More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0278 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03283  glycogen debranching enzyme  59.82 
 
 		 657 aa  815    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000400543  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0283  glycogen debranching enzyme GlgX  59.82 
 
 		 657 aa  816    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000106954  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3910  glycogen debranching enzyme  59.82 
 
 		 657 aa  815    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3804  glycogen debranching enzyme  59.97 
 
 		 658 aa  806    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0224  glycogen debranching enzyme  76.98 
 
 		 656 aa  1033    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03236  hypothetical protein  59.82 
 
 		 657 aa  815    Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00116729  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0148  glycogen debranching enzyme  58.55 
 
 		 662 aa  773    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3907  glycogen debranching enzyme  59.97 
 
 		 658 aa  807    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.385353  normal  0.48763 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3893  glycogen debranching enzyme  59.82 
 
 		 657 aa  814    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0281  glycogen debranching enzyme  59.67 
 
 		 657 aa  814    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00281975  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3936  glycogen debranching enzyme  67.28 
 
 		 658 aa  926    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3846  glycogen debranching enzyme  59.97 
 
 		 658 aa  807    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.825937 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3738  glycogen debranching enzyme  59.82 
 
 		 658 aa  807    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3727  glycogen debranching enzyme  59.82 
 
 		 658 aa  807    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4135  glycogen debranching enzyme  66.82 
 
 		 658 aa  919    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4743  glycogen debranching enzyme  59.82 
 
 		 657 aa  815    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0278  glycogen debranching enzyme  100 
 
 		 655 aa  1346    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3839  glycogen debranching enzyme  58.75 
 
 		 657 aa  790    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.90909 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4119  glycogen debranching enzyme  58.55 
 
 		 662 aa  775    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.548863 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4005  glycogen debranching enzyme  58.4 
 
 		 662 aa  773    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4646  glycogen debranching enzyme  61.97 
 
 		 661 aa  843    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.298898 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3713  glycogen debranching enzyme  59.67 
 
 		 657 aa  812    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.723997  normal  0.535779 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3631  glycogen debranching enzyme  59.67 
 
 		 657 aa  814    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01859  glycogen debranching enzyme GlgX  48.16 
 
 		 710 aa  589  1e-167  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1740  glycogen debranching protein GlgX  46.43 
 
 		 706 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152679  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0888  glycogen operon protein  48.06 
 
 		 660 aa  582  1.0000000000000001e-165  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2265  glycogen debranching enzyme GlgX  45.24 
 
 		 708 aa  584  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00202669 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2820  glycogen debranching enzyme GlgX  45.73 
 
 		 720 aa  575  1.0000000000000001e-163  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.888887 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2544  glycogen debranching protein GlgX  46.94 
 
 		 719 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36630  putative glycosyl hydrolase  48.71 
 
 		 716 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0278347  normal  0.953744 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3138  glycogen debranching enzyme GlgX  47.49 
 
 		 758 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.157891 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1891  glycogen debranching enzyme GlgX  46.54 
 
 		 707 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3335  glycogen debranching enzyme GlgX  47.49 
 
 		 755 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.242143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3459  glycogen debranching enzyme GlgX  47.49 
 
 		 758 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.0095234  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3130  glycogen operon protein GlgX  46.49 
 
 		 727 aa  571  1e-161  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.167727  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2997  glycoside hydrolase, family alpha amylase catalytic subunit  46.34 
 
 		 727 aa  568  1e-161  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3146  glycogen debranching enzyme GlgX  48.4 
 
 		 716 aa  569  1e-161  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.371141  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0328  glycogen debranching enzyme GlgX  47.47 
 
 		 710 aa  570  1e-161  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4873  glycogen debranching enzyme GlgX  48.4 
 
 		 757 aa  571  1e-161  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.325281  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3654  glycogen debranching enzyme GlgX  47.75 
 
 		 717 aa  571  1e-161  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0348768 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1103  glycogen debranching enzyme GlgX  48.09 
 
 		 695 aa  568  1e-161  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.512458 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4055  glycogen debranching protein GlgX  47.29 
 
 		 717 aa  567  1e-160  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1958  glycogen debranching enzyme GlgX  46.03 
 
 		 704 aa  567  1e-160  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.182778  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1045  glycogen debranching enzyme GlgX  43.33 
 
 		 711 aa  568  1e-160  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1819  glycogen debranching enzyme GlgX  47.63 
 
 		 717 aa  568  1e-160  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11344  normal  0.553566 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2158  glycogen debranching protein GlgX  47.87 
 
 		 719 aa  568  1e-160  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0345133  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1227  glycogen debranching protein GlgX  47.7 
 
 		 719 aa  567  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170759 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1189  glycogen debranching protein GlgX  49.51 
 
 		 688 aa  567  1e-160  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.50354  normal  0.29921 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1074  glycogen debranching enzyme GlgX  43.76 
 
 		 711 aa  568  1e-160  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.652944 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3980  glycogen debranching enzyme GlgX  48.05 
 
 		 712 aa  567  1e-160  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524127  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2576  glycogen debranching enzyme GlgX  44.93 
 
 		 710 aa  566  1e-160  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.677524  normal  0.165671 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1788  glycogen debranching enzyme GlgX  47.44 
 
 		 717 aa  567  1e-160  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24860  glycogen debranching enzyme  48.25 
 
 		 720 aa  565  1e-160  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.624836  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1982  glycogen debranching enzyme GlgX  46.71 
 
 		 721 aa  565  1.0000000000000001e-159  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0850587  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5289  glycogen debranching enzyme GlgX  46.73 
 
 		 738 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1088  glycogen debranching enzyme GlgX  44.55 
 
 		 718 aa  563  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.231339 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0906  glycogen debranching enzyme GlgX  46.18 
 
 		 721 aa  564  1.0000000000000001e-159  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00297293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1775  glycogen debranching enzyme GlgX  49.09 
 
 		 701 aa  565  1.0000000000000001e-159  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.318288  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1850  glycogen debranching enzyme GlgX  48.7 
 
 		 779 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.369764  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1372  glycogen debranching enzyme GlgX  47.79 
 
 		 712 aa  565  1.0000000000000001e-159  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.296905 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1151  glycogen debranching enzyme GlgX  46.98 
 
 		 756 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.911208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5729  glycogen debranching enzyme GlgX  45.59 
 
 		 723 aa  564  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0238  glycogen operon protein GlgX  47.55 
 
 		 754 aa  559  1e-158  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.137822  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5335  glycogen debranching enzyme GlgX  46.72 
 
 		 723 aa  559  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0240771 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1184  glycogen debranching enzyme GlgX  47.3 
 
 		 712 aa  561  1e-158  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3555  glycogen debranching enzyme GlgX  47.87 
 
 		 755 aa  558  1e-158  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0361037 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0543  glycogen debranching enzyme GlgX  47.81 
 
 		 704 aa  560  1e-158  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0247855  normal  0.604467 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3626  glycogen debranching protein GlgX  46.69 
 
 		 701 aa  561  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0135941 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1322  glycogen operon protein GlgX  46.36 
 
 		 738 aa  561  1e-158  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0099235  normal  0.0986293 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1115  glycogen debranching enzyme GlgX  47 
 
 		 712 aa  561  1e-158  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0681  glycogen debranching enzyme GlgX  46.87 
 
 		 700 aa  559  1e-158  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2618  glycogen debranching enzyme GlgX  45.05 
 
 		 752 aa  559  1e-158  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0936116 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5495  glycogen debranching enzyme GlgX  46.27 
 
 		 714 aa  556  1e-157  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2795  glycogen debranching enzyme GlgX  44.56 
 
 		 779 aa  556  1e-157  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0466072  decreased coverage  0.00000490674 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1881  glycogen debranching protein GlgX  47.68 
 
 		 691 aa  555  1e-157  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5115  glycogen debranching protein GlgX  46.27 
 
 		 714 aa  556  1e-157  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0317  glycogen debranching protein GlgX  47.11 
 
 		 715 aa  556  1e-157  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0414  glycogen debranching enzyme GlgX  49.7 
 
 		 693 aa  556  1e-157  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0567  glycogen debranching enzyme GlgX  47.95 
 
 		 722 aa  558  1e-157  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5204  glycogen debranching enzyme GlgX  46.27 
 
 		 714 aa  556  1e-157  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.779499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0396  glycogen debranching enzyme GlgX  46.88 
 
 		 726 aa  553  1e-156  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.153348  normal  0.926984 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1169  glycogen debranching enzyme GlgX  46.11 
 
 		 733 aa  552  1e-156  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.161033 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5164  glycogen debranching enzyme GlgX  46.3 
 
 		 1537 aa  554  1e-156  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0685376 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1606  glycogen debranching protein GlgX  46.32 
 
 		 729 aa  553  1e-156  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.333423  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1056  glycogen debranching enzyme GlgX  46.7 
 
 		 712 aa  553  1e-156  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3681  glycogen debranching protein GlgX  46.87 
 
 		 692 aa  554  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3485  glycogen debranching protein GlgX  47.99 
 
 		 692 aa  555  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0541  glycogen debranching protein GlgX  47.87 
 
 		 727 aa  555  1e-156  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2676  glycogen debranching enzyme GlgX  46.54 
 
 		 691 aa  553  1e-156  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3430  glycogen debranching enzyme GlgX  44.46 
 
 		 707 aa  552  1e-156  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2909  glycogen debranching enzyme GlgX  43.93 
 
 		 751 aa  555  1e-156  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.506693  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0269  glycogen debranching enzyme GlgX  48.63 
 
 		 733 aa  554  1e-156  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.537346  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3936  glycogen debranching enzyme GlgX  47.26 
 
 		 766 aa  551  1e-155  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0659462  normal  0.365741 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7031  glycogen debranching protein GlgX  47.62 
 
 		 708 aa  549  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.261677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2254  glycogen debranching protein GlgX  45.86 
 
 		 733 aa  551  1e-155  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3116  glycogen debranching protein GlgX  47.39 
 
 		 698 aa  551  1e-155  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.479948 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1463  glycogen debranching enzyme GlgX  48.33 
 
 		 708 aa  551  1e-155  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.66197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6707  glycogen debranching protein GlgX  46.8 
 
 		 706 aa  550  1e-155  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171756  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1136  glycogen debranching enzyme GlgX  48.85 
 
 		 704 aa  551  1e-155  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1514  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  45.05 
 
 		 1464 aa  549  1e-155  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117562  normal  0.556808 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>