94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3421 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_3421  thiamine pyrophosphokinase  100 
 
 
212 aa  426  1e-118  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1538  thiamine pyrophosphokinase  39.71 
 
 
211 aa  161  5.0000000000000005e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0426  thiamine pyrophosphokinase  43.66 
 
 
213 aa  159  3e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0577  thiamine pyrophosphokinase  38.24 
 
 
212 aa  154  9e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2483  thiamine pyrophosphokinase  42.16 
 
 
216 aa  145  5e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1805  thiamine pyrophosphokinase  33.98 
 
 
211 aa  143  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.219265  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0627  thiamine pyrophosphokinase  36.5 
 
 
219 aa  142  3e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1746  thiamine pyrophosphokinase  35.44 
 
 
211 aa  142  3e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000511676  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1262  thiamine pyrophosphokinase  33.65 
 
 
219 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.208483  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3607  thiamine pyrophosphokinase  40.19 
 
 
224 aa  138  7.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.945813 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2104  thiamine pyrophosphokinase  35.1 
 
 
219 aa  136  3.0000000000000003e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1795  thiamine pyrophosphokinase  34.27 
 
 
216 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000771119  normal  0.210862 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10040  thiamine pyrophosphokinase  35.15 
 
 
215 aa  131  6e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3202  thiamine pyrophosphokinase  37.57 
 
 
213 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3933  thiamine pyrophosphokinase  41.63 
 
 
221 aa  130  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4124  thiamine pyrophosphokinase  29.47 
 
 
207 aa  122  3e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.738174  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3682  thiamine pyrophosphokinase  34.31 
 
 
213 aa  121  6e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000180795  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3901  hypothetical protein  34.42 
 
 
213 aa  121  7e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000344688  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3618  thiamine pyrophosphokinase  33.97 
 
 
213 aa  121  9e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000017674  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1225  thiamine pyrophosphokinase  35.65 
 
 
230 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3907  thiamine pyrophosphokinase  33.65 
 
 
213 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000037625  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3997  hypothetical protein  33.49 
 
 
213 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000013843  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3710  hypothetical protein  33.49 
 
 
213 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000607891  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3873  thiamine pyrophosphokinase  33.49 
 
 
213 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.54961e-30 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3600  thiamine pyrophosphokinase  33.49 
 
 
213 aa  118  7e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.86754e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3958  thiamine pyrophosphokinase  34.3 
 
 
213 aa  117  9e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00188574  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1285  thiamine pyrophosphokinase  33.95 
 
 
219 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000567984  hitchhiker  0.0000616024 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1706  thiamine pyrophosphokinase  31.25 
 
 
209 aa  116  3e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1988  thiamine pyrophosphokinase  31.43 
 
 
209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2676  thiamine pyrophosphokinase  38.16 
 
 
217 aa  113  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3841  thiamine pyrophosphokinase  34.8 
 
 
231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000017039  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2073  thiamine pyrophosphokinase  35.23 
 
 
226 aa  108  4.0000000000000004e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.852638  hitchhiker  0.00000141899 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0039  thiamine pyrophosphokinase  33.51 
 
 
202 aa  108  5e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000099633  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0039  thiamine pyrophosphokinase  33.51 
 
 
202 aa  108  5e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2511  thiamine pyrophosphokinase  34.83 
 
 
213 aa  108  6e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000001941  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1960  thiamine pyrophosphokinase  30.88 
 
 
216 aa  105  7e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1070  thiamine pyrophosphokinase  31.19 
 
 
215 aa  104  8e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0683  thiamine pyrophosphokinase  40.12 
 
 
212 aa  103  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4138  thiamine pyrophosphokinase  35.92 
 
 
216 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.124794 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0949  thiamine pyrophosphokinase  32.97 
 
 
203 aa  99.8  3e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000156762  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0929  thiamine pyrophosphokinase  37.57 
 
 
211 aa  99.4  4e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.229858 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1166  thiamine pyrophosphokinase  34.13 
 
 
216 aa  99  5e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000150801  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3105  thiamine pyrophosphokinase  36.07 
 
 
220 aa  97.4  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1143  thiamine pyrophosphokinase  35.15 
 
 
218 aa  91.3  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1694  thiamin pyrophosphokinase catalytic subunit  34.33 
 
 
297 aa  90.5  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.391798  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1756  hypothetical protein  34.16 
 
 
218 aa  90.1  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.416332  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0036  thiamine pyrophosphokinase  25.52 
 
 
203 aa  89.4  4e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000794456  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3809  thiamine pyrophosphokinase  33.01 
 
 
216 aa  89  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0128  thiamine pyrophosphokinase  32.02 
 
 
211 aa  87  2e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3405  thiamine pyrophosphokinase  31.71 
 
 
215 aa  84.3  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.465121  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1363  thiamine pyrophosphokinase  25.95 
 
 
218 aa  84  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0789  hypothetical protein  29.95 
 
 
211 aa  83.2  0.000000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4260  thiamine pyrophosphokinase  32.69 
 
 
219 aa  82.4  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08960  thiamine pyrophosphokinase  32.79 
 
 
228 aa  82  0.000000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000037051 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1939  thiamine pyrophosphokinase  31.43 
 
 
212 aa  79.7  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.611863  normal  0.701767 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1307  hypothetical protein  32.78 
 
 
213 aa  77.8  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00543871  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1282  hypothetical protein  32.78 
 
 
213 aa  77.8  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0360519  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0473  thiamine diphosphokinase  32.07 
 
 
272 aa  76.6  0.0000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09380  thiamine pyrophosphokinase  30.77 
 
 
222 aa  76.6  0.0000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.39134 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1253  thiamine pyrophosphokinase  23.21 
 
 
222 aa  77  0.0000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2175  thiamine pyrophosphokinase  27.75 
 
 
220 aa  74.3  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.227177  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0230  thiamine pyrophosphokinase  30.57 
 
 
241 aa  73.9  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2014  thiamine pyrophosphokinase  32.46 
 
 
211 aa  72  0.000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1147  thiamine pyrophosphokinase  27.32 
 
 
205 aa  71.2  0.000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.514296  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1775  hypothetical protein  29.1 
 
 
210 aa  69.3  0.00000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0906  thiamine pyrophosphokinase  28.85 
 
 
234 aa  68.9  0.00000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000103792  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2799  thiamine pyrophosphokinase  29.33 
 
 
220 aa  68.9  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1508  thiamine pyrophosphokinase  27.96 
 
 
219 aa  65.5  0.0000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000147965  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0410  thiamine pyrophosphokinase  23.66 
 
 
204 aa  65.1  0.0000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_5423  predicted protein  25.89 
 
 
226 aa  63.9  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4449  thiamine pyrophosphokinase  25.36 
 
 
221 aa  61.2  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359554  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0791  thiamine pyrophosphokinase  33.1 
 
 
220 aa  61.2  0.00000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.410338  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0864  thiamine pyrophosphokinase  29.95 
 
 
454 aa  59.7  0.00000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000134495  normal  0.492449 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1966  thiamine pyrophosphokinase  32.8 
 
 
223 aa  59.3  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.923392  normal  0.153951 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0879  thiamine pyrophosphokinase  30.37 
 
 
234 aa  58.9  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0767  thiamine pyrophosphokinase  26.47 
 
 
222 aa  56.2  0.0000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000566188  hitchhiker  0.0000000481128 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1768  hypothetical protein  33.33 
 
 
210 aa  54.7  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.712732  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2564  hypothetical protein  28.49 
 
 
217 aa  54.7  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2418  hypothetical protein  28.49 
 
 
217 aa  53.9  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3176  thiamine pyrophosphokinase  30.85 
 
 
231 aa  51.6  0.000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0605  thiamine pyrophosphokinase  30.6 
 
 
211 aa  51.2  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.681659  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2739  putative thiamine pyrophosphokinase  29.57 
 
 
229 aa  51.2  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.641586  normal  0.0231112 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1547  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  30.63 
 
 
373 aa  50.1  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1391  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  33.91 
 
 
372 aa  48.1  0.00009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.645709  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0363  hypothetical protein  26.79 
 
 
232 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0480  hypothetical protein  30.09 
 
 
230 aa  48.1  0.0001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2007  thiamine pyrophosphokinase  26.79 
 
 
232 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0983974  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3146  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  46 
 
 
407 aa  43.5  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0465351  normal  0.659837 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1614  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  42.55 
 
 
375 aa  43.5  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1897  thiamin pyrophosphokinase catalytic subunit  26.56 
 
 
225 aa  42.7  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.327287 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1914  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  32.41 
 
 
392 aa  42.7  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0967076  normal  0.164651 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2172  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  50 
 
 
413 aa  42.4  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000233107  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1905  thiamin pyrophosphokinase catalytic region  32.41 
 
 
392 aa  42.4  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.028315  hitchhiker  0.000109724 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2010  thiamin pyrophosphokinase catalytic region  40.98 
 
 
399 aa  41.6  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.272483  normal  0.113 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>