More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5325 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3569  ATPase, P-type (transporting), HAD superfamily, subfamily IC  44.12 
 
 		 804 aa  681    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.532443 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2482  Copper-exporting ATPase  43.55 
 
 		 799 aa  677    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.113169  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0679  E1-E2 ATPase-associated domain protein  44.63 
 
 		 797 aa  680    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.203098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1133  Cu(I)-translocating P-type ATPase  40.25 
 
 		 799 aa  652    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.710134  normal  0.817689 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5325  Copper-exporting ATPase  100 
 
 		 823 aa  1701    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0185531  normal  0.215692 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2536  copper-exporting ATPase  44.46 
 
 		 795 aa  715    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2015  heavy metal translocating P-type ATPase  29.16 
 
 		 797 aa  319  1e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.467794  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1842  heavy metal translocating P-type ATPase  31.09 
 
 		 732 aa  312  2e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21425  normal  0.57874 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1819  heavy metal translocating P-type ATPase  27.06 
 
 		 806 aa  310  8e-83  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.543484  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1274  cation-transporting ATPase lipoprotein transmembrane  28.64 
 
 		 851 aa  308  3e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2068  heavy metal translocating P-type ATPase  27.89 
 
 		 791 aa  307  7e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003472  copper-translocating P-type ATPase  29.26 
 
 		 787 aa  306  8.000000000000001e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.154282  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1990  heavy metal translocating P-type ATPase  27.85 
 
 		 807 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1790  heavy metal translocating P-type ATPase  28.16 
 
 		 815 aa  304  6.000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02298  cation transport ATPase  29 
 
 		 787 aa  301  4e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1048  cation transporter E1-E2 family ATPase  29.91 
 
 		 790 aa  301  4e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.582758  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02060  copper-translocating P-type ATPase  26.97 
 
 		 796 aa  300  5e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.600497  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2043  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  28.1 
 
 		 849 aa  300  5e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138758  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1526  heavy metal translocating P-type ATPase  29.96 
 
 		 738 aa  298  2e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2359  cation transporter E1-E2 family ATPase  28.16 
 
 		 799 aa  298  3e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2011  heavy metal translocating P-type ATPase  28.05 
 
 		 803 aa  298  3e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000954051 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2112  heavy metal translocating P-type ATPase  28.2 
 
 		 803 aa  297  4e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.237749  normal  0.362751 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1960  heavy metal translocating P-type ATPase  28.31 
 
 		 828 aa  295  2e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1964  heavy metal translocating P-type ATPase  28.39 
 
 		 803 aa  295  2e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0125075 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1195  heavy metal translocating P-type ATPase  27.32 
 
 		 847 aa  293  7e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0667  nitrogen fixation protein fixI  31.45 
 
 		 729 aa  293  8e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2994  heavy metal translocating P-type ATPase  27.06 
 
 		 838 aa  293  1e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4492  hypothetical protein  27.94 
 
 		 799 aa  290  8e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2206  heavy metal translocating P-type ATPase  27.94 
 
 		 799 aa  290  8e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.107808  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2416  cation transport ATPase  27.4 
 
 		 794 aa  289  1e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2046  heavy metal translocating P-type ATPase  27.78 
 
 		 861 aa  289  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1116  copper-translocating P-type ATPase  26.16 
 
 		 793 aa  289  2e-76  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1102  heavy metal translocating P-type ATPase  27.36 
 
 		 847 aa  288  2e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.165186  normal  0.905045 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2219  heavy metal translocating P-type ATPase  26.95 
 
 		 794 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1796  cation transporter E1-E2 family ATPase  29.4 
 
 		 795 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2215  heavy metal translocating P-type ATPase  27.81 
 
 		 799 aa  285  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.948139  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0164  heavy metal translocating P-type ATPase  26.89 
 
 		 846 aa  285  3.0000000000000004e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.914587 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2044  heavy metal translocating P-type ATPase  27.76 
 
 		 834 aa  284  4.0000000000000003e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000418772  normal  0.430312 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2219  heavy metal translocating P-type ATPase  27.78 
 
 		 799 aa  283  7.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000412933  normal  0.369074 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1450  heavy metal translocating P-type ATPase  27.51 
 
 		 792 aa  282  2e-74  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0366901  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2420  heavy metal translocating P-type ATPase  27.39 
 
 		 792 aa  282  2e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000019165  hitchhiker  0.00000435833 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1846  heavy metal translocating P-type ATPase  26.77 
 
 		 813 aa  282  2e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.418126  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1954  heavy metal translocating P-type ATPase  27.06 
 
 		 799 aa  282  2e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2165  heavy metal translocating P-type ATPase  27.68 
 
 		 799 aa  281  3e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0742745  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2538  heavy metal translocating P-type ATPase  29.59 
 
 		 727 aa  281  3e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0711  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  27.24 
 
 		 812 aa  280  6e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.139476  normal  0.239991 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0267  copper-translocating P-type ATPase  27.33 
 
 		 797 aa  278  2e-73  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.594062  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0540  heavy metal translocating P-type ATPase  31.44 
 
 		 737 aa  278  4e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0576  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  24.54 
 
 		 817 aa  276  9e-73  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.176053  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2216  heavy metal translocating P-type ATPase  26.99 
 
 		 792 aa  274  4.0000000000000004e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4956  heavy metal translocating P-type ATPase  29.5 
 
 		 761 aa  273  7e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00130227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0451  heavy metal translocating P-type ATPase  28.57 
 
 		 811 aa  272  2e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0831309  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1172  heavy metal translocating P-type ATPase  27.55 
 
 		 783 aa  271  2.9999999999999997e-71  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1607  heavy metal translocating P-type ATPase  28.32 
 
 		 824 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.183906  normal  0.0233029 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2360  heavy metal translocating P-type ATPase  27.14 
 
 		 818 aa  271  2.9999999999999997e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3324  copper-translocating P-type ATPase  27.69 
 
 		 809 aa  271  5e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0573  heavy metal translocating P-type ATPase  28 
 
 		 783 aa  271  5e-71  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.113758  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5022  heavy metal translocating P-type ATPase  29.28 
 
 		 762 aa  270  8e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29502  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1291  heavy metal translocating P-type ATPase  27.67 
 
 		 783 aa  270  1e-70  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3783  copper-translocating P-type ATPase  26.67 
 
 		 811 aa  270  1e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0413939  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0472  heavy metal translocating P-type ATPase  25.51 
 
 		 781 aa  270  1e-70  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1275  heavy metal translocating P-type ATPase  27.6 
 
 		 839 aa  269  2e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0465  heavy metal translocating P-type ATPase  29.56 
 
 		 743 aa  269  2e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0752433  normal  0.273207 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1568  putative cation-transporting ATPase  25.31 
 
 		 791 aa  268  4e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.758768  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5920  copper-translocating P-type ATPase  27.88 
 
 		 755 aa  267  5.999999999999999e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.509848 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1420  copper-translocating P-type ATPase  26.38 
 
 		 789 aa  267  5.999999999999999e-70  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19950  Copper-translocating P-type ATPase  27.07 
 
 		 800 aa  266  1e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.677512  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4261  heavy metal translocating P-type ATPase  28.07 
 
 		 882 aa  266  1e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1990  copper-translocating P-type ATPase  25.57 
 
 		 820 aa  265  2e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1816  copper-translocating P-type ATPase  26.99 
 
 		 816 aa  266  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44440  putative cation-transporting P-type ATPase  26.94 
 
 		 811 aa  264  4e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.838322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0690  copper-translocating P-type ATPase, RdxI  29.81 
 
 		 737 aa  263  1e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.247145  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1875  heavy metal translocating P-type ATPase  26.43 
 
 		 826 aa  263  1e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796141 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1177  copper-translocating P-type ATPase  27.45 
 
 		 807 aa  261  4e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0635  heavy metal translocating P-type ATPase  27.04 
 
 		 806 aa  261  4e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1874  heavy metal translocating P-type ATPase  26.79 
 
 		 819 aa  261  5.0000000000000005e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.439106  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3579  heavy metal translocating P-type ATPase  28.04 
 
 		 814 aa  260  7e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3826  heavy metal translocating P-type ATPase  27.82 
 
 		 824 aa  259  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0463  copper-translocating P-type ATPase  28.35 
 
 		 752 aa  259  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2479  putative cation transport P-type ATPase  29.13 
 
 		 765 aa  259  2e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354353  normal  0.180774 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3046  heavy metal translocating P-type ATPase  26.21 
 
 		 806 aa  258  3e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0357  nitrogen fixation protein FixI, putative  28.21 
 
 		 752 aa  258  3e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1231  heavy metal translocating P-type ATPase  26.41 
 
 		 806 aa  257  5e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3851  heavy metal translocating P-type ATPase  28.77 
 
 		 731 aa  257  7e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2610  heavy metal translocating P-type ATPase  26.5 
 
 		 802 aa  256  8e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.116821  normal  0.696286 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2345  heavy metal translocating P-type ATPase  29.89 
 
 		 737 aa  256  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.289685  normal  0.231434 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2393  nitrogen fixation protein FixI  26.99 
 
 		 787 aa  255  2.0000000000000002e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1996  copper-translocating P-type ATPase  26.18 
 
 		 823 aa  254  5.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369514  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3421  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  26.71 
 
 		 824 aa  251  3e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0860043 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1365  heavy metal translocating P-type ATPase  27.53 
 
 		 810 aa  251  3e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.576345 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1155  heavy metal translocating P-type ATPase  27.08 
 
 		 728 aa  250  8e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.302273  normal  0.0837932 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1369  heavy metal translocating P-type ATPase  25.84 
 
 		 814 aa  249  2e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2255  heavy metal translocating P-type ATPase  27.93 
 
 		 746 aa  249  2e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0014  copper-translocating P-type ATPase  25.9 
 
 		 732 aa  248  3e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.190643  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1576  heavy metal translocating P-type ATPase  26.79 
 
 		 807 aa  247  6.999999999999999e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0736  copper-translocating P-type ATPase  26.74 
 
 		 731 aa  247  8e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5929  copper-translocating P-type ATPase  27.51 
 
 		 757 aa  246  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.711138 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1237  heavy metal translocating P-type ATPase  27.72 
 
 		 807 aa  245  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0934  heavy metal translocating P-type ATPase  24.5 
 
 		 802 aa  244  5e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.701132  normal  0.512838 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0805  copper-translocating P-type ATPase  28.18 
 
 		 831 aa  243  1e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.366424  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>