 
541 aa  98.2  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5956  SCP-like extracellular  38.89 
 
 
226 aa  97.4  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1016  hypothetical protein  36.84 
 
 
283 aa  97.4  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.768354  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1426  SCP-like extracellular  31.94 
 
 
328 aa  97.1  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0703  SCP/PR1 domain-containing proteins-like  35.33 
 
 
338 aa  96.7  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.501608  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0508  spore coat assembly protein SafA  39.39 
 
 
203 aa  95.5  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0051  Allergen V5/Tpx-1 family protein  36.03 
 
 
300 aa  95.5  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000168583  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2976  Allergen V5/Tpx-1 related  38.5 
 
 
334 aa  93.6  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0120131  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0445  SCP-like extracellular  36.64 
 
 
500 aa  94  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000975734  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4285  SCP-like extracellular  44.37 
 
 
296 aa  93.6  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1210  SCP-like extracellular  36.57 
 
 
276 aa  92.8  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4672  SCP-like extracellular  45.19 
 
 
458 aa  92.8  6e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.988125  normal  0.181044 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4242  Allergen V5/Tpx-1 family protein  40.6 
 
 
444 aa  92.4  7e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.152087 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1407  hypothetical protein  37.59 
 
 
275 aa  92.4  8e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1188  hypothetical protein  37.59 
 
 
263 aa  92.4  8e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0215059  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1346  hypothetical protein  37.59 
 
 
275 aa  92.4  8e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1384  hypothetical protein  37.59 
 
 
275 aa  92.4  8e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1208  hypothetical protein  37.59 
 
 
275 aa  92.4  9e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1186  hypothetical protein  37.59 
 
 
270 aa  92  9e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1306  hypothetical protein  37.59 
 
 
275 aa  92.4  9e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481179  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1448  hypothetical protein  37.59 
 
 
275 aa  92.4  9e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0851  hypothetical protein  43.88 
 
 
287 aa  91.7  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.721637  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3998  hypothetical protein  36.84 
 
 
270 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0752047 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0779  copper amine oxidase-like protein  36.36 
 
 
450 aa  89.4  6e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247024  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0081  Allergen V5/Tpx-1 family protein  37.23 
 
 
321 aa  89.4  7e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1179  SCP-like extracellular  37.5 
 
 
465 aa  89.4  7e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.249096  hitchhiker  0.000057053 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3153  Allergen V5/Tpx-1 family protein  38.52 
 
 
322 aa  89.4  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2237  SCP-like extracellular  34.59 
 
 
244 aa  89.4  8e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0728  SCP-like extracellular  39.69 
 
 
285 aa  88.2  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.416101  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8010  SCP-like extracellular  41.04 
 
 
232 aa  87.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1235  SCP-like extracellular  33.33 
 
 
399 aa  87  3e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1940  SCP-like extracellular  34.85 
 
 
242 aa  86.7  5e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0764504  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2435  SCP-like extracellular  40.95 
 
 
270 aa  86.3  6e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4411  SCP-like extracellular  41.09 
 
 
300 aa  83.6  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2043  Allergen V5/Tpx-1 related  41.24 
 
 
196 aa  83.6  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0276422  normal  0.319002 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2948  Allergen V5/Tpx-1 related  35.17 
 
 
280 aa  83.2  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0215583  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0892  SCP-like extracellular  41.18 
 
 
264 aa  82.4  0.000000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000243289 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4717  SCP-like extracellular  39.34 
 
 
197 aa  82  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.771476  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0683  SCP-like extracellular  32.45 
 
 
423 aa  82  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1582  SCP-like extracellular  37.42 
 
 
159 aa  81.3  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.71435  normal  0.283076 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1289  Allergen V5/Tpx-1 family protein  39.42 
 
 
443 aa  81.3  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.323784  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3523  Allergen V5/Tpx-1 related  38.71 
 
 
188 aa  80.1  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2711  SCP-like extracellular  41.9 
 
 
220 aa  78.6  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000599492  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2434  SCP-like extracellular  40.83 
 
 
157 aa  78.6  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0140  Allergen V5/Tpx-1 family protein  31.13 
 
 
372 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.697458  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0300  Allergen V5/Tpx-1 related  35.16 
 
 
205 aa  77  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.022059  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2640  hypothetical protein  35.61 
 
 
353 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0937186  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1399  SCP-like extracellular  30.83 
 
 
287 aa  77  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000144066  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1426  SCP-like extracellular protein  30.83 
 
 
287 aa  77  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000767316  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1463  SCP-like extracellular  33.79 
 
 
312 aa  77  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00481671 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2897  SCP-like extracellular  32.26 
 
 
279 aa  76.6  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.204847  normal  0.471797 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5831  SCP-like extracellular  36.88 
 
 
214 aa  75.9  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.529003  normal  0.937003 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2369  SCP-like extracellular  39.5 
 
 
156 aa  75.9  0.0000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3268  SCP-like extracellular  32.72 
 
 
410 aa  75.5  0.0000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0828  SCP-like extracellular  38.46 
 
 
274 aa  75.5  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000017875  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1200  hypothetical protein  33.33 
 
 
344 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1443  Allergen V5/Tpx-1 family protein  35.85 
 
 
178 aa  72.8  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.477266  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2282  Allergen V5/Tpx-1 family protein  31.67 
 
 
348 aa  72.8  0.000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3764  SCP-like extracellular  34.88 
 
 
373 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>