71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0473 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0473  thiamine diphosphokinase  100 
 
 		 272 aa  558  1e-158  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0230  thiamine pyrophosphokinase  57.56 
 
 		 241 aa  250  2e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08960  thiamine pyrophosphokinase  33.18 
 
 		 228 aa  97.4  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000037051 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2073  thiamine pyrophosphokinase  29.73 
 
 		 226 aa  89.7  4e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.852638  hitchhiker  0.00000141899 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3607  thiamine pyrophosphokinase  35.35 
 
 		 224 aa  87.4  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.945813 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0410  thiamine pyrophosphokinase  31.25 
 
 		 204 aa  87  3e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09380  thiamine pyrophosphokinase  33.85 
 
 		 222 aa  86.7  4e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.39134 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1538  thiamine pyrophosphokinase  29.72 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0577  thiamine pyrophosphokinase  30 
 
 		 212 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1795  thiamine pyrophosphokinase  29.05 
 
 		 216 aa  79.3  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000771119  normal  0.210862 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2104  thiamine pyrophosphokinase  27.35 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0627  thiamine pyrophosphokinase  31.03 
 
 		 219 aa  77.4  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1746  thiamine pyrophosphokinase  26.98 
 
 		 211 aa  77.8  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000511676  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1262  thiamine pyrophosphokinase  28.79 
 
 		 219 aa  74.3  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.208483  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3933  thiamine pyrophosphokinase  32.66 
 
 		 221 aa  74.3  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3841  thiamine pyrophosphokinase  27.39 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000017039  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0929  thiamine pyrophosphokinase  32.6 
 
 		 211 aa  71.6  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.229858 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0683  thiamine pyrophosphokinase  30.57 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1805  thiamine pyrophosphokinase  28.16 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.219265  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3421  thiamine pyrophosphokinase  32.07 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10040  thiamine pyrophosphokinase  29.08 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2483  thiamine pyrophosphokinase  29.26 
 
 		 216 aa  67  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0426  thiamine pyrophosphokinase  30 
 
 		 213 aa  64.7  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1939  thiamine pyrophosphokinase  32.63 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.611863  normal  0.701767 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4124  thiamine pyrophosphokinase  26.58 
 
 		 207 aa  58.2  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.738174  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1070  thiamine pyrophosphokinase  28.87 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2511  thiamine pyrophosphokinase  26.14 
 
 		 213 aa  57  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000001941  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0128  thiamine pyrophosphokinase  26.11 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1775  hypothetical protein  25 
 
 		 210 aa  55.1  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3202  thiamine pyrophosphokinase  22.97 
 
 		 213 aa  54.7  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3618  thiamine pyrophosphokinase  26.73 
 
 		 213 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000017674  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2676  thiamine pyrophosphokinase  30.85 
 
 		 217 aa  54.7  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3682  thiamine pyrophosphokinase  25.62 
 
 		 213 aa  53.5  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000180795  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1960  thiamine pyrophosphokinase  30.21 
 
 		 216 aa  53.5  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3907  thiamine pyrophosphokinase  26.5 
 
 		 213 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000037625  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3997  hypothetical protein  26.24 
 
 		 213 aa  52.4  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000013843  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3873  thiamine pyrophosphokinase  26.24 
 
 		 213 aa  52.4  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.54961e-30 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3710  hypothetical protein  26.24 
 
 		 213 aa  52.4  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000607891  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1285  thiamine pyrophosphokinase  26.24 
 
 		 219 aa  52  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000567984  hitchhiker  0.0000616024 
 
 
-
 
NC_004310  BR1756  hypothetical protein  31.93 
 
 		 218 aa  52  0.000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.416332  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1225  thiamine pyrophosphokinase  26.67 
 
 		 230 aa  52  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1253  thiamine pyrophosphokinase  24.05 
 
 		 222 aa  51.6  0.00001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3901  hypothetical protein  26.5 
 
 		 213 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000344688  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1147  thiamine pyrophosphokinase  27.32 
 
 		 205 aa  52  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.514296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1694  thiamin pyrophosphokinase catalytic subunit  31.93 
 
 		 297 aa  52  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.391798  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0036  thiamine pyrophosphokinase  24.63 
 
 		 203 aa  52  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000794456  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3600  thiamine pyrophosphokinase  25.87 
 
 		 213 aa  51.2  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.86754e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0949  thiamine pyrophosphokinase  26.54 
 
 		 203 aa  50.8  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000156762  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2014  thiamine pyrophosphokinase  35.58 
 
 		 211 aa  49.7  0.00005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0789  hypothetical protein  27.27 
 
 		 211 aa  49.7  0.00006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1988  thiamine pyrophosphokinase  25 
 
 		 209 aa  49.7  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1307  hypothetical protein  27.54 
 
 		 213 aa  49.3  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00543871  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3958  thiamine pyrophosphokinase  25.5 
 
 		 213 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00188574  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1706  thiamine pyrophosphokinase  27.04 
 
 		 209 aa  49.3  0.00007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1282  hypothetical protein  27.54 
 
 		 213 aa  49.3  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0360519  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1768  hypothetical protein  29.94 
 
 		 210 aa  48.1  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.712732  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3809  thiamine pyrophosphokinase  37.89 
 
 		 216 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1143  thiamine pyrophosphokinase  31.09 
 
 		 218 aa  47.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4138  thiamine pyrophosphokinase  37.89 
 
 		 216 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124794 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3105  thiamine pyrophosphokinase  37.89 
 
 		 220 aa  46.6  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1966  thiamine pyrophosphokinase  31.62 
 
 		 223 aa  46.6  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.923392  normal  0.153951 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2799  thiamine pyrophosphokinase  26.92 
 
 		 220 aa  46.2  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2739  putative thiamine pyrophosphokinase  28.57 
 
 		 229 aa  44.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.641586  normal  0.0231112 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1363  thiamine pyrophosphokinase  26.88 
 
 		 218 aa  43.9  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1508  thiamine pyrophosphokinase  29.46 
 
 		 219 aa  43.9  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000147965  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4449  thiamine pyrophosphokinase  24.73 
 
 		 221 aa  43.1  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1166  thiamine pyrophosphokinase  35.96 
 
 		 216 aa  43.1  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000150801  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3176  thiamine pyrophosphokinase  28.4 
 
 		 231 aa  43.1  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4260  thiamine pyrophosphokinase  42.17 
 
 		 219 aa  43.1  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0039  thiamine pyrophosphokinase  26.09 
 
 		 202 aa  42.7  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000099633  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0039  thiamine pyrophosphokinase  26.09 
 
 		 202 aa  42.7  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>