63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2175 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2175  thiamine pyrophosphokinase  100 
 
 
220 aa  451  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.227177  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2799  thiamine pyrophosphokinase  66.82 
 
 
220 aa  317  7.999999999999999e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4449  thiamine pyrophosphokinase  65.45 
 
 
221 aa  315  4e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359554  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0090  thiamine pyrophosphokinase  35.39 
 
 
187 aa  91.3  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0577  thiamine pyrophosphokinase  29.29 
 
 
212 aa  83.6  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1147  thiamine pyrophosphokinase  30.62 
 
 
205 aa  79.7  0.00000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.514296  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1538  thiamine pyrophosphokinase  28.87 
 
 
211 aa  77.4  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0627  thiamine pyrophosphokinase  31.89 
 
 
219 aa  71.6  0.000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1805  thiamine pyrophosphokinase  27.84 
 
 
211 aa  70.5  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.219265  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3202  thiamine pyrophosphokinase  28.19 
 
 
213 aa  70.9  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1225  thiamine pyrophosphokinase  28.44 
 
 
230 aa  67.8  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3682  thiamine pyrophosphokinase  28.57 
 
 
213 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000180795  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3958  thiamine pyrophosphokinase  28.49 
 
 
213 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00188574  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3421  thiamine pyrophosphokinase  27.75 
 
 
212 aa  66.6  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1262  thiamine pyrophosphokinase  29.41 
 
 
219 aa  65.9  0.0000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.208483  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2483  thiamine pyrophosphokinase  31.63 
 
 
216 aa  65.9  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1285  thiamine pyrophosphokinase  28.49 
 
 
219 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000567984  hitchhiker  0.0000616024 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0426  thiamine pyrophosphokinase  29.69 
 
 
213 aa  63.5  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3907  thiamine pyrophosphokinase  26.88 
 
 
213 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000037625  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1143  thiamine pyrophosphokinase  28.72 
 
 
218 aa  62.8  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3618  thiamine pyrophosphokinase  26.88 
 
 
213 aa  62  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000017674  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3901  hypothetical protein  26.88 
 
 
213 aa  62  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000344688  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3997  hypothetical protein  26.34 
 
 
213 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000013843  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3710  hypothetical protein  26.34 
 
 
213 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000607891  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3873  thiamine pyrophosphokinase  26.34 
 
 
213 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.54961e-30 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3600  thiamine pyrophosphokinase  26.34 
 
 
213 aa  60.5  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.86754e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1966  thiamine pyrophosphokinase  26.7 
 
 
223 aa  60.8  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.923392  normal  0.153951 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1706  thiamine pyrophosphokinase  28.92 
 
 
209 aa  60.5  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1988  thiamine pyrophosphokinase  30.33 
 
 
209 aa  59.3  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3607  thiamine pyrophosphokinase  24.47 
 
 
224 aa  57  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.945813 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2739  putative thiamine pyrophosphokinase  22.45 
 
 
229 aa  56.2  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.641586  normal  0.0231112 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1694  thiamin pyrophosphokinase catalytic subunit  27.53 
 
 
297 aa  56.6  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.391798  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1756  hypothetical protein  27.65 
 
 
218 aa  56.2  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.416332  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1070  thiamine pyrophosphokinase  26.26 
 
 
215 aa  56.2  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0605  thiamine pyrophosphokinase  27.53 
 
 
211 aa  56.2  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.681659  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2676  thiamine pyrophosphokinase  26.57 
 
 
217 aa  55.8  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2511  thiamine pyrophosphokinase  25.27 
 
 
213 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000001941  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0929  thiamine pyrophosphokinase  24.43 
 
 
211 aa  54.3  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.229858 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2073  thiamine pyrophosphokinase  24.7 
 
 
226 aa  54.7  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.852638  hitchhiker  0.00000141899 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1746  thiamine pyrophosphokinase  25 
 
 
211 aa  54.3  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000511676  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2564  hypothetical protein  27.03 
 
 
217 aa  53.1  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2418  hypothetical protein  26.49 
 
 
217 aa  52.8  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0683  thiamine pyrophosphokinase  25.47 
 
 
212 aa  52.8  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1960  thiamine pyrophosphokinase  25.5 
 
 
216 aa  51.2  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1795  thiamine pyrophosphokinase  25.23 
 
 
216 aa  50.1  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000771119  normal  0.210862 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1166  thiamine pyrophosphokinase  22.96 
 
 
216 aa  49.7  0.00004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000150801  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0906  thiamine pyrophosphokinase  23.5 
 
 
234 aa  49.3  0.00005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000103792  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0410  thiamine pyrophosphokinase  26.35 
 
 
204 aa  48.9  0.00005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3933  thiamine pyrophosphokinase  25.27 
 
 
221 aa  48.5  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3176  thiamine pyrophosphokinase  22.66 
 
 
231 aa  48.5  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1897  thiamin pyrophosphokinase catalytic subunit  25.97 
 
 
225 aa  48.5  0.00008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.327287 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3105  thiamine pyrophosphokinase  26.07 
 
 
220 aa  48.5  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08960  thiamine pyrophosphokinase  24.86 
 
 
228 aa  47.8  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000037051 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4124  thiamine pyrophosphokinase  24.44 
 
 
207 aa  47.8  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.738174  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2014  thiamine pyrophosphokinase  27.78 
 
 
211 aa  46.6  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1363  thiamine pyrophosphokinase  24.37 
 
 
218 aa  46.6  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10040  thiamine pyrophosphokinase  24.24 
 
 
215 aa  45.4  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2104  thiamine pyrophosphokinase  22.61 
 
 
219 aa  44.3  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0791  thiamine pyrophosphokinase  27.22 
 
 
220 aa  43.9  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.410338  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3841  thiamine pyrophosphokinase  23.59 
 
 
231 aa  43.9  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000017039  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1939  thiamine pyrophosphokinase  28.48 
 
 
212 aa  43.1  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.611863  normal  0.701767 
 
 
-
 
NC_002978  WD0480  hypothetical protein  23.53 
 
 
230 aa  43.1  0.004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0949  thiamine pyrophosphokinase  24.82 
 
 
203 aa  42.4  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000156762  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>