61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2854 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2854  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 423 aa  846    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.444695  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1620  polysaccharide biosynthesis protein  27.01 
 
 		 415 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0681626  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1197  Wzx  27.23 
 
 		 405 aa  122  9e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.905565  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0849  polysaccharide biosynthesis protein  24.27 
 
 		 419 aa  121  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6018  polysaccharide biosynthesis protein  26.93 
 
 		 433 aa  119  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.203106 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0806  polysaccharide biosynthesis family protein  23.6 
 
 		 422 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0627  polysaccharide biosynthesis family protein  23.6 
 
 		 422 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0642  polysaccharide transporter  23.6 
 
 		 422 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.21935  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2041  polysaccharide biosynthesis protein  24.59 
 
 		 415 aa  107  6e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0334353  normal  0.0804458 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0520  polysaccharide biosynthesis family protein  23.6 
 
 		 422 aa  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.203953  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2209  polysaccharide transporter  23.36 
 
 		 422 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2875  polysaccharide transporter  23.36 
 
 		 422 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0027  polysaccharide biosynthesis family protein  23.36 
 
 		 422 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342295  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2497  polysaccharide transporter  23.36 
 
 		 422 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.547808  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2253  lipopolysaccharide (O-antigen)exporter  28.54 
 
 		 444 aa  103  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3697  polysaccharide biosynthesis protein  27.11 
 
 		 443 aa  98.6  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0699  hypothetical protein  25.57 
 
 		 422 aa  97.8  3e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.786722 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4403  polysaccharide biosynthesis protein  26.07 
 
 		 417 aa  95.5  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.279052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6729  polysaccharide biosynthesis protein  27.53 
 
 		 415 aa  94  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1929  polysaccharide biosynthesis protein  26.34 
 
 		 424 aa  93.6  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.109004  normal  0.370568 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1606  polysaccharide biosynthesis protein  26.04 
 
 		 412 aa  93.2  9e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0714758  normal  0.23948 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1405  polysaccharide biosynthesis protein  23.49 
 
 		 418 aa  93.2  9e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000283826  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3316  polysaccharide biosynthesis protein  25.54 
 
 		 417 aa  91.3  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0788043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4200  polysaccharide biosynthesis protein  25.54 
 
 		 417 aa  91.3  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.404926 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3618  polysaccharide biosynthesis protein  25.2 
 
 		 419 aa  91.3  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.180964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12370  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  24.7 
 
 		 424 aa  91.3  3e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4166  polysaccharide biosynthesis protein  25.54 
 
 		 417 aa  91.3  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507145  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2025  polysaccharide biosynthesis protein  27.03 
 
 		 424 aa  90.5  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.997214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6400  polysaccharide biosynthesis protein  30.77 
 
 		 431 aa  88.2  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.247838 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4093  polysaccharide biosynthesis protein  24.66 
 
 		 419 aa  89  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1104  polysaccharide biosynthesis protein  25.37 
 
 		 429 aa  86.3  9e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4360  polysaccharide biosynthesis protein  22.9 
 
 		 429 aa  84.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.86188 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1820  polysaccharide biosynthesis protein  25.48 
 
 		 418 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.482229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0573  polysaccharide biosynthesis protein  22.33 
 
 		 477 aa  81.6  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000747167  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1081  polysaccharide biosynthesis protein  23.43 
 
 		 421 aa  78.6  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02920  O-antigen transporter  23.99 
 
 		 416 aa  77.8  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00862586  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2745  polysaccharide biosynthesis protein  28 
 
 		 412 aa  76.3  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3458  polysaccharide biosynthesis protein  30.93 
 
 		 427 aa  71.2  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2419  polysaccharide biosynthesis protein  28.42 
 
 		 431 aa  69.3  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0814087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1407  PST family polysaccharide transporter  22.14 
 
 		 481 aa  67.8  0.0000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1496  PST family polysaccharide transporter  23.53 
 
 		 484 aa  68.2  0.0000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.104259  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0582  polysaccharide biosynthesis protein  23.7 
 
 		 406 aa  67.8  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224366  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1353  polysaccharide biosynthesis protein  22.87 
 
 		 486 aa  64.7  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1369  polysaccharide biosynthesis protein  25.2 
 
 		 416 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.52788  normal  0.0165485 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2910  polysaccharide biosynthesis protein  23.55 
 
 		 485 aa  57.4  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1033  polysaccharide biosynthesis protein  22.06 
 
 		 412 aa  54.7  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0437322  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3041  polysaccharide biosynthesis protein  24.15 
 
 		 471 aa  52.8  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5060  polysaccharide biosynthesis protein  22.12 
 
 		 478 aa  51.6  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23390  putative polysaccharide biosynthesis protein  24.24 
 
 		 420 aa  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000307585  hitchhiker  0.00805893 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0604  polysaccharide biosynthesis protein  19.62 
 
 		 483 aa  48.5  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000572815  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1142  PST family polysaccharide transporter  20.99 
 
 		 475 aa  48.9  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000134656  hitchhiker  0.0000175319 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2021  polysaccharide biosynthesis protein  23.47 
 
 		 428 aa  48.1  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0464  polysaccharide transporter protein, putative  19.35 
 
 		 486 aa  47.8  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000125112  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5222  polysaccharide biosynthesis protein  22.54 
 
 		 484 aa  47.8  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5560  polysaccharide biosynthesis protein, putative  22.54 
 
 		 484 aa  47  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1522  PST family polysaccharide transporter  26.95 
 
 		 478 aa  47  0.0006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00741299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2535  polysaccharide biosynthesis protein  25.68 
 
 		 409 aa  45.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2885  polysaccharide biosynthesis protein  19.95 
 
 		 404 aa  45.1  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.285914  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1675  polysaccharide biosynthesis protein  24.47 
 
 		 430 aa  44.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0104334  normal  0.413628 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3729  polysaccharide biosynthesis protein  22.01 
 
 		 438 aa  44.3  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0553833 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3669  polysaccharide biosynthesis protein  20.51 
 
 		 501 aa  43.1  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.77196  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>