64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4138 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_4138  thiamine pyrophosphokinase  100 
 
 
216 aa  424  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.124794 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3809  thiamine pyrophosphokinase  91.67 
 
 
216 aa  392  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3105  thiamine pyrophosphokinase  66.51 
 
 
220 aa  290  1e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4260  thiamine pyrophosphokinase  66.67 
 
 
219 aa  267  8.999999999999999e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0128  thiamine pyrophosphokinase  52.45 
 
 
211 aa  224  1e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1694  thiamin pyrophosphokinase catalytic subunit  52.91 
 
 
297 aa  218  3.9999999999999997e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.391798  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1756  hypothetical protein  52.43 
 
 
218 aa  218  7e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.416332  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1143  thiamine pyrophosphokinase  52.66 
 
 
218 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0683  thiamine pyrophosphokinase  52.88 
 
 
212 aa  204  9e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3405  thiamine pyrophosphokinase  50.24 
 
 
215 aa  186  3e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.465121  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0929  thiamine pyrophosphokinase  50.75 
 
 
211 aa  183  2.0000000000000003e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.229858 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1939  thiamine pyrophosphokinase  48.04 
 
 
212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.611863  normal  0.701767 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3421  thiamine pyrophosphokinase  35.75 
 
 
212 aa  94  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2483  thiamine pyrophosphokinase  32.54 
 
 
216 aa  85.5  6e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0577  thiamine pyrophosphokinase  31.32 
 
 
212 aa  84  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2104  thiamine pyrophosphokinase  29.11 
 
 
219 aa  77.4  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1538  thiamine pyrophosphokinase  29.63 
 
 
211 aa  77.8  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2676  thiamine pyrophosphokinase  38.76 
 
 
217 aa  76.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1795  thiamine pyrophosphokinase  29.02 
 
 
216 aa  74.3  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000771119  normal  0.210862 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1262  thiamine pyrophosphokinase  28.97 
 
 
219 aa  72.8  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.208483  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1746  thiamine pyrophosphokinase  30.65 
 
 
211 aa  72.4  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000511676  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10040  thiamine pyrophosphokinase  30.51 
 
 
215 aa  69.7  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08960  thiamine pyrophosphokinase  34.43 
 
 
228 aa  69.7  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000037051 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2511  thiamine pyrophosphokinase  29.73 
 
 
213 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000001941  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1225  thiamine pyrophosphokinase  29.27 
 
 
230 aa  67.8  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3682  thiamine pyrophosphokinase  28.72 
 
 
213 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000180795  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1988  thiamine pyrophosphokinase  27.59 
 
 
209 aa  66.2  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3907  thiamine pyrophosphokinase  30.53 
 
 
213 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000037625  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3618  thiamine pyrophosphokinase  30.53 
 
 
213 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000017674  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1805  thiamine pyrophosphokinase  26.8 
 
 
211 aa  64.3  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.219265  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4124  thiamine pyrophosphokinase  24.64 
 
 
207 aa  63.9  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.738174  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3202  thiamine pyrophosphokinase  27.01 
 
 
213 aa  63.5  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3901  hypothetical protein  30 
 
 
213 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000344688  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1706  thiamine pyrophosphokinase  26.6 
 
 
209 aa  63.2  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1285  thiamine pyrophosphokinase  30.05 
 
 
219 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000567984  hitchhiker  0.0000616024 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3958  thiamine pyrophosphokinase  30.57 
 
 
213 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00188574  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3873  thiamine pyrophosphokinase  30.53 
 
 
213 aa  62  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.54961e-30 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3997  hypothetical protein  30.53 
 
 
213 aa  62  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000013843  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3710  hypothetical protein  30.53 
 
 
213 aa  62  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000607891  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1166  thiamine pyrophosphokinase  29.58 
 
 
216 aa  61.6  0.000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000150801  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2073  thiamine pyrophosphokinase  32.57 
 
 
226 aa  61.2  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.852638  hitchhiker  0.00000141899 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0627  thiamine pyrophosphokinase  24.76 
 
 
219 aa  60.1  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3600  thiamine pyrophosphokinase  30 
 
 
213 aa  59.7  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.86754e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1070  thiamine pyrophosphokinase  26.5 
 
 
215 aa  59.3  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1363  thiamine pyrophosphokinase  28.42 
 
 
218 aa  55.1  0.0000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0410  thiamine pyrophosphokinase  24.34 
 
 
204 aa  54.3  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3841  thiamine pyrophosphokinase  28.5 
 
 
231 aa  53.9  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000017039  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0426  thiamine pyrophosphokinase  31.72 
 
 
213 aa  53.5  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0789  hypothetical protein  27.27 
 
 
211 aa  53.5  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1282  hypothetical protein  31.07 
 
 
213 aa  52.4  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0360519  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1307  hypothetical protein  31.07 
 
 
213 aa  52.4  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00543871  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4449  thiamine pyrophosphokinase  28.11 
 
 
221 aa  52.4  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359554  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0036  thiamine pyrophosphokinase  27.42 
 
 
203 aa  50.8  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000794456  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09380  thiamine pyrophosphokinase  31.9 
 
 
222 aa  50.1  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.39134 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1960  thiamine pyrophosphokinase  26.53 
 
 
216 aa  50.4  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3607  thiamine pyrophosphokinase  31.32 
 
 
224 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.945813 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0230  thiamine pyrophosphokinase  40.21 
 
 
241 aa  49.7  0.00004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1147  thiamine pyrophosphokinase  26.34 
 
 
205 aa  49.3  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.514296  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0949  thiamine pyrophosphokinase  27.66 
 
 
203 aa  49.7  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000156762  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0473  thiamine diphosphokinase  37.89 
 
 
272 aa  47.4  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1966  thiamine pyrophosphokinase  27.84 
 
 
223 aa  45.1  0.0009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.923392  normal  0.153951 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2799  thiamine pyrophosphokinase  24.4 
 
 
220 aa  44.3  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2739  putative thiamine pyrophosphokinase  29.12 
 
 
229 aa  43.1  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.641586  normal  0.0231112 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3933  thiamine pyrophosphokinase  31.32 
 
 
221 aa  41.6  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>