More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3128 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_3451  5'-Nucleotidase domain protein  63.94 
 
 		 573 aa  749    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3253  sulfur oxidation signal peptide protein  62.7 
 
 		 572 aa  749    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1032  5'-Nucleotidase domain protein  71.43 
 
 		 576 aa  867    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.556642  normal  0.811589 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0816  5'-Nucleotidase domain protein  54.25 
 
 		 586 aa  637    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.24833  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3128  sulfate thiol esterase SoxB  100 
 
 		 573 aa  1185    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.304524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3249  sulfate thiol esterase SoxB  71.85 
 
 		 573 aa  858    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0563  sulfate thiol esterase SoxB  68.17 
 
 		 610 aa  822    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000246299  normal  0.545825 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1927  twin-arginine translocation pathway signal  55.27 
 
 		 585 aa  650    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3778  5'-nucleotidase domain-containing protein  67.7 
 
 		 580 aa  820    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2279  sulfate thiol esterase SoxB  65.73 
 
 		 571 aa  785    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2223  5'-Nucleotidase domain protein  59.6 
 
 		 596 aa  689    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2625  sulfate thiol esterase SoxB  70.1 
 
 		 574 aa  853    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.561369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3417  sulfate thiol esterase SoxB  68.65 
 
 		 574 aa  829    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1596  5'-Nucleotidase domain protein  66.96 
 
 		 570 aa  799    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.283775  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1672  5'-Nucleotidase domain protein  66.43 
 
 		 571 aa  795    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0627  5'-Nucleotidase domain protein  57.26 
 
 		 603 aa  656    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.367803 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1150  5'-Nucleotidase domain protein  55.96 
 
 		 577 aa  695    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000459069 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0807  5'-nucleotidase domain-containing protein  70.91 
 
 		 576 aa  856    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1916  5'-Nucleotidase domain protein  55.95 
 
 		 600 aa  701    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3123  5'-Nucleotidase domain protein  63.59 
 
 		 573 aa  732    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2432  sulfate thiol esterase SoxB  67.13 
 
 		 575 aa  806    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3671  twin-arginine translocation pathway signal  53.82 
 
 		 580 aa  599  1e-170  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1549  Sulfate thiol esterase  50.55 
 
 		 636 aa  597  1e-169  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229205  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1905  sulfate thiol esterase SoxB  52.77 
 
 		 565 aa  589  1e-167  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0692  sulfate thiol esterase SoxB  51.1 
 
 		 583 aa  586  1e-166  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1939  5'-nucleotidase domain-containing protein  49.83 
 
 		 581 aa  573  1.0000000000000001e-162  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0141  5'-nucleotidase domain-containing protein  51.77 
 
 		 592 aa  565  1e-160  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3914  hypothetical protein  48.86 
 
 		 563 aa  558  1e-157  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.321338 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4154  5'-nucleotidase domain-containing protein  48.12 
 
 		 564 aa  556  1e-157  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2803  putative 5'-nucleotidase  49.55 
 
 		 564 aa  545  1e-153  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.240271 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3675  sulfate thiol esterase SoxB  48.82 
 
 		 553 aa  538  9.999999999999999e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0941118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4958  5'-Nucleotidase domain protein  49.02 
 
 		 565 aa  538  1e-151  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.416285  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1519  5'-nucleotidase domain-containing protein  49.02 
 
 		 563 aa  538  1e-151  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.661634 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4369  twin-arginine translocation pathway signal  47.42 
 
 		 578 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4160  5'-Nucleotidase domain protein  47.54 
 
 		 559 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4253  twin-arginine translocation pathway signal  48.04 
 
 		 565 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.417802  normal  0.174095 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3048  5'-nucleotidase domain-containing protein  47.65 
 
 		 578 aa  507  9.999999999999999e-143  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0513  5'-Nucleotidase domain protein  45.21 
 
 		 577 aa  502  1e-141  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000761029  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0264  sulfate thiol esterase SoxB  39.89 
 
 		 587 aa  439  9.999999999999999e-123  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000000260669  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2861  5'-Nucleotidase domain-containing protein  40.43 
 
 		 568 aa  419  1e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3451  hypothetical protein  37.32 
 
 		 572 aa  385  1e-105  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1467  5'-Nucleotidase domain protein  37.2 
 
 		 579 aa  367  1e-100  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00451887  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1173  5'-Nucleotidase domain protein  30.18 
 
 		 482 aa  201  3e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0972  5'-Nucleotidase domain protein  29.59 
 
 		 481 aa  197  5.000000000000001e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.305687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0467  5'-nucleotidase domain-containing protein  29.08 
 
 		 479 aa  195  2e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11803  5'-nucleotidase  27.05 
 
 		 552 aa  156  1e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1292  putative 5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase  25.78 
 
 		 595 aa  145  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.519034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1794  5'-nucleotidase  29.09 
 
 		 504 aa  140  8.999999999999999e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2012  putative esterase  27.34 
 
 		 713 aa  139  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1176  metallophosphoesterase  24.69 
 
 		 505 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1621  5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase  25.14 
 
 		 577 aa  127  7e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.637652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0741  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.73 
 
 		 508 aa  125  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0181082  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3035  5'-Nucleotidase domain protein  21.9 
 
 		 594 aa  119  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0123  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  26.84 
 
 		 515 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4182  lipoprotein UxpA  24.11 
 
 		 546 aa  115  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4030  5'-Nucleotidase domain protein  25.3 
 
 		 530 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000108753  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0320  5'-Nucleotidase domain protein  25.59 
 
 		 489 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000730834  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1085  lipoprotein UxpA  23.34 
 
 		 546 aa  110  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2751  5'-nucleotidase-like  27.03 
 
 		 520 aa  107  5e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.273963  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1041  lipoprotein UxpA  23.42 
 
 		 546 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0601  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  25.68 
 
 		 503 aa  99  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.251428  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4436  5'-Nucleotidase domain protein  24.94 
 
 		 518 aa  99  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4322  5'-Nucleotidase domain protein  24.94 
 
 		 518 aa  99.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4352  5'-Nucleotidase domain protein  24.94 
 
 		 518 aa  97.8  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4507  5'-Nucleotidase domain-containing protein  24.72 
 
 		 518 aa  97.4  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1044  lipoprotein UxpA  22.39 
 
 		 550 aa  96.7  9e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0577127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4439  5'-Nucleotidase domain-containing protein  24.94 
 
 		 518 aa  96.3  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.088476 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0998  5'-Nucleotidase domain protein  27.84 
 
 		 515 aa  95.1  3e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0941  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  24.6 
 
 		 508 aa  93.6  9e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0919  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  24.6 
 
 		 508 aa  93.6  9e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.455321  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0581  5'-Nucleotidase domain protein  23.54 
 
 		 504 aa  93.6  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2582  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.05 
 
 		 505 aa  92.4  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.270196  normal  0.151429 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1442  2',3'-cyclic-nucleotide 2'-phosphodiesterase  25.38 
 
 		 547 aa  92  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4363  cell wall anchor domain-containing protein  22.99 
 
 		 633 aa  90.9  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0272  5'-nucleotidase domain-containing protein  23.28 
 
 		 1284 aa  90.1  9e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0037  5'-Nucleotidase domain protein  25.06 
 
 		 523 aa  89  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.225236 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2615  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.11 
 
 		 523 aa  89.4  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2645  5'-Nucleotidase domain-containing protein  24.79 
 
 		 555 aa  88.6  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.974369 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0038  5'-Nucleotidase domain protein  24.6 
 
 		 520 aa  88.6  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0037  5'-Nucleotidase domain protein  24.6 
 
 		 520 aa  88.6  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.361552  normal  0.180073 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0036  5'-Nucleotidase domain-containing protein  24.6 
 
 		 523 aa  88.2  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0257777 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4386  serine/threonine protein phosphatase family protein  23.36 
 
 		 516 aa  87.8  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2961  5'-nucleotidase-like  23.6 
 
 		 532 aa  87  8e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.969714  normal  0.02857 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2207  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  25.73 
 
 		 1215 aa  87  8e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0955  5'-nucleotidase  26.22 
 
 		 523 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.488215  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1750  5'-nucleotidase  24.11 
 
 		 500 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.398789 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4388  serine/threonine protein phosphatase family protein  24.72 
 
 		 517 aa  86.3  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.693263 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2375  5'-Nucleotidase domain protein  24.3 
 
 		 581 aa  85.5  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2882  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.21 
 
 		 533 aa  85.1  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3303  5'-Nucleotidase domain protein  26 
 
 		 659 aa  84.3  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.737364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2519  5'-Nucleotidase domain protein  22 
 
 		 523 aa  84  0.000000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1753  UshA protein  25 
 
 		 508 aa  83.6  0.000000000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1918  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  25.5 
 
 		 1202 aa  83.6  0.000000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0849  5'-Nucleotidase domain protein  25.89 
 
 		 529 aa  82.8  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0123925  normal  0.173542 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3605  5'-Nucleotidase domain protein  25.41 
 
 		 657 aa  82.8  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1472  5'-nucleotidase  23.44 
 
 		 505 aa  82  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.633021  normal  0.092078 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2690  5'-nucleotidase domain-containing protein  24.8 
 
 		 627 aa  82  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.526931  normal  0.659093 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4169  5'-nucleotidase family protein  23.81 
 
 		 529 aa  80.5  0.00000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1286  putative 5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase  22.59 
 
 		 687 aa  80.5  0.00000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4233  5'-nucleotidase family protein  23.6 
 
 		 529 aa  80.5  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>