129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1575 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1571  cytochrome c oxidase, subunit II  100 
 
 		 760 aa  1575    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.915615 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1575  cytochrome c oxidase, subunit II  100 
 
 		 760 aa  1575    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1298  nitrous-oxide reductase  60.88 
 
 		 865 aa  921    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000502464  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1770  nitrous-oxide reductase NosZ  58.56 
 
 		 864 aa  925    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0440  nitrous-oxide reductase  60.9 
 
 		 864 aa  937    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.136119  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0010  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  60.34 
 
 		 863 aa  949    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0271061  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1729  methyl-accepting chemotaxis protein  60.11 
 
 		 862 aa  952    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.371209  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2012  Nitrous-oxide reductase  57.53 
 
 		 663 aa  769    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1928  nitrous-oxide reductase  46.93 
 
 		 673 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1803  nitrous-oxide reductase  44.44 
 
 		 648 aa  493  9.999999999999999e-139  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.625051  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1556  Nitrous-oxide reductase  44.41 
 
 		 620 aa  489  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.298548  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1461  Nitrous-oxide reductase  44.57 
 
 		 620 aa  490  1e-137  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0244  nitrous-oxide reductase  43.91 
 
 		 647 aa  487  1e-136  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.677359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2402  nitrous-oxide reductase  43.24 
 
 		 620 aa  478  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00162507  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0209  Nitrous-oxide reductase  40.98 
 
 		 632 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0693  Nitrous-oxide reductase  40.06 
 
 		 658 aa  451  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.112553  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1165  nitrous-oxide reductase  34.68 
 
 		 699 aa  326  1e-87  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.804263  normal  0.124168 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3400  nitrous-oxide reductase  35.92 
 
 		 628 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00206231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1428  nitrous-oxide reductase  34.79 
 
 		 630 aa  317  6e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2219  nitrous-oxide reductase  33.18 
 
 		 628 aa  314  3.9999999999999997e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000181055  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3078  nitrous-oxide reductase  35.02 
 
 		 631 aa  313  6.999999999999999e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1074  nitrous-oxide reductase  33.92 
 
 		 640 aa  310  8e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.198434  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4732  nitrous-oxide reductase  33.84 
 
 		 617 aa  306  8.000000000000001e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2861  nitrous-oxide reductase  33.49 
 
 		 645 aa  301  3e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.7379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4219  nitrous-oxide reductase  34.13 
 
 		 652 aa  295  2e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.522351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1738  nitrous-oxide reductase  33.23 
 
 		 636 aa  294  5e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2325  nitrous-oxide reductase  33.97 
 
 		 690 aa  290  7e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0428  nitrous-oxide reductase  32.64 
 
 		 649 aa  290  9e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.859318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20200  nitrous-oxide reductase  32.64 
 
 		 636 aa  289  1e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.89249 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2564  nitrous-oxide reductase  33.6 
 
 		 628 aa  289  1e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.164032  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0275  nitrous-oxide reductase  33.39 
 
 		 639 aa  288  2e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.275953  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6008  nitrous-oxide reductase  33.49 
 
 		 639 aa  288  4e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180938  normal  0.0225703 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4346  nitrous-oxide reductase  33.33 
 
 		 638 aa  287  4e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0394445  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3194  nitrous-oxide reductase  32.85 
 
 		 647 aa  286  9e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3142  nitrous-oxide reductase  33.23 
 
 		 648 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0251  nitrous-oxide reductase  33.23 
 
 		 639 aa  285  2.0000000000000002e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2351  nitrous-oxide reductase  32 
 
 		 645 aa  284  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3199  nitrous-oxide reductase  34.3 
 
 		 650 aa  282  1e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.324425  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2115  nitrous-oxide reductase  33.44 
 
 		 655 aa  283  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.62565  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2255  nitrous-oxide reductase  33.44 
 
 		 691 aa  282  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2060  nitrous-oxide reductase  33.44 
 
 		 693 aa  282  2e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.840269  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1389  nitrous-oxide reductase  33.92 
 
 		 646 aa  280  6e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0995  nitrous-oxide reductase  33.28 
 
 		 660 aa  280  1e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.599003  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3319  nitrous-oxide reductase  33.17 
 
 		 644 aa  277  6e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0698213  normal  0.2184 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1139  nitrous-oxide reductase  34.2 
 
 		 646 aa  273  1e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.494075 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1060  nitrous-oxide reductase  34.2 
 
 		 645 aa  270  7e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.620388  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0664  nitrous-oxide reductase  32.58 
 
 		 652 aa  268  2e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4059  nitrous-oxide reductase  33.66 
 
 		 649 aa  267  5e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00566192  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4171  nitrous-oxide reductase  33.66 
 
 		 649 aa  267  5e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1483  nitrous-oxide reductase  32.41 
 
 		 644 aa  265  2e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.150565 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4917  nitrous-oxide reductase  33.33 
 
 		 646 aa  265  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0125108 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1368  nitrous-oxide reductase  33.44 
 
 		 646 aa  263  8.999999999999999e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.90287 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0697  cytochrome c oxidase, subunit II  34.12 
 
 		 322 aa  57.4  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4435  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  34.62 
 
 		 316 aa  57  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3802  cytochrome c oxidase subunit II  27.44 
 
 		 262 aa  57  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1588  cytochrome c oxidase, subunit II  37.5 
 
 		 342 aa  52.4  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0464  cytochrome c oxidase subunit II  34.94 
 
 		 266 aa  51.6  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0167  putative cytochrome c oxidase subunit II  30.95 
 
 		 371 aa  51.6  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.26265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0096  cytochrome c oxidase, subunit II  36.9 
 
 		 334 aa  51.6  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.296292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1826  cytochrome c oxidase subunit II  33.33 
 
 		 160 aa  51.2  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00813215  normal  0.126007 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2967  cytochrome c oxidase subunit II  38.75 
 
 		 162 aa  51.6  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000376263 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0437  cytochrome c oxidase, subunit II  28.8 
 
 		 267 aa  51.2  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0468935 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1899  cytochrome c oxidase subunit II  36.25 
 
 		 156 aa  50.8  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.71816  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0252  cytochrome c oxidase, subunit II  30.56 
 
 		 302 aa  50.4  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.0258846 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0599  cytochrome c oxidase subunit II  30.38 
 
 		 124 aa  50.4  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5817  cytochrome c oxidase, subunit II  35 
 
 		 310 aa  50.4  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.156146  hitchhiker  0.00847969 
 
 
-
 
NC_003296  RS02212  putative cytochrome C oxidase polypeptide II oxidoreductase protein  31.87 
 
 		 125 aa  49.7  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2641  cytochrome c oxidase subunit II  28.16 
 
 		 321 aa  49.7  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.398022  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1779  cytochrome c oxidase, subunit II  32 
 
 		 339 aa  49.7  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0848  cytochrome c oxidase subunit II  30.86 
 
 		 351 aa  49.7  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2706  cytochrome c oxidase, subunit II  36.07 
 
 		 389 aa  50.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2385  cytochrome c oxidase subunit II  32.65 
 
 		 156 aa  48.5  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2996  cytochrome c oxidase, subunit II  30.3 
 
 		 329 aa  48.5  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.941612  hitchhiker  0.00487692 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  34.43 
 
 		 314 aa  48.1  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548982  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4792  cytochrome c oxidase, subunit II  30.48 
 
 		 354 aa  48.1  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280165  normal  0.517537 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  28.57 
 
 		 321 aa  48.1  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.304556 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0446  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  32.89 
 
 		 324 aa  48.1  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.112901 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1618  cytochrome c oxidase subunit II  32.5 
 
 		 125 aa  47.8  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.464579 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0414  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  31.15 
 
 		 311 aa  47.4  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6886  cytochrome c oxidase, subunit II  37.29 
 
 		 313 aa  47.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2347  cytochrome c oxidase, subunit II  30.69 
 
 		 334 aa  47.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  35.53 
 
 		 367 aa  47.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5130  cytochrome c oxidase subunit II  27.07 
 
 		 384 aa  47  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1522  cytochrome c oxidase, subunit II  32.05 
 
 		 330 aa  47.4  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1954  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 290 aa  47  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000330547 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1408  cytochrome c oxidase family protein  32.5 
 
 		 141 aa  46.2  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0216619  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0528  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  28.89 
 
 		 355 aa  46.2  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2422  cytochrome c oxidase family protein  32.5 
 
 		 141 aa  46.2  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0608  cytochrome c oxidase subunit II  32 
 
 		 276 aa  46.2  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3795  cytochrome c oxidase subunit II  24.29 
 
 		 382 aa  46.6  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11170  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit II  29.33 
 
 		 315 aa  46.2  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.761021  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1899  cytochrome c oxidase family protein  32.5 
 
 		 141 aa  46.2  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06421  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  27.84 
 
 		 274 aa  46.6  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0878998 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3408  cytochrome c oxidase family protein  32.5 
 
 		 141 aa  46.2  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.181168  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2257  putative cytochrome c oxidase subunit  32.5 
 
 		 141 aa  46.2  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0923001  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2296  putative cytochrome c oxidase subunit  32.5 
 
 		 141 aa  46.2  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.375881  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1172  cytochrome c oxidase family protein  32.5 
 
 		 141 aa  46.2  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0182872  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1574  cytochrome c oxidase subunit II  33.33 
 
 		 168 aa  46.6  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4872  cytochrome c oxidase subunit II  24.29 
 
 		 382 aa  46.6  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.780427  normal  0.052805 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0783  cytochrome c oxidase, subunit II  29.27 
 
 		 372 aa  45.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>