68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1775 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1775  hypothetical protein  100 
 
 
210 aa  428  1e-119  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1768  hypothetical protein  58.85 
 
 
210 aa  236  1e-61  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.712732  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2014  thiamine pyrophosphokinase  40.31 
 
 
211 aa  154  8e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1508  thiamine pyrophosphokinase  35.68 
 
 
219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000147965  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1166  thiamine pyrophosphokinase  30.37 
 
 
216 aa  118  7.999999999999999e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000150801  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0767  thiamine pyrophosphokinase  33.33 
 
 
222 aa  101  7e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000566188  hitchhiker  0.0000000481128 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0791  thiamine pyrophosphokinase  31.56 
 
 
220 aa  98.6  5e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.410338  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3710  hypothetical protein  31.31 
 
 
213 aa  96.7  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000607891  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3600  thiamine pyrophosphokinase  31.31 
 
 
213 aa  96.7  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.86754e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3873  thiamine pyrophosphokinase  31.31 
 
 
213 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.54961e-30 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3997  hypothetical protein  31.31 
 
 
213 aa  96.7  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000013843  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0789  hypothetical protein  32.28 
 
 
211 aa  96.3  3e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3958  thiamine pyrophosphokinase  31.63 
 
 
213 aa  95.9  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00188574  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3618  thiamine pyrophosphokinase  30.84 
 
 
213 aa  95.9  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000017674  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1285  thiamine pyrophosphokinase  31.63 
 
 
219 aa  95.5  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000567984  hitchhiker  0.0000616024 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3907  thiamine pyrophosphokinase  31.31 
 
 
213 aa  94.7  8e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000037625  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1960  thiamine pyrophosphokinase  33.16 
 
 
216 aa  94.4  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3202  thiamine pyrophosphokinase  31.13 
 
 
213 aa  94.4  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1070  thiamine pyrophosphokinase  33.33 
 
 
215 aa  93.2  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3901  hypothetical protein  31.31 
 
 
213 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000344688  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1307  hypothetical protein  32.98 
 
 
213 aa  89.7  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00543871  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1282  hypothetical protein  32.98 
 
 
213 aa  89.7  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0360519  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3682  thiamine pyrophosphokinase  30.67 
 
 
213 aa  89  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000180795  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2511  thiamine pyrophosphokinase  29.44 
 
 
213 aa  89  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000001941  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0627  thiamine pyrophosphokinase  30.99 
 
 
219 aa  82.4  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1706  thiamine pyrophosphokinase  30.88 
 
 
209 aa  77.4  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1988  thiamine pyrophosphokinase  31.39 
 
 
209 aa  76.3  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1262  thiamine pyrophosphokinase  29.09 
 
 
219 aa  74.3  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.208483  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1538  thiamine pyrophosphokinase  31.79 
 
 
211 aa  74.3  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10040  thiamine pyrophosphokinase  30.77 
 
 
215 aa  72.8  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2483  thiamine pyrophosphokinase  29.09 
 
 
216 aa  71.6  0.000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1795  thiamine pyrophosphokinase  26.39 
 
 
216 aa  71.2  0.000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000771119  normal  0.210862 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0426  thiamine pyrophosphokinase  27.23 
 
 
213 aa  69.3  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0906  thiamine pyrophosphokinase  26.57 
 
 
234 aa  66.6  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000103792  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3841  thiamine pyrophosphokinase  25.94 
 
 
231 aa  65.1  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000017039  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0577  thiamine pyrophosphokinase  29.23 
 
 
212 aa  64.7  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3607  thiamine pyrophosphokinase  25.51 
 
 
224 aa  63.9  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.945813 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1363  thiamine pyrophosphokinase  28.95 
 
 
218 aa  63.2  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl224  hypothetical protein  26.63 
 
 
207 aa  63.2  0.000000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000280921  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1225  thiamine pyrophosphokinase  25.89 
 
 
230 aa  62.8  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3421  thiamine pyrophosphokinase  29.1 
 
 
212 aa  60.1  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0036  thiamine pyrophosphokinase  26.21 
 
 
203 aa  60.5  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000794456  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1805  thiamine pyrophosphokinase  27.92 
 
 
211 aa  60.1  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.219265  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0259  hypothetical protein  27.04 
 
 
208 aa  58.9  0.00000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0949  thiamine pyrophosphokinase  24.74 
 
 
203 aa  58.2  0.00000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000156762  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09380  thiamine pyrophosphokinase  24.36 
 
 
222 aa  57.8  0.0000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.39134 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2073  thiamine pyrophosphokinase  35.11 
 
 
226 aa  57.4  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.852638  hitchhiker  0.00000141899 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0683  thiamine pyrophosphokinase  24.86 
 
 
212 aa  55.1  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0473  thiamine diphosphokinase  25 
 
 
272 aa  55.1  0.0000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2676  thiamine pyrophosphokinase  26.4 
 
 
217 aa  53.1  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3933  thiamine pyrophosphokinase  27.27 
 
 
221 aa  52.8  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08960  thiamine pyrophosphokinase  26 
 
 
228 aa  52.8  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000037051 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0410  thiamine pyrophosphokinase  27.32 
 
 
204 aa  52.4  0.000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0039  thiamine pyrophosphokinase  27.57 
 
 
202 aa  51.6  0.000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0039  thiamine pyrophosphokinase  27.57 
 
 
202 aa  51.6  0.000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000099633  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1939  thiamine pyrophosphokinase  25.41 
 
 
212 aa  49.3  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.611863  normal  0.701767 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3176  thiamine pyrophosphokinase  24.49 
 
 
231 aa  47.4  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0864  thiamine pyrophosphokinase  29.67 
 
 
454 aa  47.8  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000134495  normal  0.492449 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1746  thiamine pyrophosphokinase  25.69 
 
 
211 aa  47  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000511676  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2104  thiamine pyrophosphokinase  30.77 
 
 
219 aa  46.6  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0929  thiamine pyrophosphokinase  26.14 
 
 
211 aa  46.2  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.229858 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4124  thiamine pyrophosphokinase  28.5 
 
 
207 aa  46.2  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.738174  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0605  thiamine pyrophosphokinase  24.73 
 
 
211 aa  45.8  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.681659  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1966  thiamine pyrophosphokinase  21.33 
 
 
223 aa  43.9  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.923392  normal  0.153951 
 
 
-
 
NC_002978  WD0480  hypothetical protein  26.63 
 
 
230 aa  43.9  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4449  thiamine pyrophosphokinase  25 
 
 
221 aa  42  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359554  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1147  thiamine pyrophosphokinase  24.73 
 
 
205 aa  42  0.007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.514296  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1253  thiamine pyrophosphokinase  24.49 
 
 
222 aa  41.6  0.008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>