More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3631 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03075  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with ArcA  74.2 
 
 		 778 aa  1166    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0497  multi-sensor hybrid histidine kinase  74.2 
 
 		 778 aa  1166    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2560  aerobic respiration control sensor protein ArcB  57.4 
 
 		 788 aa  899    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1126  aerobic respiration control sensor protein ArcB  78.56 
 
 		 778 aa  1228    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3590  aerobic respiration control sensor protein ArcB  74.45 
 
 		 778 aa  1172    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.571349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3645  aerobic respiration control sensor protein ArcB  75.32 
 
 		 777 aa  1173    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0208563  normal  0.35837 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3698  aerobic respiration control sensor protein ArcB  74.2 
 
 		 778 aa  1166    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4342  aerobic respiration control sensor protein ArcB  80.23 
 
 		 779 aa  1254    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.108005 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3688  aerobic respiration control sensor protein ArcB  74.45 
 
 		 778 aa  1172    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.739542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0469  aerobic respiration control sensor protein ArcB  78.69 
 
 		 778 aa  1229    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.55831  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00931  aerobic respiration control sensor protein ArcB  58.12 
 
 		 786 aa  906    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3521  aerobic respiration control sensor protein ArcB  74.58 
 
 		 778 aa  1175    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0307  aerobic respiration control sensor protein ArcB  82.74 
 
 		 789 aa  1321    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0739851  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3626  aerobic respiration control sensor protein ArcB  74.33 
 
 		 778 aa  1171    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.10996  normal  0.809738 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3506  aerobic respiration control sensor protein ArcB  74.2 
 
 		 778 aa  1166    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.648174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0533  aerobic respiration control sensor protein ArcB  78.56 
 
 		 778 aa  1228    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0807351  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0490  aerobic respiration control sensor protein ArcB  74.2 
 
 		 778 aa  1166    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.512879 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3560  aerobic respiration control sensor protein ArcB  74.2 
 
 		 778 aa  1166    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0301  aerobic respiration control sensor protein ArcB  82.61 
 
 		 789 aa  1299    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0737861  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0924  aerobic respiration control sensor protein ArcB  46.05 
 
 		 753 aa  696    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.178911  normal  0.270801 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3519  aerobic respiration control sensor protein ArcB  74.45 
 
 		 778 aa  1172    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004463  aerobic respiration control sensor protein ArcB  58.47 
 
 		 784 aa  909    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.135915  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3747  aerobic respiration control sensor protein ArcB  44.77 
 
 		 781 aa  665    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.244728  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1948  aerobic respiration control sensor protein ArcB  57.58 
 
 		 785 aa  889    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000151303  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01633  aerobic respiration control sensor protein ArcB  43.97 
 
 		 784 aa  664    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4533  aerobic respiration control sensor protein ArcB  74.2 
 
 		 778 aa  1165    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03026  hypothetical protein  74.2 
 
 		 778 aa  1166    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3789  aerobic respiration control sensor protein ArcB  89.35 
 
 		 779 aa  1395    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00874982  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3631  aerobic respiration control sensor protein ArcB  100 
 
 		 779 aa  1587    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.330412  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3403  aerobic respiration control sensor protein ArcB  74.2 
 
 		 778 aa  1167    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0402  sensor histidine kinase  45.28 
 
 		 618 aa  424  1e-117  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.928095  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1794  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.36 
 
 		 965 aa  308  2.0000000000000002e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0332193  normal  0.80092 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.09 
 
 		 1199 aa  300  9e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.52 
 
 		 1177 aa  284  4.0000000000000003e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2784  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.23 
 
 		 1222 aa  276  1.0000000000000001e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0520121 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0648  sensor protein TorS  33.59 
 
 		 984 aa  271  2.9999999999999997e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.94 
 
 		 882 aa  271  4e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1451  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.96 
 
 		 877 aa  266  8e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3312  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.19 
 
 		 1226 aa  265  3e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5761  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.72 
 
 		 1204 aa  263  1e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.122146 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4904  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.57 
 
 		 873 aa  259  1e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.683005  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  31.36 
 
 		 982 aa  258  3e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0342  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.31 
 
 		 827 aa  258  4e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3030  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.45 
 
 		 1596 aa  258  4e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010791 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.64 
 
 		 1350 aa  257  6e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.34 
 
 		 1165 aa  256  8e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.28 
 
 		 916 aa  256  1.0000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0232  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.77 
 
 		 1116 aa  255  2.0000000000000002e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1441  PAS  31.98 
 
 		 794 aa  254  3e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3549  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.36 
 
 		 982 aa  253  7e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.288363 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.51 
 
 		 827 aa  253  1e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5184  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.95 
 
 		 939 aa  252  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584953  normal  0.0776559 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2934  PAS  33.33 
 
 		 955 aa  251  4e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000914767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000317  sensor protein TorS  32.58 
 
 		 987 aa  249  1e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.598131  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4076  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.19 
 
 		 876 aa  247  6e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2504  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.52 
 
 		 1132 aa  247  6.999999999999999e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3044  DMSO/TMAO-sensor hybrid histidine kinase  35.83 
 
 		 813 aa  247  8e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.53 
 
 		 902 aa  246  9.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0219  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.92 
 
 		 1452 aa  246  9.999999999999999e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.29 
 
 		 1127 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1153  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.4 
 
 		 1143 aa  246  9.999999999999999e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648529  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.55 
 
 		 738 aa  246  9.999999999999999e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.05 
 
 		 1313 aa  245  1.9999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4224  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.14 
 
 		 877 aa  244  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.249922 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2101  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.82 
 
 		 678 aa  244  3.9999999999999997e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.007905  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3479  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.46 
 
 		 1078 aa  244  5e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2955  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.35 
 
 		 764 aa  243  9e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3431  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.98 
 
 		 756 aa  243  1e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0565  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.07 
 
 		 947 aa  242  2e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.42 
 
 		 817 aa  242  2e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.29 
 
 		 1433 aa  242  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000984  signal transduction histidine kinase  37.22 
 
 		 631 aa  241  2.9999999999999997e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0748  putative aerobic respiration control sensor protein arcB  31.04 
 
 		 630 aa  241  2.9999999999999997e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000795042  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0057  histidine kinase  35.22 
 
 		 588 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000185994 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0645  two component system histidine kinase  30.84 
 
 		 630 aa  241  2.9999999999999997e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000209128  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06119  histidine kinase  32.41 
 
 		 985 aa  241  5e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0065  histidine kinase  36.03 
 
 		 578 aa  240  5.999999999999999e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  38.82 
 
 		 882 aa  240  9e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3325  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.91 
 
 		 667 aa  240  9e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1342  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.03 
 
 		 944 aa  240  9e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3445  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.21 
 
 		 717 aa  239  1e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1989  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.02 
 
 		 1195 aa  238  2e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4086  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  36.5 
 
 		 631 aa  239  2e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.58 
 
 		 785 aa  238  3e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4427  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.95 
 
 		 772 aa  238  4e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3207  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.51 
 
 		 910 aa  237  7e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1987  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.08 
 
 		 767 aa  237  8e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3783  histidine kinase  36.8 
 
 		 737 aa  236  9e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18481  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  33.53 
 
 		 968 aa  236  1.0000000000000001e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3753  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.41 
 
 		 913 aa  236  1.0000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0468324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2249  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.14 
 
 		 1143 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.673162  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0244  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.71 
 
 		 1066 aa  235  3e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.31 
 
 		 969 aa  235  3e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0393x  response regulator, histidine kinase  28.34 
 
 		 943 aa  234  5e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.621999  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1062  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.46 
 
 		 695 aa  234  5e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02206  hypothetical protein  31.34 
 
 		 827 aa  234  6e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0144  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.21 
 
 		 1009 aa  233  8.000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162275  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1873  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.12 
 
 		 923 aa  233  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.689502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3366  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.95 
 
 		 762 aa  233  1e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3051  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.16 
 
 		 947 aa  232  2e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>