More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1267 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1267  peptidase  100 
 
 		 394 aa  809    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0260  peptidase  63.45 
 
 		 394 aa  505  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1500  peptidase  59.03 
 
 		 394 aa  491  1e-137  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2961  peptidase  58.02 
 
 		 395 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0710  peptidase  54.85 
 
 		 394 aa  436  1e-121  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00268178  normal  0.0281992 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4537  peptidase  39.68 
 
 		 386 aa  256  5e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.468696  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0117  peptidase  33.67 
 
 		 401 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1646  peptidase  31.22 
 
 		 401 aa  194  2e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.017723 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0424  M20/DapE family protein YgeY  33.68 
 
 		 413 aa  184  3e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1729  peptidase  31.57 
 
 		 400 aa  181  2.9999999999999997e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02705  hypothetical protein  33.51 
 
 		 403 aa  177  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0820  M20/DapE family protein YgeY  33.51 
 
 		 403 aa  177  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3005  peptidase  33.51 
 
 		 403 aa  177  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0836  peptidase  33.51 
 
 		 403 aa  177  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4162  peptidase  33.51 
 
 		 403 aa  177  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3197  peptidase  33.51 
 
 		 403 aa  178  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3032  peptidase  33.51 
 
 		 403 aa  177  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02667  hypothetical protein  33.51 
 
 		 402 aa  177  3e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1663  M20/DapE family protein YgeY  29.54 
 
 		 436 aa  158  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0240  peptidase  29.91 
 
 		 460 aa  157  3e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.0000000787577  normal  0.24947 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2652  M20/DapE family protein YgeY  28.1 
 
 		 443 aa  154  2e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0255  peptidase M20  27.44 
 
 		 402 aa  149  6e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1432  peptidase  27.02 
 
 		 445 aa  140  4.999999999999999e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  30.61 
 
 		 412 aa  128  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2049  acetylornithine deacetylase  29.57 
 
 		 416 aa  123  5e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.686913 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4508  acetylornithine deacetylase  28.65 
 
 		 374 aa  119  9e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1877  acetylornithine deacetylase  29.09 
 
 		 404 aa  114  3e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1762  acetylornithine deacetylase  27.85 
 
 		 411 aa  113  7.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2278  acetylornithine deacetylase  25.36 
 
 		 422 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4005  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.08 
 
 		 400 aa  112  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.360154  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3045  acetylornithine deacetylase  25.65 
 
 		 422 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2115  acetylornithine deacetylase  26.09 
 
 		 422 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.496864  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2331  acetylornithine deacetylase  26.06 
 
 		 422 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.055832  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2405  acetylornithine deacetylase  25.82 
 
 		 422 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.741155  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0991  acetylornithine deacetylase  24.34 
 
 		 402 aa  108  2e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.032504  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2142  acetylornithine deacetylase  25.58 
 
 		 422 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0818142  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2080  acetylornithine deacetylase  25.58 
 
 		 422 aa  107  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2297  acetylornithine deacetylase  25.58 
 
 		 422 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2386  acetylornithine deacetylase (ArgE)  27.89 
 
 		 402 aa  107  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1854  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.94 
 
 		 396 aa  107  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000102296  normal  0.0130262 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2076  acetylornithine deacetylase  25.59 
 
 		 422 aa  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0201  acetylornithine deacetylase  26 
 
 		 386 aa  105  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000604653  normal  0.090573 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2322  acetylornithine deacetylase  25.35 
 
 		 422 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2607  acetylornithine deacetylase ArgE  26.32 
 
 		 379 aa  105  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000028311  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3753  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.93 
 
 		 387 aa  105  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2475  acetylornithine deacetylase  27.97 
 
 		 420 aa  104  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0713768  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5675  acetylornithine deacetylase  27.25 
 
 		 376 aa  103  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2918  peptidase M20  27.89 
 
 		 389 aa  103  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3695  acetylornithine deacetylase  30.71 
 
 		 364 aa  103  8e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1685  acetylornithine deacetylase  24.13 
 
 		 422 aa  102  9e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.56308  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0094  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.62 
 
 		 433 aa  102  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.713156  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0012  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  33.69 
 
 		 379 aa  101  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1544  acetylornithine deacetylase  28.11 
 
 		 374 aa  102  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.88458  normal  0.449301 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5407  acetylornithine deacetylase  26.23 
 
 		 387 aa  100  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532883  normal  0.0112485 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2789  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.82 
 
 		 380 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.345284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3116  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30 
 
 		 395 aa  100  5e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.210379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3430  peptidase M20  31.5 
 
 		 364 aa  100  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3558  acetylornithine deacetylase  29.28 
 
 		 387 aa  99.8  7e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0255  acetylornithine deacetylase  25.58 
 
 		 383 aa  99.8  8e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2747  acetylornithine deacetylase (ArgE)  27.66 
 
 		 400 aa  99.4  9e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0048  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  33.59 
 
 		 380 aa  99  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0256  acetylornithine deacetylase  25.13 
 
 		 385 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0150  acetylornithine deacetylase  25.73 
 
 		 385 aa  99  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1128  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.5 
 
 		 380 aa  99  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0226  acetylornithine deacetylase  25.94 
 
 		 383 aa  99  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.417629  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1104  acetylornithine deacetylase  23.99 
 
 		 391 aa  98.6  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.681147 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1758  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.42 
 
 		 439 aa  97.8  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1622  peptidase M20  26.9 
 
 		 368 aa  97.8  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0404  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.42 
 
 		 423 aa  97.8  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5605  acetylornithine deacetylase  29.85 
 
 		 374 aa  97.1  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227908  normal  0.344951 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6551  peptidase M20  26.32 
 
 		 354 aa  97.1  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.46 
 
 		 413 aa  97.1  6e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0770776 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01583  acetylornithine deacetylase, hypothetical (Eurofung)  24.22 
 
 		 393 aa  96.3  8e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0352078 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3112  acetylornithine deacetylase (ArgE)  26.93 
 
 		 400 aa  96.3  9e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.593604  normal  0.915795 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3411  acetylornithine deacetylase  27.13 
 
 		 406 aa  96.3  9e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0287  peptidase M20  29.12 
 
 		 373 aa  96.3  9e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4496  acetylornithine deacetylase  28.38 
 
 		 383 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.815882  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2203  acetylornithine deacetylase  26.89 
 
 		 386 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6994  acetylornithine deacetylase  27.33 
 
 		 387 aa  95.5  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.277721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0377  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.8 
 
 		 389 aa  95.5  2e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000963652  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0983  acetylornithine deacetylase  26.79 
 
 		 381 aa  95.1  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4425  acetylornithine deacetylase  28.53 
 
 		 375 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.779793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4782  acetylornithine deacetylase  29.19 
 
 		 381 aa  95.1  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142352 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0328  acetylornithine deacetylase  26.93 
 
 		 383 aa  94.7  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1541  peptidase M20  26.96 
 
 		 380 aa  94.4  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0030  acetylornithine deacetylase  23.28 
 
 		 446 aa  94.4  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2494  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.34 
 
 		 423 aa  94  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3571  acetylornithine deacetylase  26.98 
 
 		 391 aa  94  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4061  acetylornithine deacetylase  27.14 
 
 		 383 aa  94.4  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4404  acetylornithine deacetylase  28.38 
 
 		 383 aa  93.6  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.268381 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2769  peptidase M20  28.12 
 
 		 399 aa  93.6  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.728292  normal  0.0329756 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4562  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.8 
 
 		 388 aa  93.6  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4252  acetylornithine deacetylase  28.44 
 
 		 383 aa  93.6  6e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.167911  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4203  peptidase M20  26.79 
 
 		 360 aa  93.6  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0267175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4337  peptidase M20  27.37 
 
 		 379 aa  93.2  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7082  acetylornithine deacetylase  27.03 
 
 		 387 aa  93.2  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0793838 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0350  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.28 
 
 		 385 aa  93.2  7e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.306111  normal  0.0744523 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0783  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.35 
 
 		 435 aa  93.2  8e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2321  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  24.82 
 
 		 424 aa  92.4  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.665958  normal  0.0430362 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0445  acetylornithine deacetylase  23.82 
 
 		 390 aa  92.4  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>