50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1469 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_1469  general secretion pathway protein C  100 
 
 		 274 aa  556  1e-157  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.954989  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1298  general secretion pathway protein C  71.17 
 
 		 272 aa  415  9.999999999999999e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1411  general secretion pathway protein C  50 
 
 		 290 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2861  general secretion pathway protein C  51.3 
 
 		 287 aa  218  6e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0002  general secretion pathway protein C  33.96 
 
 		 291 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.856958  normal  0.237385 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2307  general secretion pathway protein C  29.97 
 
 		 305 aa  122  5e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0104  general secretion pathway protein C  30.6 
 
 		 304 aa  122  7e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0143  general secretion pathway protein C  29.9 
 
 		 305 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4735  general secretion pathway protein C  30.07 
 
 		 301 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000515077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4359  general secretion pathway protein C  28.99 
 
 		 303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0126021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0120  type II secretion system protein C  28.83 
 
 		 303 aa  112  5e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000735781  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3620  general secretion pathway protein C  29.24 
 
 		 305 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00688552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001893  general secretion pathway protein C  28.11 
 
 		 307 aa  109  6e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4207  general secretion pathway protein C  26.69 
 
 		 309 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000718713  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00600  zinc metallopeptidase  29.29 
 
 		 307 aa  106  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0152  general secretion pathway protein C  26.69 
 
 		 309 aa  106  5e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.641233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0152  general secretion pathway protein C  26.69 
 
 		 309 aa  106  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.30752  normal  0.16929 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0148  general secretion pathway protein C  26.69 
 
 		 309 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0168  general secretion pathway protein C  27.84 
 
 		 307 aa  105  7e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0176873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2925  general secretion pathway protein C  26.73 
 
 		 303 aa  105  8e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0165  general secretion pathway protein C  30.13 
 
 		 308 aa  103  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3568  general secretion pathway protein C  27.37 
 
 		 308 aa  103  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00690915  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0150  general secretion pathway protein C  29.66 
 
 		 308 aa  103  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00215157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0155  general secretion pathway protein C  29.24 
 
 		 308 aa  103  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0113591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0150  general secretion pathway protein C  29.24 
 
 		 308 aa  103  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.752354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03955  general secretion pathway protein C  28.47 
 
 		 307 aa  100  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3581  general secretion pathway protein C  27.84 
 
 		 323 aa  92.8  6e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.703805  normal  0.317854 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0096  general secretion pathway protein C  27.4 
 
 		 277 aa  92  9e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.140441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0230  general secretion pathway protein C  26.92 
 
 		 284 aa  87.4  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4592  general secretion pathway protein C  28.51 
 
 		 316 aa  85.9  7e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2402  general secretion pathway protein C  26.28 
 
 		 328 aa  85.1  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.237406  hitchhiker  0.00100026 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0224  general secretion pathway protein C  25.88 
 
 		 302 aa  69.3  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3518  general secretion pathway protein C  23.94 
 
 		 271 aa  65.9  0.0000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000156607  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03175  general secretory pathway component, cryptic  23.94 
 
 		 271 aa  65.9  0.0000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.016563  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0389  general secretion pathway protein C  23.94 
 
 		 271 aa  65.9  0.0000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000776949  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03126  hypothetical protein  23.94 
 
 		 271 aa  65.9  0.0000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.013931  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0389  general secretion pathway protein C  23.94 
 
 		 271 aa  65.9  0.0000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.125631  normal  0.017456 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3139  putative type II secretion protein GspC  23.97 
 
 		 319 aa  66.2  0.0000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3428  putative type II secretion protein GspC  24.14 
 
 		 319 aa  65.9  0.0000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02839  predicted secretion pathway protein, C-type protein  24.39 
 
 		 276 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02789  hypothetical protein  24.39 
 
 		 276 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000559492  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3248  putative type II secretion protein GspC  24.4 
 
 		 319 aa  62.8  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0726  general secretion pathway protein C  24.73 
 
 		 284 aa  59.3  0.00000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0140  general secretion pathway protein C  27.56 
 
 		 285 aa  58.2  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1040  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  25 
 
 		 293 aa  51.6  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000638276  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1348  hypothetical protein  32.8 
 
 		 218 aa  47  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.671423  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0249  hypothetical protein  22.27 
 
 		 259 aa  45.1  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00883556  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2028  general secretion pathway protein C  24.39 
 
 		 282 aa  44.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0450  membrane-associated zinc metalloprotease  21.97 
 
 		 428 aa  43.5  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000160258  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2376  general secretion pathway protein C  22.51 
 
 		 359 aa  42.4  0.008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.490477  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>