43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0605 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0605  thiamine pyrophosphokinase  100 
 
 		 211 aa  415  9.999999999999999e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.681659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0879  thiamine pyrophosphokinase  54.46 
 
 		 234 aa  208  6e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0363  hypothetical protein  53.52 
 
 		 232 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2007  thiamine pyrophosphokinase  53.52 
 
 		 232 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0983974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1966  thiamine pyrophosphokinase  50.72 
 
 		 223 aa  192  3e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.923392  normal  0.153951 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3176  thiamine pyrophosphokinase  44.29 
 
 		 231 aa  154  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2739  putative thiamine pyrophosphokinase  40.29 
 
 		 229 aa  131  9e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.641586  normal  0.0231112 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0929  thiamine pyrophosphokinase  35.35 
 
 		 211 aa  64.7  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.229858 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1147  thiamine pyrophosphokinase  25.73 
 
 		 205 aa  64.3  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.514296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0683  thiamine pyrophosphokinase  33.33 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2175  thiamine pyrophosphokinase  28.12 
 
 		 220 aa  63.9  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.227177  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0480  hypothetical protein  28.8 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1897  thiamin pyrophosphokinase catalytic subunit  25.99 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.327287 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0627  thiamine pyrophosphokinase  28.9 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2676  thiamine pyrophosphokinase  31.92 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3202  thiamine pyrophosphokinase  24.65 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2799  thiamine pyrophosphokinase  28.23 
 
 		 220 aa  54.7  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1706  thiamine pyrophosphokinase  27.36 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2104  thiamine pyrophosphokinase  28.27 
 
 		 219 aa  54.7  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1805  thiamine pyrophosphokinase  22.6 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.219265  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4449  thiamine pyrophosphokinase  27.46 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359554  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2564  hypothetical protein  26.19 
 
 		 217 aa  52.8  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1756  hypothetical protein  29.47 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.416332  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1694  thiamin pyrophosphokinase catalytic subunit  27.72 
 
 		 297 aa  52.4  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.391798  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2418  hypothetical protein  26.19 
 
 		 217 aa  52.4  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1988  thiamine pyrophosphokinase  26.19 
 
 		 209 aa  51.6  0.000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2483  thiamine pyrophosphokinase  25.3 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10040  thiamine pyrophosphokinase  24.54 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3105  thiamine pyrophosphokinase  30.23 
 
 		 220 aa  50.1  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3421  thiamine pyrophosphokinase  29.44 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1960  thiamine pyrophosphokinase  27.72 
 
 		 216 aa  49.3  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0577  thiamine pyrophosphokinase  24.86 
 
 		 212 aa  48.9  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1143  thiamine pyrophosphokinase  27.72 
 
 		 218 aa  48.5  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3607  thiamine pyrophosphokinase  28.65 
 
 		 224 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.945813 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1538  thiamine pyrophosphokinase  25.12 
 
 		 211 aa  46.2  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09380  thiamine pyrophosphokinase  28.64 
 
 		 222 aa  46.6  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.39134 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0426  thiamine pyrophosphokinase  29.27 
 
 		 213 aa  46.6  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1795  thiamine pyrophosphokinase  26.42 
 
 		 216 aa  46.2  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000771119  normal  0.210862 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0864  thiamine pyrophosphokinase  26.03 
 
 		 454 aa  45.8  0.0005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000134495  normal  0.492449 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08960  thiamine pyrophosphokinase  27.94 
 
 		 228 aa  45.4  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000037051 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1775  hypothetical protein  24.73 
 
 		 210 aa  45.4  0.0006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1070  thiamine pyrophosphokinase  24.87 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2511  thiamine pyrophosphokinase  29.2 
 
 		 213 aa  42  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000001941  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>