91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3933 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3933  thiamine pyrophosphokinase  100 
 
 		 221 aa  434  1e-121  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3607  thiamine pyrophosphokinase  84.55 
 
 		 224 aa  360  8e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.945813 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0426  thiamine pyrophosphokinase  56.04 
 
 		 213 aa  221  4.9999999999999996e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1746  thiamine pyrophosphokinase  37.98 
 
 		 211 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000511676  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0577  thiamine pyrophosphokinase  36.06 
 
 		 212 aa  150  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1805  thiamine pyrophosphokinase  35.24 
 
 		 211 aa  148  6e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.219265  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1795  thiamine pyrophosphokinase  34.29 
 
 		 216 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000771119  normal  0.210862 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2676  thiamine pyrophosphokinase  46.38 
 
 		 217 aa  138  7e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2104  thiamine pyrophosphokinase  36.49 
 
 		 219 aa  136  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3421  thiamine pyrophosphokinase  41.63 
 
 		 212 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1538  thiamine pyrophosphokinase  36.59 
 
 		 211 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1262  thiamine pyrophosphokinase  37.37 
 
 		 219 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.208483  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10040  thiamine pyrophosphokinase  36.04 
 
 		 215 aa  132  5e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1225  thiamine pyrophosphokinase  39.15 
 
 		 230 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3202  thiamine pyrophosphokinase  38.02 
 
 		 213 aa  124  8.000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0627  thiamine pyrophosphokinase  34.95 
 
 		 219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3841  thiamine pyrophosphokinase  34.48 
 
 		 231 aa  109  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000017039  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4124  thiamine pyrophosphokinase  29.52 
 
 		 207 aa  108  5e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.738174  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1988  thiamine pyrophosphokinase  32.23 
 
 		 209 aa  107  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1706  thiamine pyrophosphokinase  31.92 
 
 		 209 aa  104  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3997  hypothetical protein  30.05 
 
 		 213 aa  102  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000013843  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3873  thiamine pyrophosphokinase  30.05 
 
 		 213 aa  102  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.54961e-30 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3710  hypothetical protein  30.05 
 
 		 213 aa  102  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000607891  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3618  thiamine pyrophosphokinase  29.58 
 
 		 213 aa  102  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000017674  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3600  thiamine pyrophosphokinase  30.05 
 
 		 213 aa  102  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.86754e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3907  thiamine pyrophosphokinase  29.58 
 
 		 213 aa  101  8e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000037625  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3682  thiamine pyrophosphokinase  29.58 
 
 		 213 aa  101  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000180795  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2483  thiamine pyrophosphokinase  33.68 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3958  thiamine pyrophosphokinase  29.11 
 
 		 213 aa  99.4  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00188574  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1285  thiamine pyrophosphokinase  29.11 
 
 		 219 aa  99  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000567984  hitchhiker  0.0000616024 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3901  hypothetical protein  29.11 
 
 		 213 aa  99  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000344688  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2511  thiamine pyrophosphokinase  30.84 
 
 		 213 aa  97.8  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000001941  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1070  thiamine pyrophosphokinase  30.73 
 
 		 215 aa  97.1  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09380  thiamine pyrophosphokinase  34.85 
 
 		 222 aa  95.9  4e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.39134 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1363  thiamine pyrophosphokinase  27.49 
 
 		 218 aa  91.3  1e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0039  thiamine pyrophosphokinase  32.97 
 
 		 202 aa  89  5e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0039  thiamine pyrophosphokinase  32.97 
 
 		 202 aa  89  5e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000099633  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0949  thiamine pyrophosphokinase  29.38 
 
 		 203 aa  87.8  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000156762  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1960  thiamine pyrophosphokinase  32.71 
 
 		 216 aa  86.7  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0473  thiamine diphosphokinase  35.18 
 
 		 272 aa  83.2  0.000000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0036  thiamine pyrophosphokinase  26.9 
 
 		 203 aa  80.1  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000794456  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2073  thiamine pyrophosphokinase  31.61 
 
 		 226 aa  79  0.00000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.852638  hitchhiker  0.00000141899 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1253  thiamine pyrophosphokinase  27.11 
 
 		 222 aa  79  0.00000000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1939  thiamine pyrophosphokinase  36.82 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.611863  normal  0.701767 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08960  thiamine pyrophosphokinase  31.87 
 
 		 228 aa  75.1  0.0000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000037051 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0410  thiamine pyrophosphokinase  28.71 
 
 		 204 aa  74.7  0.0000000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1166  thiamine pyrophosphokinase  28.57 
 
 		 216 aa  71.2  0.00000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000150801  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0789  hypothetical protein  25.95 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1694  thiamin pyrophosphokinase catalytic subunit  31.35 
 
 		 297 aa  67.8  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.391798  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1756  hypothetical protein  31.35 
 
 		 218 aa  67.8  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.416332  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0906  thiamine pyrophosphokinase  32.43 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000103792  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0864  thiamine pyrophosphokinase  29.63 
 
 		 454 aa  66.6  0.0000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000134495  normal  0.492449 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1147  thiamine pyrophosphokinase  25.97 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.514296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0128  thiamine pyrophosphokinase  33.33 
 
 		 211 aa  64.7  0.000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1775  hypothetical protein  27.27 
 
 		 210 aa  64.7  0.000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1307  hypothetical protein  27.57 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00543871  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1282  hypothetical protein  27.57 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0360519  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1768  hypothetical protein  25.89 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.712732  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0929  thiamine pyrophosphokinase  33.53 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.229858 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1508  thiamine pyrophosphokinase  34.45 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000147965  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0230  thiamine pyrophosphokinase  30.73 
 
 		 241 aa  60.8  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1143  thiamine pyrophosphokinase  31.33 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3176  thiamine pyrophosphokinase  32.8 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_5423  predicted protein  28.87 
 
 		 226 aa  58.2  0.00000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2175  thiamine pyrophosphokinase  25.27 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.227177  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2739  putative thiamine pyrophosphokinase  33.93 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.641586  normal  0.0231112 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2014  thiamine pyrophosphokinase  32.85 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3105  thiamine pyrophosphokinase  32.12 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4260  thiamine pyrophosphokinase  32.12 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0683  thiamine pyrophosphokinase  31.05 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1966  thiamine pyrophosphokinase  28.96 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.923392  normal  0.153951 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0791  thiamine pyrophosphokinase  29.75 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.410338  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4138  thiamine pyrophosphokinase  32.42 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124794 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2799  thiamine pyrophosphokinase  23.83 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01170  thiamine pyrophosphokinase, putative  27.72 
 
 		 229 aa  51.2  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.772914  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0767  thiamine pyrophosphokinase  27.84 
 
 		 222 aa  50.8  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000566188  hitchhiker  0.0000000481128 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4449  thiamine pyrophosphokinase  24.86 
 
 		 221 aa  50.1  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0879  thiamine pyrophosphokinase  29.02 
 
 		 234 aa  49.7  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3809  thiamine pyrophosphokinase  30.43 
 
 		 216 aa  49.3  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0363  hypothetical protein  28.5 
 
 		 232 aa  48.5  0.00008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2007  thiamine pyrophosphokinase  28.5 
 
 		 232 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0983974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3405  thiamine pyrophosphokinase  33.53 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.465121  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0480  hypothetical protein  32.22 
 
 		 230 aa  46.6  0.0003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1310  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  34.67 
 
 		 371 aa  45.1  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3007  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  54.55 
 
 		 395 aa  44.3  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64327  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2418  hypothetical protein  26.04 
 
 		 217 aa  43.5  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0591  hypothetical protein  40.82 
 
 		 365 aa  43.1  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2030  hypothetical protein  52.78 
 
 		 239 aa  42.7  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1452  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  60 
 
 		 390 aa  42.7  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.133094  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0259  hypothetical protein  23.64 
 
 		 208 aa  42.7  0.005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2564  hypothetical protein  25.52 
 
 		 217 aa  42.4  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>