37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1897 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1897  thiamin pyrophosphokinase catalytic subunit  100 
 
 		 225 aa  463  9.999999999999999e-131  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.327287 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1147  thiamine pyrophosphokinase  27.81 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.514296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3176  thiamine pyrophosphokinase  29.71 
 
 		 231 aa  67.8  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2739  putative thiamine pyrophosphokinase  27.81 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.641586  normal  0.0231112 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0363  hypothetical protein  26.83 
 
 		 232 aa  61.6  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0879  thiamine pyrophosphokinase  25.85 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2007  thiamine pyrophosphokinase  28.07 
 
 		 232 aa  60.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0983974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1966  thiamine pyrophosphokinase  27.84 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.923392  normal  0.153951 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2799  thiamine pyrophosphokinase  30.95 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0605  thiamine pyrophosphokinase  26.59 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.681659  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1805  thiamine pyrophosphokinase  24.52 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.219265  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3841  thiamine pyrophosphokinase  25.44 
 
 		 231 aa  54.3  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000017039  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0577  thiamine pyrophosphokinase  28.67 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4449  thiamine pyrophosphokinase  29.55 
 
 		 221 aa  52.4  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1988  thiamine pyrophosphokinase  26.64 
 
 		 209 aa  52  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1706  thiamine pyrophosphokinase  25.7 
 
 		 209 aa  51.2  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2175  thiamine pyrophosphokinase  25.97 
 
 		 220 aa  48.5  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.227177  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3607  thiamine pyrophosphokinase  26.8 
 
 		 224 aa  48.5  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.945813 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2564  hypothetical protein  22.16 
 
 		 217 aa  47.8  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2104  thiamine pyrophosphokinase  30.43 
 
 		 219 aa  47.4  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2418  hypothetical protein  22.16 
 
 		 217 aa  47.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0627  thiamine pyrophosphokinase  26.54 
 
 		 219 aa  47.8  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1070  thiamine pyrophosphokinase  24.84 
 
 		 215 aa  46.6  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1756  hypothetical protein  26.82 
 
 		 218 aa  45.4  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.416332  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1694  thiamin pyrophosphokinase catalytic subunit  26.82 
 
 		 297 aa  45.1  0.0008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.391798  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09380  thiamine pyrophosphokinase  25.13 
 
 		 222 aa  45.1  0.0009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.39134 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2511  thiamine pyrophosphokinase  25.28 
 
 		 213 aa  44.3  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000001941  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3202  thiamine pyrophosphokinase  26.85 
 
 		 213 aa  44.7  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0426  thiamine pyrophosphokinase  27.1 
 
 		 213 aa  44.3  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0789  hypothetical protein  27.78 
 
 		 211 aa  43.5  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1538  thiamine pyrophosphokinase  24.38 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1262  thiamine pyrophosphokinase  28.87 
 
 		 219 aa  43.5  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.208483  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1795  thiamine pyrophosphokinase  24.68 
 
 		 216 aa  43.1  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000771119  normal  0.210862 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3035  30S ribosomal protein S1  31.82 
 
 		 567 aa  42.4  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00687642  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1280  30S ribosomal protein S1  31.82 
 
 		 559 aa  41.6  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0113187  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0480  hypothetical protein  25.17 
 
 		 230 aa  41.6  0.01  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2676  thiamine pyrophosphokinase  22.37 
 
 		 217 aa  41.6  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>