80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0036 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0036  thiamine pyrophosphokinase  100 
 
 
203 aa  403  1.0000000000000001e-112  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000794456  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0949  thiamine pyrophosphokinase  53.92 
 
 
203 aa  220  9e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000156762  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0039  thiamine pyrophosphokinase  42.57 
 
 
202 aa  139  3e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0039  thiamine pyrophosphokinase  42.57 
 
 
202 aa  139  3e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000099633  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1805  thiamine pyrophosphokinase  33.17 
 
 
211 aa  109  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.219265  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1363  thiamine pyrophosphokinase  34.43 
 
 
218 aa  106  3e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0577  thiamine pyrophosphokinase  36.59 
 
 
212 aa  104  9e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10040  thiamine pyrophosphokinase  33.01 
 
 
215 aa  102  5e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1225  thiamine pyrophosphokinase  32.46 
 
 
230 aa  98.2  8e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1746  thiamine pyrophosphokinase  34.65 
 
 
211 aa  96.3  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000511676  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1538  thiamine pyrophosphokinase  33.66 
 
 
211 aa  94.7  8e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2104  thiamine pyrophosphokinase  29.72 
 
 
219 aa  93.6  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2676  thiamine pyrophosphokinase  32.42 
 
 
217 aa  91.3  9e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1262  thiamine pyrophosphokinase  34.95 
 
 
219 aa  90.9  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.208483  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3841  thiamine pyrophosphokinase  28.96 
 
 
231 aa  90.9  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000017039  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1795  thiamine pyrophosphokinase  27.62 
 
 
216 aa  84.7  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000771119  normal  0.210862 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0426  thiamine pyrophosphokinase  26.87 
 
 
213 aa  84  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0627  thiamine pyrophosphokinase  32.42 
 
 
219 aa  80.1  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4124  thiamine pyrophosphokinase  30.29 
 
 
207 aa  79  0.00000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.738174  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3421  thiamine pyrophosphokinase  25.52 
 
 
212 aa  78.2  0.00000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3607  thiamine pyrophosphokinase  28.4 
 
 
224 aa  77  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.945813 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3202  thiamine pyrophosphokinase  30.53 
 
 
213 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0789  hypothetical protein  31.38 
 
 
211 aa  73.6  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2483  thiamine pyrophosphokinase  30.69 
 
 
216 aa  72.4  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1147  thiamine pyrophosphokinase  30.24 
 
 
205 aa  72.4  0.000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.514296  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1253  thiamine pyrophosphokinase  30.28 
 
 
222 aa  71.2  0.00000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2511  thiamine pyrophosphokinase  29.67 
 
 
213 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000001941  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3682  thiamine pyrophosphokinase  30.05 
 
 
213 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000180795  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1960  thiamine pyrophosphokinase  29.1 
 
 
216 aa  68.9  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1706  thiamine pyrophosphokinase  30.48 
 
 
209 aa  68.9  0.00000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09380  thiamine pyrophosphokinase  28.43 
 
 
222 aa  68.6  0.00000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.39134 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1307  hypothetical protein  30.6 
 
 
213 aa  67.4  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00543871  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1988  thiamine pyrophosphokinase  30.59 
 
 
209 aa  67.8  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1282  hypothetical protein  30.6 
 
 
213 aa  67.4  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0360519  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0410  thiamine pyrophosphokinase  28.43 
 
 
204 aa  66.6  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3901  hypothetical protein  29.47 
 
 
213 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000344688  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3907  thiamine pyrophosphokinase  29.47 
 
 
213 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000037625  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2739  putative thiamine pyrophosphokinase  28.07 
 
 
229 aa  64.7  0.0000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.641586  normal  0.0231112 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1166  thiamine pyrophosphokinase  36.36 
 
 
216 aa  64.3  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000150801  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3958  thiamine pyrophosphokinase  29.51 
 
 
213 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00188574  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3933  thiamine pyrophosphokinase  26.9 
 
 
221 aa  62.8  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1070  thiamine pyrophosphokinase  29.71 
 
 
215 aa  62.4  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0929  thiamine pyrophosphokinase  24.27 
 
 
211 aa  61.6  0.000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.229858 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1285  thiamine pyrophosphokinase  28.02 
 
 
219 aa  61.2  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000567984  hitchhiker  0.0000616024 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3618  thiamine pyrophosphokinase  27.47 
 
 
213 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000017674  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1775  hypothetical protein  26.21 
 
 
210 aa  60.5  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3710  hypothetical protein  28.95 
 
 
213 aa  59.7  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000607891  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3600  thiamine pyrophosphokinase  28.95 
 
 
213 aa  59.7  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.86754e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3997  hypothetical protein  28.95 
 
 
213 aa  59.7  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000013843  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3873  thiamine pyrophosphokinase  28.95 
 
 
213 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.54961e-30 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1966  thiamine pyrophosphokinase  24.72 
 
 
223 aa  58.5  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.923392  normal  0.153951 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0683  thiamine pyrophosphokinase  26.2 
 
 
212 aa  57.4  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0906  thiamine pyrophosphokinase  23.04 
 
 
234 aa  56.2  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000103792  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2073  thiamine pyrophosphokinase  36.17 
 
 
226 aa  56.2  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.852638  hitchhiker  0.00000141899 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0864  thiamine pyrophosphokinase  29.09 
 
 
454 aa  56.2  0.0000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000134495  normal  0.492449 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3405  thiamine pyrophosphokinase  37.8 
 
 
215 aa  55.8  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.465121  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0230  thiamine pyrophosphokinase  30.84 
 
 
241 aa  55.5  0.0000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3176  thiamine pyrophosphokinase  27.5 
 
 
231 aa  54.3  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0879  thiamine pyrophosphokinase  23 
 
 
234 aa  53.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1939  thiamine pyrophosphokinase  27.5 
 
 
212 aa  52.4  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.611863  normal  0.701767 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0473  thiamine diphosphokinase  24.63 
 
 
272 aa  52  0.000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0128  thiamine pyrophosphokinase  33.33 
 
 
211 aa  51.6  0.000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3809  thiamine pyrophosphokinase  28.49 
 
 
216 aa  50.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4138  thiamine pyrophosphokinase  27.42 
 
 
216 aa  50.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.124794 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08960  thiamine pyrophosphokinase  28.57 
 
 
228 aa  50.4  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000037051 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1508  thiamine pyrophosphokinase  37.36 
 
 
219 aa  49.3  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000147965  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2014  thiamine pyrophosphokinase  27.32 
 
 
211 aa  48.9  0.00005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4260  thiamine pyrophosphokinase  26.51 
 
 
219 aa  48.5  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0363  hypothetical protein  22.54 
 
 
232 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2007  thiamine pyrophosphokinase  21.97 
 
 
232 aa  47  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0983974  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1143  thiamine pyrophosphokinase  35.16 
 
 
218 aa  47  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2799  thiamine pyrophosphokinase  24.73 
 
 
220 aa  46.2  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0791  thiamine pyrophosphokinase  35.64 
 
 
220 aa  45.4  0.0006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.410338  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3105  thiamine pyrophosphokinase  30.43 
 
 
220 aa  44.7  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_5423  predicted protein  22.12 
 
 
226 aa  43.9  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2418  hypothetical protein  26.17 
 
 
217 aa  42.7  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1694  thiamin pyrophosphokinase catalytic subunit  31.11 
 
 
297 aa  43.1  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.391798  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2564  hypothetical protein  26.17 
 
 
217 aa  42.7  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0480  hypothetical protein  32.93 
 
 
230 aa  42.4  0.005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1756  hypothetical protein  31.11 
 
 
218 aa  42  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.416332  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>