More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3167 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3239  major facilitator superfamily MFS_1  83.33 
 
 		 397 aa  681    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3167  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 400 aa  792    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0813  major facilitator superfamily MFS_1  74.31 
 
 		 397 aa  613  9.999999999999999e-175  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1042  major facilitator superfamily MFS_1  74.49 
 
 		 397 aa  604  9.999999999999999e-173  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2339  major facilitator transporter  67.51 
 
 		 406 aa  563  1.0000000000000001e-159  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0304665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0852  major facilitator transporter  66.5 
 
 		 410 aa  545  1e-154  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.133449 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0436  major facilitator superfamily MFS_1  66.93 
 
 		 403 aa  516  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.263395  normal  0.769414 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0424  major facilitator superfamily MFS_1  66.93 
 
 		 403 aa  516  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.477286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0418  major facilitator superfamily MFS_1  67.18 
 
 		 403 aa  517  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0478  major facilitator superfamily transporter  67.18 
 
 		 403 aa  517  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1882  major facilitator transporter  58.63 
 
 		 411 aa  469  1.0000000000000001e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123167  hitchhiker  0.000918142 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2077  drug efflux system protein MdtG  60.77 
 
 		 408 aa  458  9.999999999999999e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.894184 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01049  predicted drug efflux system  60.51 
 
 		 408 aa  457  1e-127  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.256191  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2593  major facilitator superfamily MFS_1  60.51 
 
 		 408 aa  457  1e-127  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.288035  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01057  hypothetical protein  60.51 
 
 		 408 aa  457  1e-127  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.276646  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2547  drug efflux system protein MdtG  60.51 
 
 		 408 aa  457  1e-127  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0112458  normal  0.379099 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1174  drug efflux system protein MdtG  60.51 
 
 		 408 aa  457  1e-127  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.571838  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1175  drug efflux system protein MdtG  60.36 
 
 		 409 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.504278  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2219  drug efflux system protein MdtG  62.05 
 
 		 404 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1250  drug efflux system protein MdtG  61.79 
 
 		 404 aa  440  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.955403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1265  drug efflux system protein MdtG  61.54 
 
 		 404 aa  438  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1221  drug efflux system protein MdtG  61.54 
 
 		 404 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2035  drug efflux system protein MdtG  61.79 
 
 		 404 aa  440  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0509  major facilitator superfamily permease  50.79 
 
 		 403 aa  376  1e-103  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1716  major facilitator transporter  47.53 
 
 		 410 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354748  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1455  major facilitator transporter  48.45 
 
 		 404 aa  361  1e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1368  major facilitator superfamily permease  46.74 
 
 		 402 aa  360  2e-98  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0127  major facilitator superfamily permease  46.51 
 
 		 398 aa  347  1e-94  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0361045  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1896  major facilitator family transporter  48.96 
 
 		 404 aa  338  9e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1859  major facilitator family transporter  48.05 
 
 		 404 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.757692  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1943  major facilitator family transporter  48.7 
 
 		 404 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1974  major facilitator family transporter  48.7 
 
 		 404 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1722  major facilitator family transporter  48.7 
 
 		 404 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.636951  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1699  multidrug resistance protein B  48.7 
 
 		 404 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1674  multidrug resistance protein B  48.7 
 
 		 404 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1858  major facilitator family transporter  48.7 
 
 		 404 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.817955  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0693  major facilitator superfamily permease  45.43 
 
 		 405 aa  337  1.9999999999999998e-91  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.883245  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0169  major facilitator superfamily permease  44.81 
 
 		 411 aa  336  3.9999999999999995e-91  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3483  major facilitator family transporter  48.45 
 
 		 404 aa  335  9e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1645  major facilitator superfamily permease  44.05 
 
 		 409 aa  328  9e-89  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2776  major facilitator superfamily MFS_1  43.75 
 
 		 406 aa  325  6e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00570116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1774  major facilitator superfamily permease  44.06 
 
 		 404 aa  323  4e-87  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179467 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1478  major facilitator superfamily MFS_1  42.23 
 
 		 399 aa  318  1e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.311538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1079  major facilitator transporter  42.45 
 
 		 407 aa  308  1.0000000000000001e-82  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000078531  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3953  major facilitator transporter  42.16 
 
 		 431 aa  299  5e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.690116  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00896  transport transmembrane protein  42.15 
 
 		 406 aa  294  2e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0726  putative multidrug resistance protein  42.3 
 
 		 487 aa  294  2e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0960  major facilitator superfamily MFS_1  42.78 
 
 		 413 aa  293  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0840  major facilitator superfamily MFS_1  43.04 
 
 		 413 aa  293  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1351  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  41.56 
 
 		 416 aa  292  7e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0854503  normal  0.0233504 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1485  multi-drug resistance protein  44.76 
 
 		 389 aa  281  2e-74  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00168356  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6746  major facilitator superfamily MFS_1  39.43 
 
 		 423 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6539  major facilitator transporter  38.18 
 
 		 420 aa  264  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.516365  normal  0.497614 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4868  major facilitator transporter  39.58 
 
 		 418 aa  256  4e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.174951 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1917  major facilitator family transporter  42.34 
 
 		 415 aa  256  7e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.405488  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4118  major facilitator transporter  37.43 
 
 		 416 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0207731  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2577  major facilitator superfamily MFS_1  39.95 
 
 		 395 aa  253  5.000000000000001e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363231  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3215  major facilitator transporter  38.32 
 
 		 411 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0334409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1203  major facilitator superfamily MFS_1  35.88 
 
 		 410 aa  242  7.999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0468  multidrug resistance efflux transporter  35.16 
 
 		 394 aa  227  3e-58  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000018519  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1273  multidrug resistance efflux transporter, authentic frameshift  35.42 
 
 		 394 aa  226  4e-58  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000141298  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2319  major facilitator superfamily MFS_1  33.9 
 
 		 407 aa  217  2.9999999999999998e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1231  major facilitator superfamily permease  34.07 
 
 		 401 aa  217  2.9999999999999998e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.200492  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3462  major facilitator transporter  34.33 
 
 		 412 aa  211  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0850  major facilitator superfamily MFS_1  35 
 
 		 406 aa  211  2e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1063  major facilitator transporter  35.53 
 
 		 407 aa  199  9e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0710  major facilitator superfamily MFS_1  34.06 
 
 		 404 aa  195  1e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0507  major facilitator transporter  32.53 
 
 		 450 aa  144  3e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0233513  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0106  major facilitator transporter  26.14 
 
 		 418 aa  119  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0110  major facilitator transporter  26.14 
 
 		 418 aa  119  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4635  major facilitator superfamily MFS_1  30.16 
 
 		 410 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.720897 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  26.98 
 
 		 387 aa  96.3  9e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  29.36 
 
 		 392 aa  93.6  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1028  multidrug resistance protein  26.39 
 
 		 408 aa  92.8  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0302699  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4881  major facilitator superfamily MFS_1  27.07 
 
 		 408 aa  89  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0342  major facilitator superfamily permease  27.09 
 
 		 396 aa  89  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  26.47 
 
 		 425 aa  88.6  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  28.86 
 
 		 389 aa  87.4  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  28.24 
 
 		 387 aa  86.7  6e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  33.51 
 
 		 406 aa  85.9  0.000000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  25.55 
 
 		 410 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  25.57 
 
 		 415 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2426  tetracycline resistance protein  26.44 
 
 		 411 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  26.9 
 
 		 370 aa  81.6  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  24.11 
 
 		 395 aa  81.3  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0422  major facilitator transporter  28.24 
 
 		 397 aa  81.3  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.186179  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  28.33 
 
 		 409 aa  80.1  0.00000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  22.65 
 
 		 391 aa  80.1  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  24.21 
 
 		 386 aa  79.7  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2504  tetracycline-efflux transporter, putative  26.65 
 
 		 411 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00179141  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3398  general substrate transporter  26.79 
 
 		 411 aa  78.2  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1305  major facilitator superfamily MFS_1  24.63 
 
 		 421 aa  78.6  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2904  tetracycline resistance protein  25.13 
 
 		 411 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.316872  normal  0.10266 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  30.41 
 
 		 421 aa  77.4  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  25.67 
 
 		 416 aa  77.4  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04141  predicted transporter  25.2 
 
 		 405 aa  77  0.0000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3722  General substrate transporter  25.2 
 
 		 405 aa  77  0.0000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04104  hypothetical protein  25.2 
 
 		 405 aa  77  0.0000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0805  major facilitator superfamily MFS_1  22.58 
 
 		 408 aa  76.6  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.659867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  24.21 
 
 		 423 aa  76.6  0.0000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>