176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0942 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_0942  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 		 297 aa  598  1e-170  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5159  2-dehydropantoate 2-reductase  76.69 
 
 		 298 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6133  2-dehydropantoate 2-reductase  73.56 
 
 		 298 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6421  2-dehydropantoate 2-reductase  74.92 
 
 		 298 aa  449  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5585  2-dehydropantoate 2-reductase  74.58 
 
 		 298 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5949  2-dehydropantoate 2-reductase  74.58 
 
 		 298 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.688574  normal  0.155835 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6450  2-dehydropantoate 2-reductase  73.56 
 
 		 298 aa  441  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1469  2-dehydropantoate 2-reductase  72.64 
 
 		 296 aa  440  9.999999999999999e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3174  2-dehydropantoate 2-reductase  71.28 
 
 		 296 aa  434  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00987338  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3136  2-dehydropantoate 2-reductase  70.95 
 
 		 296 aa  430  1e-119  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2289  2-dehydropantoate 2-reductase  68.58 
 
 		 296 aa  424  1e-117  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.974409  normal  0.841537 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6083  2-dehydropantoate 2-reductase  66.9 
 
 		 298 aa  376  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4496  2-dehydropantoate 2-reductase  62.8 
 
 		 298 aa  364  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.650422  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4304  2-dehydropantoate 2-reductase  63.92 
 
 		 298 aa  362  4e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2354  2-dehydropantoate 2-reductase  54.3 
 
 		 295 aa  299  4e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2307  2-dehydropantoate 2-reductase  54.3 
 
 		 319 aa  299  5e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.198557  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12593  2-dehydropantoate 2-reductase  53.09 
 
 		 275 aa  263  3e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.510267 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0833  2-dehydropantoate 2-reductase  45.92 
 
 		 297 aa  232  7.000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000476059 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4708  2-dehydropantoate 2-reductase  37.98 
 
 		 289 aa  169  6e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.392544 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2165  2-dehydropantoate 2-reductase  36.11 
 
 		 294 aa  154  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356223 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2219  2-dehydropantoate 2-reductase  37.19 
 
 		 335 aa  114  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205933  normal  0.043559 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2153  2-dehydropantoate 2-reductase  27.15 
 
 		 289 aa  104  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2622  2-dehydropantoate 2-reductase  26.96 
 
 		 286 aa  102  8e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2676  2-dehydropantoate 2-reductase  26.96 
 
 		 286 aa  102  8e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.630007  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  31.49 
 
 		 299 aa  96.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  28.96 
 
 		 316 aa  92.4  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  30.8 
 
 		 300 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  28.62 
 
 		 316 aa  90.5  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  29.72 
 
 		 301 aa  89.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5051  2-dehydropantoate 2-reductase  30.18 
 
 		 325 aa  70.1  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.691254 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  25.33 
 
 		 335 aa  69.7  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4530  2-dehydropantoate 2-reductase  27.44 
 
 		 355 aa  70.1  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.247613 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  27.53 
 
 		 345 aa  68.6  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6482  2-dehydropantoate 2-reductase  27.95 
 
 		 301 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.201709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5729  2-dehydropantoate 2-reductase  28.9 
 
 		 301 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0270  2-dehydropantoate 2-reductase  26.79 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.267073 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1448  2-dehydropantoate 2-reductase  28.9 
 
 		 329 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.619429  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2523  2-dehydropantoate 2-reductase  23.65 
 
 		 312 aa  66.2  0.0000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4967  ketopantoate reductase ApbA/PanE  26.76 
 
 		 299 aa  66.2  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0107  2-dehydropantoate 2-reductase  25.87 
 
 		 333 aa  65.9  0.0000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1361  2-dehydropantoate 2-reductase  27.6 
 
 		 305 aa  65.5  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0528481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1688  2-dehydropantoate 2-reductase  25.08 
 
 		 351 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.754321  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1786  2-dehydropantoate 2-reductase  25.36 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.43842 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3569  2-dehydropantoate 2-reductase  30.22 
 
 		 296 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2159  2-dehydropantoate 2-reductase  31.4 
 
 		 312 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0105  2-dehydropantoate 2-reductase  23.13 
 
 		 307 aa  63.5  0.000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000116334  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4655  2-dehydropantoate 2-reductase  27.09 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3892  2-dehydropantoate 2-reductase  26.64 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6131  2-dehydropantoate 2-reductase  26.78 
 
 		 341 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1713  2-dehydropantoate 2-reductase  24.15 
 
 		 306 aa  62.4  0.000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0377  2-dehydropantoate 2-reductase  23.2 
 
 		 316 aa  62  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1422  2-dehydropantoate 2-reductase  24.18 
 
 		 322 aa  62  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  28.91 
 
 		 316 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  28.91 
 
 		 316 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1790  2-dehydropantoate 2-reductase  30.09 
 
 		 332 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2470  2-dehydropantoate 2-reductase  23.18 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2518  2-dehydropantoate 2-reductase  23.18 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.254196  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0858  2-dehydropantoate 2-reductase  26.67 
 
 		 311 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00149615  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4927  2-dehydropantoate 2-reductase  29.04 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0332007  normal  0.934837 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2022  2-dehydropantoate 2-reductase  20.39 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.29792  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  26.74 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0260  2-dehydropantoate 2-reductase  26.18 
 
 		 331 aa  59.7  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0328  2-dehydropantoate 2-reductase  26.5 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0244641  normal  0.0158618 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2139  2-dehydropantoate 2-reductase  24.84 
 
 		 335 aa  59.7  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147044  normal  0.399133 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3920  2-dehydropantoate 2-reductase  25.6 
 
 		 295 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2416  2-dehydropantoate 2-reductase  24.84 
 
 		 335 aa  59.7  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0800  2-dehydropantoate 2-reductase  25.48 
 
 		 321 aa  59.3  0.00000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1719  2-dehydropantoate 2-reductase  29.2 
 
 		 312 aa  59.3  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.11731  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2099  2-dehydropantoate 2-reductase  24.84 
 
 		 335 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2858  2-dehydropantoate 2-reductase  24.58 
 
 		 322 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0713  2-dehydropantoate 2-reductase  28.25 
 
 		 306 aa  58.9  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1997  2-dehydropantoate 2-reductase  26.73 
 
 		 315 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.515886 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0375  hypothetical protein  23.28 
 
 		 302 aa  58.5  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  26.9 
 
 		 319 aa  57.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2695  2-dehydropantoate 2-reductase  25.75 
 
 		 315 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1081  2-dehydropantoate 2-reductase  24.39 
 
 		 337 aa  56.6  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.117992  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2991  2-dehydropantoate 2-reductase  27.44 
 
 		 337 aa  56.6  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.1296  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  23.7 
 
 		 309 aa  55.8  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5508  2-dehydropantoate 2-reductase  27.48 
 
 		 323 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.36356 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02389  ketopantoate reductase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14497)  26.22 
 
 		 426 aa  55.5  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2929  2-dehydropantoate 2-reductase  24.32 
 
 		 313 aa  55.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3881  2-dehydropantoate 2-reductase  26.58 
 
 		 310 aa  55.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.564166  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0771  2-dehydropantoate 2-reductase  22.65 
 
 		 309 aa  55.1  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.794348  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1736  2-dehydropantoate 2-reductase  25.11 
 
 		 309 aa  54.7  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0419891 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1891  2-dehydropantoate 2-reductase  24.41 
 
 		 313 aa  54.7  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1894  2-dehydropantoate 2-reductase  25.33 
 
 		 296 aa  54.7  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2998  2-dehydropantoate 2-reductase, putative  26.44 
 
 		 315 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0207469 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2643  2-dehydropantoate 2-reductase  24.25 
 
 		 302 aa  53.9  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0600227  normal  0.533415 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1323  2-dehydropantoate 2-reductase  24.29 
 
 		 316 aa  53.9  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.684769  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2380  2-dehydropantoate 2-reductase  27.59 
 
 		 317 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0336446 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1477  ketopantoate reductase  22.85 
 
 		 337 aa  53.5  0.000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  26.21 
 
 		 319 aa  53.5  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1859  2-dehydropantoate 2-reductase  25.45 
 
 		 311 aa  53.5  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.540128  normal  0.594276 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02678  2-dehydropantoate 2-reductase  23.85 
 
 		 339 aa  53.1  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.321227  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0698  2-dehydropantoate 2-reductase  24.45 
 
 		 332 aa  53.1  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0555265  hitchhiker  0.000214293 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2487  2-dehydropantoate 2-reductase  28.53 
 
 		 329 aa  52.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03720  2-dehydropantoate 2-reductase  26.18 
 
 		 314 aa  52.4  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.389364  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4344  2-dehydropantoate 2-reductase  25.8 
 
 		 332 aa  52.4  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.244617  decreased coverage  0.000830744 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1445  2-dehydropantoate 2-reductase  22.95 
 
 		 312 aa  52.4  0.000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.219462  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2003  2-dehydropantoate 2-reductase  30.34 
 
 		 280 aa  52.4  0.000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>