64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3809 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3809  thiamine pyrophosphokinase  100 
 
 
216 aa  428  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4138  thiamine pyrophosphokinase  91.67 
 
 
216 aa  392  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.124794 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3105  thiamine pyrophosphokinase  66.51 
 
 
220 aa  291  7e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4260  thiamine pyrophosphokinase  68.52 
 
 
219 aa  274  7e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1694  thiamin pyrophosphokinase catalytic subunit  52.43 
 
 
297 aa  222  4e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.391798  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1756  hypothetical protein  51.94 
 
 
218 aa  221  7e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.416332  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0128  thiamine pyrophosphokinase  50.98 
 
 
211 aa  217  1e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1143  thiamine pyrophosphokinase  52.43 
 
 
218 aa  216  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0683  thiamine pyrophosphokinase  52.68 
 
 
212 aa  211  7.999999999999999e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3405  thiamine pyrophosphokinase  50.24 
 
 
215 aa  185  4e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.465121  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0929  thiamine pyrophosphokinase  50.25 
 
 
211 aa  182  2.0000000000000003e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.229858 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1939  thiamine pyrophosphokinase  46.57 
 
 
212 aa  141  9.999999999999999e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.611863  normal  0.701767 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2483  thiamine pyrophosphokinase  31.92 
 
 
216 aa  84.7  8e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3421  thiamine pyrophosphokinase  32.85 
 
 
212 aa  82  0.000000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0577  thiamine pyrophosphokinase  31.32 
 
 
212 aa  79.3  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1538  thiamine pyrophosphokinase  28.86 
 
 
211 aa  78.6  0.00000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2676  thiamine pyrophosphokinase  38.2 
 
 
217 aa  78.2  0.00000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08960  thiamine pyrophosphokinase  35.52 
 
 
228 aa  77  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000037051 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2104  thiamine pyrophosphokinase  28.64 
 
 
219 aa  74.7  0.0000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1262  thiamine pyrophosphokinase  28.5 
 
 
219 aa  71.2  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.208483  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1746  thiamine pyrophosphokinase  29.94 
 
 
211 aa  68.2  0.00000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000511676  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1795  thiamine pyrophosphokinase  29.9 
 
 
216 aa  66.2  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000771119  normal  0.210862 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3202  thiamine pyrophosphokinase  27.83 
 
 
213 aa  65.1  0.0000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1805  thiamine pyrophosphokinase  27.17 
 
 
211 aa  64.3  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.219265  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10040  thiamine pyrophosphokinase  27.68 
 
 
215 aa  62.8  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2511  thiamine pyrophosphokinase  30.22 
 
 
213 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000001941  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3682  thiamine pyrophosphokinase  28.49 
 
 
213 aa  62.4  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000180795  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1225  thiamine pyrophosphokinase  27.8 
 
 
230 aa  60.8  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1988  thiamine pyrophosphokinase  25.62 
 
 
209 aa  61.2  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3618  thiamine pyrophosphokinase  29.79 
 
 
213 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000017674  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1166  thiamine pyrophosphokinase  26.79 
 
 
216 aa  59.3  0.00000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000150801  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2073  thiamine pyrophosphokinase  31.84 
 
 
226 aa  58.9  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.852638  hitchhiker  0.00000141899 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0410  thiamine pyrophosphokinase  26.18 
 
 
204 aa  58.5  0.00000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1706  thiamine pyrophosphokinase  24.63 
 
 
209 aa  58.5  0.00000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3907  thiamine pyrophosphokinase  28.49 
 
 
213 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000037625  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1070  thiamine pyrophosphokinase  29.26 
 
 
215 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4124  thiamine pyrophosphokinase  24.17 
 
 
207 aa  57.4  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.738174  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1285  thiamine pyrophosphokinase  30.16 
 
 
219 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000567984  hitchhiker  0.0000616024 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3841  thiamine pyrophosphokinase  28.1 
 
 
231 aa  56.2  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000017039  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0627  thiamine pyrophosphokinase  26.95 
 
 
219 aa  55.8  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3958  thiamine pyrophosphokinase  30.16 
 
 
213 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00188574  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3901  hypothetical protein  28.26 
 
 
213 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000344688  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3710  hypothetical protein  29.89 
 
 
213 aa  55.1  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000607891  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3997  hypothetical protein  29.89 
 
 
213 aa  55.1  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000013843  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3873  thiamine pyrophosphokinase  29.89 
 
 
213 aa  55.1  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.54961e-30 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0230  thiamine pyrophosphokinase  40.59 
 
 
241 aa  54.7  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3600  thiamine pyrophosphokinase  29.89 
 
 
213 aa  54.3  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.86754e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0949  thiamine pyrophosphokinase  26.2 
 
 
203 aa  52.8  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000156762  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4449  thiamine pyrophosphokinase  27.19 
 
 
221 aa  52.8  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359554  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0036  thiamine pyrophosphokinase  28.49 
 
 
203 aa  50.8  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000794456  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0789  hypothetical protein  27.81 
 
 
211 aa  51.2  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1282  hypothetical protein  31.07 
 
 
213 aa  50.8  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0360519  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1307  hypothetical protein  31.07 
 
 
213 aa  50.8  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00543871  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1960  thiamine pyrophosphokinase  27.56 
 
 
216 aa  50.4  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3607  thiamine pyrophosphokinase  29.95 
 
 
224 aa  49.7  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.945813 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1363  thiamine pyrophosphokinase  28.42 
 
 
218 aa  48.9  0.00005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0426  thiamine pyrophosphokinase  29.95 
 
 
213 aa  49.3  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09380  thiamine pyrophosphokinase  30.17 
 
 
222 aa  48.1  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.39134 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1966  thiamine pyrophosphokinase  28.43 
 
 
223 aa  47.8  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.923392  normal  0.153951 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0473  thiamine diphosphokinase  37.89 
 
 
272 aa  48.1  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2799  thiamine pyrophosphokinase  24.19 
 
 
220 aa  46.2  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2739  putative thiamine pyrophosphokinase  28.65 
 
 
229 aa  42.7  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.641586  normal  0.0231112 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1147  thiamine pyrophosphokinase  24.39 
 
 
205 aa  43.1  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.514296  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2014  thiamine pyrophosphokinase  29.02 
 
 
211 aa  42.4  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>