98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3197 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_3197  von Willebrand factor, type A  100 
 
 
612 aa  1248    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2605  von Willebrand factor type A  54.55 
 
 
637 aa  630  1e-179  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0555  putative nitric oxide reductase activation protein  55.12 
 
 
614 aa  585  1.0000000000000001e-165  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2324  von Willebrand factor type A domain-containing protein  45.75 
 
 
618 aa  563  1.0000000000000001e-159  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.28516  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3117  von Willebrand factor, type A  46.25 
 
 
607 aa  535  1e-150  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1979  von Willebrand factor, type A  40.58 
 
 
647 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0626  putative dinitrification protein NorD  45.83 
 
 
612 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.566432  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06840  putative dinitrification protein NorD  46.08 
 
 
612 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1465  von Willebrand factor type A  45.44 
 
 
618 aa  463  1e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.421906 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4389  von Willebrand factor type A  39.08 
 
 
633 aa  385  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664714  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0227  norD protein  37.08 
 
 
633 aa  359  8e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.902062  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0251  norD protein  36.93 
 
 
633 aa  358  9.999999999999999e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2120  von Willebrand factor, type A  37.52 
 
 
647 aa  349  1e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.876346 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1847  nitric oxide reductase activation protein  36.59 
 
 
645 aa  339  7e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1644  von Willebrand factor type A  34.79 
 
 
636 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0117  putative nitric oxide reductase activation protein  38.08 
 
 
552 aa  322  9.999999999999999e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6286  von Willebrand factor type A  34.39 
 
 
631 aa  321  1.9999999999999998e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.735218  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1518  von Willebrand factor type A  36.78 
 
 
650 aa  317  6e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3186  nitric oxide reductase D protein  35.7 
 
 
644 aa  313  4.999999999999999e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0973  von Willebrand factor, type A  34.72 
 
 
624 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1966  von Willebrand factor, type A  36.16 
 
 
624 aa  297  5e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2091  NorD protein required for nitric oxide reductase (Nor) activity  34.95 
 
 
637 aa  295  1e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2481  von Willebrand factor, type A  34.53 
 
 
638 aa  294  4e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0321  NorD nitric oxide reductase activation protein  35.74 
 
 
624 aa  286  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481742  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3433  von Willebrand factor, type A  42.39 
 
 
689 aa  195  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0652  von Willebrand factor type A  38.82 
 
 
852 aa  192  1e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.380422  normal  0.150472 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2765  von Willebrand factor type A  42.55 
 
 
689 aa  191  2e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.380735  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1253  von Willebrand factor, type A  37.67 
 
 
677 aa  190  7e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2163  von Willebrand factor type A  38.05 
 
 
842 aa  187  4e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1546  von Willebrand factor, type A  36.27 
 
 
773 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0868  nitric oxide reductase activation protein  35.4 
 
 
705 aa  182  1e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2163  von Willebrand factor type A  35.56 
 
 
831 aa  179  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000626389 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2535  von Willebrand factor type A domain protein  35.56 
 
 
805 aa  179  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3189  von Willebrand factor type A  35.74 
 
 
773 aa  179  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.903904  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0825  nitric oxide reductase activase protein  33.51 
 
 
674 aa  178  3e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.451529  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1677  von Willebrand factor type A domain protein  35.49 
 
 
783 aa  177  6e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1375  von Willebrand factor type A  35.49 
 
 
783 aa  177  6e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1092  von Willebrand factor type A  36.58 
 
 
756 aa  176  9.999999999999999e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0132  von Willebrand factor type A  34.72 
 
 
781 aa  175  1.9999999999999998e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4066  hypothetical protein  35.05 
 
 
743 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2663  von Willebrand factor type A  35.6 
 
 
772 aa  172  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3054  von Willebrand factor type A domain protein  35.6 
 
 
772 aa  172  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1043  von Willebrand factor, type A  36.51 
 
 
781 aa  168  2e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2157  von Willebrand factor type A domain protein  34.7 
 
 
759 aa  168  2.9999999999999998e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1816  von Willebrand factor type A  34.7 
 
 
759 aa  168  2.9999999999999998e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.627203  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2621  rubisco activation protein CbbO  30.84 
 
 
785 aa  167  4e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.808278 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1975  nitric oxide reductase activation protein  32.67 
 
 
786 aa  166  9e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3133  von Willebrand factor type A  32.67 
 
 
1006 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2839  von Willebrand factor, type A  35.55 
 
 
793 aa  165  3e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0872  von Willebrand factor type A  34.21 
 
 
773 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.743934  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0430  von Willebrand factor, type A  30.23 
 
 
777 aa  164  5.0000000000000005e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.898642  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4345  von Willebrand factor, type A  32 
 
 
802 aa  162  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.961605  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2636  rubisco activation protein cbbO  35.23 
 
 
773 aa  162  2e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1498  von Willebrand factor, type A  31.37 
 
 
785 aa  161  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0704487  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2754  cbbO protein  35.18 
 
 
778 aa  155  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.471735  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0422  von Willebrand factor, type A  33.33 
 
 
757 aa  151  3e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1976  von Willebrand factor, type A  35.95 
 
 
766 aa  149  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3765  von Willebrand factor type A  34.92 
 
 
749 aa  141  3e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.262699 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1965  hypothetical protein  31.6 
 
 
769 aa  140  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1588  von Willebrand factor type A  36.3 
 
 
610 aa  137  7.000000000000001e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.778947  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0910  von Willebrand factor type A  31.08 
 
 
788 aa  136  9.999999999999999e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2683  von Willebrand factor type A  36.33 
 
 
913 aa  136  9.999999999999999e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3639  von Willebrand factor type A  31.17 
 
 
578 aa  134  3.9999999999999996e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0411957  normal  0.0746298 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3118  von Willebrand factor type A  33.79 
 
 
605 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4903  von Willebrand factor, type A  32.35 
 
 
517 aa  120  6e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4197  von Willebrand factor, type A  31.4 
 
 
570 aa  114  5e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51911  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2457  von Willebrand factor, type A  32.43 
 
 
576 aa  114  7.000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.867723 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3727  von Willebrand factor, type A  29.21 
 
 
570 aa  113  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0342794  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3800  von Willebrand factor, type A  29.21 
 
 
570 aa  113  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00674568 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3739  von Willebrand factor, type A  28.89 
 
 
570 aa  111  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4156  von Willebrand factor, type A  27.62 
 
 
564 aa  109  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.149181  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2575  von Willebrand factor, type A  30.38 
 
 
571 aa  103  8e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319004  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4974  MorD  30.82 
 
 
510 aa  102  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228255  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4798  MorD  30.13 
 
 
510 aa  100  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.653276  normal  0.637418 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4417  MorD  30.13 
 
 
510 aa  99.8  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4504  MorD  30.13 
 
 
510 aa  99.8  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1773  von Willebrand factor, type A  28.52 
 
 
510 aa  99.8  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2582  von Willebrand factor, type A  30.03 
 
 
571 aa  99.8  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2537  von Willebrand factor, type A  30.03 
 
 
571 aa  99.8  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0698478  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3616  von Willebrand factor type A domain-containing protein  33.78 
 
 
562 aa  92.8  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.360736  normal  0.0799995 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1845  nitric oxide reductase activation protein-like  26.84 
 
 
519 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.296375 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0602  von Willebrand factor type A  30.73 
 
 
532 aa  67  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0536117 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0660  hypothetical protein  30.18 
 
 
627 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0978  hypothetical protein  26.35 
 
 
629 aa  48.1  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.827084  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4677  hypothetical protein  30.18 
 
 
627 aa  48.1  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.1809899999999999e-20 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0692  hypothetical protein  30.18 
 
 
627 aa  47.8  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0678  hypothetical protein  30.18 
 
 
626 aa  47.4  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000398257 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0623  hypothetical protein  30.18 
 
 
626 aa  47.4  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0534  hypothetical protein  30.18 
 
 
626 aa  47.4  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0534  von Willebrand factor type A domain-containing protein  30.18 
 
 
626 aa  47.4  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0590  hypothetical protein  30.18 
 
 
626 aa  47.4  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0537  von Willebrand factor type A  30.18 
 
 
627 aa  47  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0535  von Willebrand factor type A  30.36 
 
 
627 aa  47  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1682  Nitric oxide reductase activation protein-like protein  29.02 
 
 
612 aa  46.6  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0752  hypothetical protein  30.18 
 
 
627 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1498  hypothetical protein  25.4 
 
 
628 aa  45.8  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.239548  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1469  hypothetical protein  25.4 
 
 
628 aa  45.8  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2540  von Willebrand factor type A  27.27 
 
 
634 aa  44.7  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>