45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl2418 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl2418  hypothetical protein  100 
 
 
217 aa  443  1e-123  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2564  hypothetical protein  98.62 
 
 
217 aa  436  1e-121  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0480  hypothetical protein  51.69 
 
 
230 aa  216  2e-55  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1805  thiamine pyrophosphokinase  27.65 
 
 
211 aa  70.9  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.219265  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0879  thiamine pyrophosphokinase  27.98 
 
 
234 aa  67.4  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1147  thiamine pyrophosphokinase  23.76 
 
 
205 aa  64.7  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.514296  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3176  thiamine pyrophosphokinase  28.42 
 
 
231 aa  62.4  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0363  hypothetical protein  25.13 
 
 
232 aa  60.5  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2007  thiamine pyrophosphokinase  25.13 
 
 
232 aa  60.1  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0983974  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1262  thiamine pyrophosphokinase  27.31 
 
 
219 aa  59.3  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.208483  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0577  thiamine pyrophosphokinase  28.44 
 
 
212 aa  58.5  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2739  putative thiamine pyrophosphokinase  27.81 
 
 
229 aa  58.2  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.641586  normal  0.0231112 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0906  thiamine pyrophosphokinase  28.65 
 
 
234 aa  57  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000103792  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0929  thiamine pyrophosphokinase  26.2 
 
 
211 aa  55.8  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.229858 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0627  thiamine pyrophosphokinase  25.12 
 
 
219 aa  56.2  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1966  thiamine pyrophosphokinase  30 
 
 
223 aa  54.7  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.923392  normal  0.153951 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2175  thiamine pyrophosphokinase  26.49 
 
 
220 aa  52.8  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.227177  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10040  thiamine pyrophosphokinase  23.39 
 
 
215 aa  52  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3421  thiamine pyrophosphokinase  28.49 
 
 
212 aa  50.8  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4124  thiamine pyrophosphokinase  26.83 
 
 
207 aa  50.4  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.738174  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2104  thiamine pyrophosphokinase  30.36 
 
 
219 aa  49.7  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0605  thiamine pyrophosphokinase  25.61 
 
 
211 aa  48.1  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.681659  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1795  thiamine pyrophosphokinase  23.96 
 
 
216 aa  47  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000771119  normal  0.210862 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_5423  predicted protein  23.65 
 
 
226 aa  47.4  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2799  thiamine pyrophosphokinase  25.54 
 
 
220 aa  47.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1897  thiamin pyrophosphokinase catalytic subunit  22.16 
 
 
225 aa  47.4  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.327287 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1939  thiamine pyrophosphokinase  24.86 
 
 
212 aa  47  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.611863  normal  0.701767 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1746  thiamine pyrophosphokinase  26.67 
 
 
211 aa  46.6  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000511676  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0410  thiamine pyrophosphokinase  25.68 
 
 
204 aa  45.8  0.0005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1538  thiamine pyrophosphokinase  27.22 
 
 
211 aa  44.3  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0864  thiamine pyrophosphokinase  25.63 
 
 
454 aa  44.7  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000134495  normal  0.492449 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2676  thiamine pyrophosphokinase  27.75 
 
 
217 aa  44.3  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0426  thiamine pyrophosphokinase  25.41 
 
 
213 aa  43.9  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3405  thiamine pyrophosphokinase  25.37 
 
 
215 aa  43.5  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.465121  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4449  thiamine pyrophosphokinase  24.26 
 
 
221 aa  43.5  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359554  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01170  thiamine pyrophosphokinase, putative  24.2 
 
 
229 aa  43.1  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.772914  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1363  thiamine pyrophosphokinase  22.4 
 
 
218 aa  42.7  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1225  thiamine pyrophosphokinase  23.94 
 
 
230 aa  43.1  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0036  thiamine pyrophosphokinase  26.17 
 
 
203 aa  42.7  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000794456  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0128  thiamine pyrophosphokinase  28.57 
 
 
211 aa  42  0.007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3841  thiamine pyrophosphokinase  23.77 
 
 
231 aa  42  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000017039  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2483  thiamine pyrophosphokinase  22.75 
 
 
216 aa  42  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3105  thiamine pyrophosphokinase  25.27 
 
 
220 aa  41.6  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3607  thiamine pyrophosphokinase  25.64 
 
 
224 aa  41.6  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.945813 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0215  protein of unknown function DUF115  58.62 
 
 
204 aa  41.6  0.009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>