74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3176 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_3176  thiamine pyrophosphokinase  100 
 
 
231 aa  452  1.0000000000000001e-126  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0879  thiamine pyrophosphokinase  43.66 
 
 
234 aa  163  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1966  thiamine pyrophosphokinase  43.33 
 
 
223 aa  161  1e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.923392  normal  0.153951 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0363  hypothetical protein  42.25 
 
 
232 aa  151  7e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2007  thiamine pyrophosphokinase  42.25 
 
 
232 aa  151  8e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0983974  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0605  thiamine pyrophosphokinase  44.29 
 
 
211 aa  149  3e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.681659  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2739  putative thiamine pyrophosphokinase  40.2 
 
 
229 aa  143  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.641586  normal  0.0231112 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1147  thiamine pyrophosphokinase  29.12 
 
 
205 aa  73.9  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.514296  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10040  thiamine pyrophosphokinase  32.14 
 
 
215 aa  70.1  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1897  thiamin pyrophosphokinase catalytic subunit  29.71 
 
 
225 aa  67.8  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.327287 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2483  thiamine pyrophosphokinase  27.01 
 
 
216 aa  66.6  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2564  hypothetical protein  27.44 
 
 
217 aa  62.8  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2418  hypothetical protein  28.42 
 
 
217 aa  62.4  0.000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1262  thiamine pyrophosphokinase  28.07 
 
 
219 aa  62.4  0.000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.208483  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0480  hypothetical protein  31.43 
 
 
230 aa  61.2  0.00000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_5423  predicted protein  27.01 
 
 
226 aa  60.5  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0039  thiamine pyrophosphokinase  30.49 
 
 
202 aa  59.3  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000099633  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0039  thiamine pyrophosphokinase  30.49 
 
 
202 aa  59.3  0.00000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1960  thiamine pyrophosphokinase  37.86 
 
 
216 aa  59.7  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1307  hypothetical protein  28.43 
 
 
213 aa  58.2  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00543871  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1282  hypothetical protein  28.43 
 
 
213 aa  58.2  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0360519  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1706  thiamine pyrophosphokinase  26.44 
 
 
209 aa  58.2  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1070  thiamine pyrophosphokinase  26.64 
 
 
215 aa  55.5  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1225  thiamine pyrophosphokinase  30.77 
 
 
230 aa  54.7  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0864  thiamine pyrophosphokinase  26.39 
 
 
454 aa  54.7  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000134495  normal  0.492449 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1988  thiamine pyrophosphokinase  25.73 
 
 
209 aa  54.7  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1939  thiamine pyrophosphokinase  35.5 
 
 
212 aa  55.1  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.611863  normal  0.701767 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3202  thiamine pyrophosphokinase  27.03 
 
 
213 aa  53.9  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4449  thiamine pyrophosphokinase  27.14 
 
 
221 aa  53.9  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359554  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0036  thiamine pyrophosphokinase  27.5 
 
 
203 aa  54.3  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000794456  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1805  thiamine pyrophosphokinase  23.33 
 
 
211 aa  52.8  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.219265  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3105  thiamine pyrophosphokinase  29.9 
 
 
220 aa  52.8  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3607  thiamine pyrophosphokinase  30.48 
 
 
224 aa  52.4  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.945813 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2511  thiamine pyrophosphokinase  31.58 
 
 
213 aa  52.4  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000001941  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3901  hypothetical protein  26.84 
 
 
213 aa  52  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000344688  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3907  thiamine pyrophosphokinase  26.32 
 
 
213 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000037625  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0683  thiamine pyrophosphokinase  27.27 
 
 
212 aa  50.4  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0949  thiamine pyrophosphokinase  27.22 
 
 
203 aa  50.4  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000156762  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0789  hypothetical protein  24.88 
 
 
211 aa  50.1  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0577  thiamine pyrophosphokinase  28.33 
 
 
212 aa  49.7  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1285  thiamine pyrophosphokinase  31.3 
 
 
219 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000567984  hitchhiker  0.0000616024 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2175  thiamine pyrophosphokinase  22.66 
 
 
220 aa  48.5  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.227177  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3421  thiamine pyrophosphokinase  30.65 
 
 
212 aa  48.5  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12109  predicted protein  28.74 
 
 
247 aa  48.1  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.197387  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3933  thiamine pyrophosphokinase  30.53 
 
 
221 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08960  thiamine pyrophosphokinase  27.83 
 
 
228 aa  48.1  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000037051 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3618  thiamine pyrophosphokinase  25.79 
 
 
213 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000017674  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2799  thiamine pyrophosphokinase  28.21 
 
 
220 aa  47.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1775  hypothetical protein  24.49 
 
 
210 aa  47.4  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3958  thiamine pyrophosphokinase  31.3 
 
 
213 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00188574  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2073  thiamine pyrophosphokinase  29.14 
 
 
226 aa  46.6  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.852638  hitchhiker  0.00000141899 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0627  thiamine pyrophosphokinase  26.6 
 
 
219 aa  46.2  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3841  thiamine pyrophosphokinase  26 
 
 
231 aa  46.2  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000017039  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3682  thiamine pyrophosphokinase  32.61 
 
 
213 aa  45.8  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000180795  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09380  thiamine pyrophosphokinase  26.58 
 
 
222 aa  45.4  0.0008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.39134 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0230  thiamine pyrophosphokinase  27.59 
 
 
241 aa  44.3  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4124  thiamine pyrophosphokinase  23.78 
 
 
207 aa  44.3  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.738174  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1547  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  40.62 
 
 
373 aa  44.7  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0128  thiamine pyrophosphokinase  25.58 
 
 
211 aa  45.1  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1538  thiamine pyrophosphokinase  26.83 
 
 
211 aa  45.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3997  hypothetical protein  32.61 
 
 
213 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000013843  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2104  thiamine pyrophosphokinase  25.67 
 
 
219 aa  43.9  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3873  thiamine pyrophosphokinase  32.61 
 
 
213 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.54961e-30 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3600  thiamine pyrophosphokinase  32.61 
 
 
213 aa  43.9  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.86754e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3710  hypothetical protein  32.61 
 
 
213 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000607891  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0906  thiamine pyrophosphokinase  27.18 
 
 
234 aa  43.9  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000103792  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1795  thiamine pyrophosphokinase  26.29 
 
 
216 aa  43.5  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000771119  normal  0.210862 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1363  thiamine pyrophosphokinase  21.18 
 
 
218 aa  43.1  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2014  thiamine pyrophosphokinase  30.17 
 
 
211 aa  42.7  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0791  thiamine pyrophosphokinase  32.5 
 
 
220 aa  43.1  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.410338  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0473  thiamine diphosphokinase  28.4 
 
 
272 aa  43.1  0.004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01170  thiamine pyrophosphokinase, putative  23.92 
 
 
229 aa  42.7  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.772914  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0767  thiamine pyrophosphokinase  29.29 
 
 
222 aa  42.7  0.005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000566188  hitchhiker  0.0000000481128 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1508  thiamine pyrophosphokinase  23.18 
 
 
219 aa  42.4  0.006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000147965  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>