66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1768 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_1768  hypothetical protein  100 
 
 
210 aa  434  1e-121  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.712732  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1775  hypothetical protein  58.85 
 
 
210 aa  255  4e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2014  thiamine pyrophosphokinase  41.46 
 
 
211 aa  152  4e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1508  thiamine pyrophosphokinase  37.17 
 
 
219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000147965  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1166  thiamine pyrophosphokinase  33.18 
 
 
216 aa  112  5e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000150801  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0767  thiamine pyrophosphokinase  32.29 
 
 
222 aa  100  1e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000566188  hitchhiker  0.0000000481128 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0791  thiamine pyrophosphokinase  30.35 
 
 
220 aa  89.4  4e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.410338  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0789  hypothetical protein  32.98 
 
 
211 aa  89.4  4e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3907  thiamine pyrophosphokinase  31.44 
 
 
213 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000037625  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3901  hypothetical protein  31.44 
 
 
213 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000344688  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3618  thiamine pyrophosphokinase  30.93 
 
 
213 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000017674  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1070  thiamine pyrophosphokinase  29.86 
 
 
215 aa  84  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3873  thiamine pyrophosphokinase  30.93 
 
 
213 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.54961e-30 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3997  hypothetical protein  30.93 
 
 
213 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000013843  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3710  hypothetical protein  30.93 
 
 
213 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000607891  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1960  thiamine pyrophosphokinase  29.86 
 
 
216 aa  82.4  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1307  hypothetical protein  32.32 
 
 
213 aa  80.1  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00543871  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1282  hypothetical protein  32.32 
 
 
213 aa  80.1  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0360519  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3958  thiamine pyrophosphokinase  30.93 
 
 
213 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00188574  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3600  thiamine pyrophosphokinase  30.41 
 
 
213 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.86754e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1285  thiamine pyrophosphokinase  30.93 
 
 
219 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000567984  hitchhiker  0.0000616024 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3202  thiamine pyrophosphokinase  28.31 
 
 
213 aa  78.6  0.00000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2483  thiamine pyrophosphokinase  32.47 
 
 
216 aa  77.4  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10040  thiamine pyrophosphokinase  34.35 
 
 
215 aa  75.9  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1706  thiamine pyrophosphokinase  30.91 
 
 
209 aa  75.1  0.0000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1988  thiamine pyrophosphokinase  30.91 
 
 
209 aa  75.1  0.0000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3682  thiamine pyrophosphokinase  28.72 
 
 
213 aa  75.1  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000180795  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2511  thiamine pyrophosphokinase  28.42 
 
 
213 aa  72  0.000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000001941  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0627  thiamine pyrophosphokinase  26.15 
 
 
219 aa  71.6  0.000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0259  hypothetical protein  29.7 
 
 
208 aa  70.5  0.00000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl224  hypothetical protein  29.81 
 
 
207 aa  65.1  0.0000000007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000280921  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1262  thiamine pyrophosphokinase  27.35 
 
 
219 aa  64.7  0.0000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.208483  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1795  thiamine pyrophosphokinase  30.25 
 
 
216 aa  62.8  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000771119  normal  0.210862 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1538  thiamine pyrophosphokinase  27.84 
 
 
211 aa  62  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0577  thiamine pyrophosphokinase  28.43 
 
 
212 aa  60.1  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3607  thiamine pyrophosphokinase  24.74 
 
 
224 aa  60.1  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.945813 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0906  thiamine pyrophosphokinase  30.57 
 
 
234 aa  59.7  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000103792  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1939  thiamine pyrophosphokinase  27.96 
 
 
212 aa  59.3  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.611863  normal  0.701767 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3841  thiamine pyrophosphokinase  30.08 
 
 
231 aa  58.9  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000017039  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0473  thiamine diphosphokinase  30.48 
 
 
272 aa  57.4  0.0000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0949  thiamine pyrophosphokinase  24.51 
 
 
203 aa  57.8  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000156762  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1363  thiamine pyrophosphokinase  26.98 
 
 
218 aa  57  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2073  thiamine pyrophosphokinase  32.99 
 
 
226 aa  55.1  0.0000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.852638  hitchhiker  0.00000141899 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1225  thiamine pyrophosphokinase  36.97 
 
 
230 aa  54.3  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0426  thiamine pyrophosphokinase  26.94 
 
 
213 aa  54.7  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3933  thiamine pyrophosphokinase  25.38 
 
 
221 aa  54.3  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3421  thiamine pyrophosphokinase  32.46 
 
 
212 aa  50.8  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0230  thiamine pyrophosphokinase  28.95 
 
 
241 aa  50.1  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0683  thiamine pyrophosphokinase  25.26 
 
 
212 aa  50.1  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2799  thiamine pyrophosphokinase  29.86 
 
 
220 aa  47.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4124  thiamine pyrophosphokinase  26.01 
 
 
207 aa  48.1  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.738174  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2104  thiamine pyrophosphokinase  26.92 
 
 
219 aa  47.4  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1805  thiamine pyrophosphokinase  28 
 
 
211 aa  46.2  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.219265  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2676  thiamine pyrophosphokinase  29.13 
 
 
217 aa  46.2  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1694  thiamin pyrophosphokinase catalytic subunit  26.94 
 
 
297 aa  45.1  0.0007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.391798  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0864  thiamine pyrophosphokinase  32.97 
 
 
454 aa  45.4  0.0007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000134495  normal  0.492449 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0036  thiamine pyrophosphokinase  25 
 
 
203 aa  45.1  0.0008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000794456  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1756  hypothetical protein  26.8 
 
 
218 aa  45.1  0.0009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.416332  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0410  thiamine pyrophosphokinase  25.47 
 
 
204 aa  43.9  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09380  thiamine pyrophosphokinase  30.77 
 
 
222 aa  43.9  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.39134 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1143  thiamine pyrophosphokinase  26.53 
 
 
218 aa  43.5  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0039  thiamine pyrophosphokinase  24.52 
 
 
202 aa  43.5  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000099633  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0039  thiamine pyrophosphokinase  24.52 
 
 
202 aa  43.5  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1746  thiamine pyrophosphokinase  29.79 
 
 
211 aa  42.7  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000511676  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4449  thiamine pyrophosphokinase  26.79 
 
 
221 aa  42.4  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359554  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1253  thiamine pyrophosphokinase  25.14 
 
 
222 aa  42  0.007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>