76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1756 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR1756  hypothetical protein  100 
 
 		 218 aa  446  1.0000000000000001e-124  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.416332  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1694  thiamin pyrophosphokinase catalytic subunit  99.54 
 
 		 297 aa  441  1e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.391798  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1143  thiamine pyrophosphokinase  87.61 
 
 		 218 aa  395  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0128  thiamine pyrophosphokinase  52.4 
 
 		 211 aa  231  8.000000000000001e-60  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3809  thiamine pyrophosphokinase  51.94 
 
 		 216 aa  221  7e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4138  thiamine pyrophosphokinase  52.43 
 
 		 216 aa  218  7e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124794 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3105  thiamine pyrophosphokinase  48.53 
 
 		 220 aa  211  7.999999999999999e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0683  thiamine pyrophosphokinase  48.06 
 
 		 212 aa  202  3e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4260  thiamine pyrophosphokinase  48.79 
 
 		 219 aa  195  4.0000000000000005e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0929  thiamine pyrophosphokinase  50.5 
 
 		 211 aa  194  9e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.229858 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3405  thiamine pyrophosphokinase  47.37 
 
 		 215 aa  187  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.465121  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1939  thiamine pyrophosphokinase  42.79 
 
 		 212 aa  137  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.611863  normal  0.701767 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1538  thiamine pyrophosphokinase  33.97 
 
 		 211 aa  106  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0577  thiamine pyrophosphokinase  32.24 
 
 		 212 aa  87  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3421  thiamine pyrophosphokinase  34.16 
 
 		 212 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1795  thiamine pyrophosphokinase  28.5 
 
 		 216 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000771119  normal  0.210862 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1988  thiamine pyrophosphokinase  31.89 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3607  thiamine pyrophosphokinase  31.47 
 
 		 224 aa  77  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.945813 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1166  thiamine pyrophosphokinase  29.47 
 
 		 216 aa  74.3  0.000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000150801  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0426  thiamine pyrophosphokinase  31.41 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08960  thiamine pyrophosphokinase  32.63 
 
 		 228 aa  72.8  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000037051 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1225  thiamine pyrophosphokinase  30.91 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2104  thiamine pyrophosphokinase  27.08 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1706  thiamine pyrophosphokinase  29.69 
 
 		 209 aa  71.6  0.000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2483  thiamine pyrophosphokinase  28.49 
 
 		 216 aa  70.9  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3202  thiamine pyrophosphokinase  28.72 
 
 		 213 aa  70.5  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10040  thiamine pyrophosphokinase  30.6 
 
 		 215 aa  69.3  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4124  thiamine pyrophosphokinase  26.32 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.738174  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2676  thiamine pyrophosphokinase  33.33 
 
 		 217 aa  68.2  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2739  putative thiamine pyrophosphokinase  33.14 
 
 		 229 aa  65.5  0.0000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.641586  normal  0.0231112 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0627  thiamine pyrophosphokinase  27.37 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2073  thiamine pyrophosphokinase  28.86 
 
 		 226 aa  63.9  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.852638  hitchhiker  0.00000141899 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3682  thiamine pyrophosphokinase  28.42 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000180795  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2511  thiamine pyrophosphokinase  28.19 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000001941  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3997  hypothetical protein  28.42 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000013843  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3873  thiamine pyrophosphokinase  28.42 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.54961e-30 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3710  hypothetical protein  28.42 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000607891  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3618  thiamine pyrophosphokinase  28.72 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000017674  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3600  thiamine pyrophosphokinase  28.42 
 
 		 213 aa  62  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.86754e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3958  thiamine pyrophosphokinase  28.42 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00188574  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1262  thiamine pyrophosphokinase  27.18 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.208483  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1285  thiamine pyrophosphokinase  28.42 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000567984  hitchhiker  0.0000616024 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3907  thiamine pyrophosphokinase  28.04 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000037625  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3901  hypothetical protein  28.04 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000344688  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1746  thiamine pyrophosphokinase  24.15 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000511676  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1805  thiamine pyrophosphokinase  24.48 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.219265  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3841  thiamine pyrophosphokinase  29.2 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000017039  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3933  thiamine pyrophosphokinase  30.27 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2175  thiamine pyrophosphokinase  27.65 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.227177  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0410  thiamine pyrophosphokinase  24.31 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09380  thiamine pyrophosphokinase  27.09 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.39134 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2799  thiamine pyrophosphokinase  28.96 
 
 		 220 aa  54.7  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0480  hypothetical protein  25.59 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2014  thiamine pyrophosphokinase  26.98 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4449  thiamine pyrophosphokinase  27.12 
 
 		 221 aa  52.4  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0473  thiamine diphosphokinase  31.93 
 
 		 272 aa  52  0.000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0789  hypothetical protein  28.49 
 
 		 211 aa  51.6  0.000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0767  thiamine pyrophosphokinase  27.08 
 
 		 222 aa  51.6  0.000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000566188  hitchhiker  0.0000000481128 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1966  thiamine pyrophosphokinase  27.94 
 
 		 223 aa  51.6  0.000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.923392  normal  0.153951 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1070  thiamine pyrophosphokinase  26.59 
 
 		 215 aa  50.8  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1147  thiamine pyrophosphokinase  25.4 
 
 		 205 aa  50.8  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.514296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1960  thiamine pyrophosphokinase  29.17 
 
 		 216 aa  50.1  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1282  hypothetical protein  29.34 
 
 		 213 aa  49.3  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0360519  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1307  hypothetical protein  29.34 
 
 		 213 aa  49.3  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00543871  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0230  thiamine pyrophosphokinase  32 
 
 		 241 aa  48.9  0.00006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0949  thiamine pyrophosphokinase  28.21 
 
 		 203 aa  48.9  0.00006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000156762  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1363  thiamine pyrophosphokinase  25.79 
 
 		 218 aa  48.5  0.00008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0605  thiamine pyrophosphokinase  28.22 
 
 		 211 aa  46.2  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.681659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0039  thiamine pyrophosphokinase  25.7 
 
 		 202 aa  45.8  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0039  thiamine pyrophosphokinase  25.7 
 
 		 202 aa  45.8  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000099633  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1897  thiamin pyrophosphokinase catalytic subunit  26.82 
 
 		 225 aa  45.4  0.0006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.327287 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2007  thiamine pyrophosphokinase  26.84 
 
 		 232 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0983974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0363  hypothetical protein  26.84 
 
 		 232 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0879  thiamine pyrophosphokinase  27.46 
 
 		 234 aa  42.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0864  thiamine pyrophosphokinase  26.37 
 
 		 454 aa  42.4  0.006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000134495  normal  0.492449 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0036  thiamine pyrophosphokinase  31.11 
 
 		 203 aa  42  0.008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000794456  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>