More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_2380 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_2380  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 
317 aa  578  1e-164  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0336446 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0270  2-dehydropantoate 2-reductase  47.12 
 
 
318 aa  237  3e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.267073 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0328  2-dehydropantoate 2-reductase  44.03 
 
 
315 aa  205  9e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0244641  normal  0.0158618 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0858  2-dehydropantoate 2-reductase  43.64 
 
 
311 aa  190  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00149615  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1736  2-dehydropantoate 2-reductase  40 
 
 
309 aa  189  5.999999999999999e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0419891 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0713  2-dehydropantoate 2-reductase  36.49 
 
 
306 aa  164  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1861  2-dehydropantoate 2-reductase  38.57 
 
 
317 aa  156  3e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0535  2-dehydropantoate 2-reductase  38.21 
 
 
307 aa  157  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000195412  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5181  2-dehydropantoate 2-reductase  38.21 
 
 
307 aa  157  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000387537  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4927  2-dehydropantoate 2-reductase  35.79 
 
 
306 aa  146  6e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0332007  normal  0.934837 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  34.47 
 
 
301 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3892  2-dehydropantoate 2-reductase  34.88 
 
 
310 aa  132  6.999999999999999e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5729  2-dehydropantoate 2-reductase  35.03 
 
 
301 aa  132  9e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  34.52 
 
 
299 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  34.68 
 
 
345 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5051  2-dehydropantoate 2-reductase  35.79 
 
 
325 aa  129  8.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.691254 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6482  2-dehydropantoate 2-reductase  35.13 
 
 
301 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.201709  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3781  2-dehydropantoate 2-reductase  34.06 
 
 
312 aa  127  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0449567 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4967  ketopantoate reductase ApbA/PanE  32.89 
 
 
299 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  33.98 
 
 
300 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2929  2-dehydropantoate 2-reductase  32.89 
 
 
313 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4344  2-dehydropantoate 2-reductase  32.92 
 
 
332 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.244617  decreased coverage  0.000830744 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  33.77 
 
 
298 aa  120  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5461  2-dehydropantoate 2-reductase  32.46 
 
 
315 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.853784  normal  0.141843 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4726  2-dehydropantoate 2-reductase  32.83 
 
 
315 aa  119  7e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.14221 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0600  2-dehydropantoate 2-reductase  26.69 
 
 
314 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000137771  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0211  2-dehydropantoate 2-reductase  33.75 
 
 
324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.817769  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0698  2-dehydropantoate 2-reductase  33.54 
 
 
332 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0555265  hitchhiker  0.000214293 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3920  2-dehydropantoate 2-reductase  33 
 
 
295 aa  117  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2643  2-dehydropantoate 2-reductase  33.33 
 
 
302 aa  117  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0600227  normal  0.533415 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0743  ketopantoate reductase ApbA/PanE  29.75 
 
 
311 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.786977  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0294  2-dehydropantoate 2-reductase  26.75 
 
 
307 aa  117  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.220777  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3545  2-dehydropantoate 2-reductase  32.09 
 
 
315 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16372  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4822  2-dehydropantoate 2-reductase  32.09 
 
 
315 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1713  2-dehydropantoate 2-reductase  29.01 
 
 
306 aa  116  6e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2226  2-dehydropantoate 2-reductase  33.63 
 
 
336 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4498  2-dehydropantoate 2-reductase  30.97 
 
 
312 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.399113 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0882  2-dehydropantoate 2-reductase  31.72 
 
 
315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.277426 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4203  2-dehydropantoate 2-reductase  33.21 
 
 
315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.379422  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1991  2-dehydropantoate 2-reductase  23.63 
 
 
314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1738  2-dehydropantoate 2-reductase  23.72 
 
 
314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0314725  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1877  2-dehydropantoate 2-reductase  23.63 
 
 
314 aa  114  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0355332  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3467  2-dehydropantoate 2-reductase  23.76 
 
 
314 aa  113  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000905297  hitchhiker  8.32908e-18 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0186  2-dehydropantoate 2-reductase  29.18 
 
 
306 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4016  2-dehydropantoate 2-reductase  33.55 
 
 
317 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1918  2-dehydropantoate 2-reductase  22.26 
 
 
314 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000931177 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0260  2-dehydropantoate 2-reductase  32.72 
 
 
331 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1964  2-dehydropantoate 2-reductase  22.01 
 
 
314 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00305796  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4423  2-dehydropantoate 2-reductase  29.39 
 
 
311 aa  109  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.852681 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  33.67 
 
 
319 aa  109  5e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2683  2-dehydropantoate 2-reductase  33.12 
 
 
302 aa  109  6e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3612  2-dehydropantoate 2-reductase  30.29 
 
 
342 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1746  2-dehydropantoate 2-reductase  22.26 
 
 
314 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1884  2-dehydropantoate 2-reductase  22.26 
 
 
314 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  33.33 
 
 
319 aa  108  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2967  2-dehydropantoate 2-reductase  31.48 
 
 
311 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.53344  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4671  2-dehydropantoate 2-reductase  29.88 
 
 
325 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1696  2-dehydropantoate 2-reductase  21.53 
 
 
314 aa  107  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.231571  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1216  2-dehydropantoate 2-reductase  32.57 
 
 
325 aa  106  5e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.192364  normal  0.954067 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0050  2-dehydropantoate 2-reductase  31.99 
 
 
335 aa  106  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1181  putative oxidoreductase  24.91 
 
 
307 aa  106  6e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.169664  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3118  2-dehydropantoate 2-reductase  29.49 
 
 
312 aa  105  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.782034 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1405  2-dehydropantoate 2-reductase  26.62 
 
 
307 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2936  2-dehydropantoate 2-reductase  29.55 
 
 
312 aa  104  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.178942 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1471  2-dehydropantoate 2-reductase  31.79 
 
 
334 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  26.58 
 
 
307 aa  103  6e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4479  2-dehydropantoate 2-reductase  30.95 
 
 
337 aa  102  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1448  2-dehydropantoate 2-reductase  27.67 
 
 
329 aa  102  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.619429  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0174  2-dehydropantoate 2-reductase  31.72 
 
 
313 aa  102  7e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.170216 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2270  2-dehydropantoate 2-reductase  32.81 
 
 
326 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.191181  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02788  2-dehydropantoate 2-reductase  31.21 
 
 
312 aa  101  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4356  2-dehydropantoate 2-reductase  30.72 
 
 
335 aa  102  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.484695 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4110  2-dehydropantoate 2-reductase  31.73 
 
 
336 aa  102  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.661509  normal  0.957383 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1677  2-dehydropantoate 2-reductase  36.63 
 
 
319 aa  101  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0016  2-dehydropantoate 2-reductase  29.08 
 
 
307 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0107  2-dehydropantoate 2-reductase  30.54 
 
 
333 aa  100  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5770  2-dehydropantoate 2-reductase  30.99 
 
 
307 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0480  2-dehydropantoate 2-reductase  28.53 
 
 
346 aa  100  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1891  2-dehydropantoate 2-reductase  30.53 
 
 
313 aa  100  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3162  2-dehydropantoate 2-reductase  29.87 
 
 
312 aa  100  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3040  2-dehydropantoate 2-reductase  32.5 
 
 
324 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6020  2-dehydropantoate 2-reductase  29.56 
 
 
316 aa  100  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2259  2-dehydropantoate 2-reductase  31.82 
 
 
325 aa  100  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0191  2-dehydropantoate 2-reductase  33.57 
 
 
305 aa  100  4e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4116  2-dehydropantoate 2-reductase  30.35 
 
 
308 aa  100  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.605632 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2230  2-dehydropantoate 2-reductase  30.46 
 
 
305 aa  99.8  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157651  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6159  2-dehydropantoate 2-reductase  30.59 
 
 
314 aa  99.4  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  26.52 
 
 
309 aa  99.4  7e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2408  2-dehydropantoate 2-reductase  31.99 
 
 
306 aa  99  9e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0790989 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1681  2-dehydropantoate 2-reductase  32.81 
 
 
326 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.53848  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6024  2-dehydropantoate 2-reductase  31.82 
 
 
325 aa  98.6  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.578091  normal  0.113365 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1541  2-dehydropantoate 2-reductase  27.09 
 
 
311 aa  97.8  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4655  2-dehydropantoate 2-reductase  32.67 
 
 
306 aa  98.2  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1605  2-dehydropantoate 2-reductase  32.81 
 
 
326 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.799177  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1979  2-dehydropantoate 2-reductase  30.03 
 
 
313 aa  98.2  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0057409  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0163  2-dehydropantoate 2-reductase  30.29 
 
 
306 aa  97.4  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6167  2-dehydropantoate 2-reductase  32.03 
 
 
314 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  29.5 
 
 
316 aa  96.3  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  29.5 
 
 
316 aa  96.3  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  30.16 
 
 
335 aa  95.5  9e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>