More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0644 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011772  BCG9842_B2130  phosphoenolpyruvate synthase  60.32 
 
 		 868 aa  1100    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3137  phosphoenolpyruvate synthase  61.37 
 
 		 868 aa  1119    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2899  phosphoenolpyruvate synthase  61.53 
 
 		 868 aa  1115    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.407068  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2868  phosphoenolpyruvate synthase  61.41 
 
 		 868 aa  1114    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.424665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2825  phosphoenolpyruvate synthase  61.39 
 
 		 869 aa  1097    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3108  phosphoenolpyruvate synthase  60.56 
 
 		 868 aa  1105    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.721717  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4939  phosphoenolpyruvate synthase  60.32 
 
 		 865 aa  1056    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0930681 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3264  phosphoenolpyruvate synthase  44.02 
 
 		 890 aa  723    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000174113  normal  0.320272 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2960  phosphoenolpyruvate synthase  57.72 
 
 		 866 aa  1044    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000180391 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3116  phosphoenolpyruvate synthase  61.53 
 
 		 868 aa  1115    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3119  phosphoenolpyruvate synthase  61.04 
 
 		 869 aa  1106    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0620  phosphoenolpyruvate synthase  55.09 
 
 		 842 aa  934    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1951  phosphoenolpyruvate synthase  55.7 
 
 		 871 aa  994    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3294  phosphoenolpyruvate synthase  44.55 
 
 		 837 aa  661    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3140  phosphoenolpyruvate synthase  61.37 
 
 		 868 aa  1101    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.103594  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0644  phosphoenolpyruvate synthase  100 
 
 		 870 aa  1786    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0824821 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2894  phosphoenolpyruvate synthase  60.49 
 
 		 868 aa  1107    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.497322  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2728  phosphoenolpyruvate synthase  56.37 
 
 		 874 aa  1007    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.336193 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3580  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  37.72 
 
 		 887 aa  598  1e-169  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1117  phosphoenolpyruvate synthase  37.44 
 
 		 891 aa  575  1.0000000000000001e-162  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0751  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  33.92 
 
 		 887 aa  474  1e-132  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0402174 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0508  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  35.49 
 
 		 903 aa  462  9.999999999999999e-129  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.93502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5613  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  35.37 
 
 		 873 aa  447  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.650843  normal  0.554799 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0384  phosphoenolpyruvate synthase  35.31 
 
 		 907 aa  429  1e-119  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0174  phosphoenolpyruvate synthase  57.45 
 
 		 341 aa  393  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.466875  normal  0.4987 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0605  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  33.3 
 
 		 950 aa  393  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206316 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1713  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  34.21 
 
 		 867 aa  369  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0623992  normal  0.0493713 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4777  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  32.3 
 
 		 821 aa  328  3e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2632  pyruvate, water dikinase  30.9 
 
 		 886 aa  319  1e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1157  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  31.62 
 
 		 869 aa  313  9e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5062  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  31.16 
 
 		 840 aa  313  1e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2649  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  28.27 
 
 		 884 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2857  phosphoenolpyruvate synthase  29.51 
 
 		 892 aa  281  3e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321665  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3844  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  28.68 
 
 		 889 aa  277  6e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1894  Phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase-like protein  39.2 
 
 		 971 aa  273  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2573  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  43.75 
 
 		 835 aa  242  2e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  45.51 
 
 		 781 aa  242  2e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1622  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  43.65 
 
 		 891 aa  242  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1544  phosphoenolpyruvate synthase  41.21 
 
 		 758 aa  243  2e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00247245  hitchhiker  0.0000582812 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  42.9 
 
 		 754 aa  240  8e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  44.44 
 
 		 782 aa  235  3e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3918  Pyruvate, water dikinase  28.52 
 
 		 842 aa  232  3e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3805  Pyruvate, water dikinase  28.52 
 
 		 842 aa  232  3e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.294309 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2079  phosphoenolpyruvate synthase  40.8 
 
 		 761 aa  228  3e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12720  phosphoenolpyruvate synthase  41.48 
 
 		 764 aa  228  3e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1849  phosphoenolpyruvate synthase  40.13 
 
 		 762 aa  228  4e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0349  phosphoenolpyruvate synthase, putative  40.19 
 
 		 825 aa  228  5.0000000000000005e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  40.74 
 
 		 758 aa  227  7e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0474  pyruvate, water dikinase  37.36 
 
 		 906 aa  225  3e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.247096  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  40.12 
 
 		 758 aa  224  8e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  40.45 
 
 		 769 aa  223  9.999999999999999e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2610  phosphoenolpyruvate synthase  41.47 
 
 		 762 aa  223  9.999999999999999e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0529  phosphoenolpyruvate synthase  40.74 
 
 		 758 aa  221  3.9999999999999997e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746686  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0588  phosphoenolpyruvate synthase  41.67 
 
 		 824 aa  219  1e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2598  phosphoenolpyruvate synthase  42.67 
 
 		 785 aa  219  2e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0592  phosphoenolpyruvate synthase  40.81 
 
 		 788 aa  218  2.9999999999999998e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.245818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  37.7 
 
 		 757 aa  218  5e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5551  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding protein  36.15 
 
 		 826 aa  217  9e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0952263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1888  phosphoenolpyruvate synthase  38.24 
 
 		 809 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2165  phosphoenolpyruvate synthase  37.58 
 
 		 761 aa  215  2.9999999999999995e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1204  phosphoenolpyruvate synthase  38.51 
 
 		 810 aa  215  3.9999999999999995e-54  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.490144 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3169  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  44.19 
 
 		 852 aa  214  5.999999999999999e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.486845  hitchhiker  0.0000002594 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3615  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  41.11 
 
 		 902 aa  214  7e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  37.05 
 
 		 758 aa  213  1e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4402  phosphoenolpyruvate synthase  41.35 
 
 		 799 aa  212  2e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0801  phosphoenolpyruvate synthase  41.72 
 
 		 780 aa  212  3e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4720  phosphoenolpyruvate synthase  41.08 
 
 		 785 aa  212  3e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.878278  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  37.38 
 
 		 758 aa  211  5e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0346  phosphoenolpyruvate synthase  38.03 
 
 		 758 aa  211  5e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000716638 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3829  phosphoenolpyruvate synthase  41.64 
 
 		 760 aa  210  1e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.424859  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6941  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  41.61 
 
 		 810 aa  210  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.951528  normal  0.75146 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4240  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  39.94 
 
 		 302 aa  209  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2428  phosphoenolpyruvate synthase  39.32 
 
 		 786 aa  206  1e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1445  phosphoenolpyruvate synthase  36.25 
 
 		 812 aa  207  1e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.123077 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2997  phosphoenolpyruvate synthase  42.09 
 
 		 760 aa  206  2e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.804311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0313  phosphoenolpyruvate synthase  36.88 
 
 		 809 aa  205  3e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1382  phosphoenolpyruvate synthase  38.86 
 
 		 796 aa  204  5e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.446776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2050  phosphoenolpyruvate synthase  38.18 
 
 		 801 aa  202  3e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.112575  normal  0.511905 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1583  phosphoenolpyruvate synthase  37.65 
 
 		 805 aa  201  6e-50  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000580674  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3841  phosphoenolpyruvate synthase  39.77 
 
 		 819 aa  200  7.999999999999999e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2101  pyruvate phosphate dikinase, PEP/pyruvate-binding  39.03 
 
 		 382 aa  200  7.999999999999999e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1291  phosphoenolpyruvate synthase  39.63 
 
 		 803 aa  200  9e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4209  phosphoenolpyruvate synthase  38.44 
 
 		 825 aa  199  1.0000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.390448 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1816  phosphoenolpyruvate synthase  38.55 
 
 		 797 aa  199  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  37.85 
 
 		 779 aa  199  2.0000000000000003e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1521  phosphoenolpyruvate synthase  38.36 
 
 		 784 aa  198  4.0000000000000005e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0667373 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1995  pyruvate, water dikinase  39.48 
 
 		 359 aa  197  8.000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0783818  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0121  phosphoenolpyruvate synthase  38.92 
 
 		 800 aa  197  9e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2644  phosphoenolpyruvate synthase  39.31 
 
 		 789 aa  196  1e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2845  phosphoenolpyruvate synthase  38.27 
 
 		 805 aa  196  1e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000642481  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2243  phosphoenolpyruvate synthase  39.31 
 
 		 789 aa  195  3e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0079831  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0621  phosphoenolpyruvate synthase  39.01 
 
 		 793 aa  195  3e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.200642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2435  phosphoenolpyruvate synthase  38.36 
 
 		 798 aa  194  4e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1863  phosphoenolpyruvate synthase  38.99 
 
 		 789 aa  194  6e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0183397  hitchhiker  0.0000000630455 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1592  phosphoenolpyruvate synthase  38.36 
 
 		 789 aa  194  6e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000471516  normal  0.38574 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1736  phosphoenolpyruvate synthase  38.36 
 
 		 789 aa  194  6e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00335783  normal  0.358822 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3966  phosphoenolpyruvate synthase  35.93 
 
 		 793 aa  194  7e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2009  phosphoenolpyruvate synthase  38.1 
 
 		 791 aa  194  8e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000127973  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2601  phosphoenolpyruvate synthase  38.99 
 
 		 789 aa  194  8e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000925203  normal  0.0344247 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2488  phosphoenolpyruvate synthase  38.99 
 
 		 789 aa  194  8e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.172291  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>