54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1135 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1135  major facilitator transporter  100 
 
 		 388 aa  745    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.551185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2156  major facilitator transporter  78.75 
 
 		 391 aa  509  1e-143  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000582511 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0618  major facilitator superfamily MFS_1  72.47 
 
 		 391 aa  449  1e-125  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5067  MFS superfamily transporter  61.87 
 
 		 395 aa  396  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2542  major facilitator superfamily MFS_1  54.03 
 
 		 400 aa  309  5e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3632  major facilitator superfamily transporter  52.12 
 
 		 391 aa  307  2.0000000000000002e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1751  major facilitator superfamily MFS_1  53.91 
 
 		 401 aa  299  5e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.210188 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1044  major facilitator transporter  53.65 
 
 		 396 aa  294  2e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.122672 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2330  major facilitator transporter  48.31 
 
 		 386 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.077775  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3400  hypothetical protein  48.01 
 
 		 393 aa  268  2e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0535164 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0641  major facilitator transporter  44.07 
 
 		 408 aa  232  7.000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4993  major facilitator transporter  40.66 
 
 		 399 aa  199  7.999999999999999e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.691753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3142  hypothetical protein  41.55 
 
 		 400 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.856051  normal  0.126426 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3245  major facilitator transporter  38.6 
 
 		 411 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.178164  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3980  major facilitator transporter  39.26 
 
 		 411 aa  193  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.302905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1673  major facilitator superfamily MFS_1  37.43 
 
 		 391 aa  187  3e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4177  major facilitator transporter  34.56 
 
 		 405 aa  186  6e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0803  major facilitator superfamily MFS_1  35.58 
 
 		 415 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3349  major facilitator transporter  36.29 
 
 		 406 aa  169  9e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.242052 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5027  major facilitator superfamily MFS_1  36.1 
 
 		 414 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177434  normal  0.163656 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2043  major facilitator transporter  38.26 
 
 		 405 aa  163  4.0000000000000004e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4836  major facilitator superfamily MFS_1  37.36 
 
 		 423 aa  149  5e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0503623 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2491  major facilitator family transporter  29.21 
 
 		 420 aa  94.7  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2536  major facilitator transporter  27.98 
 
 		 414 aa  92.8  9e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1837  major facilitator superfamily MFS_1  25.82 
 
 		 417 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1564  major facilitator transporter  27.44 
 
 		 400 aa  77.4  0.0000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2676  major facilitator superfamily MFS_1  24.07 
 
 		 432 aa  75.5  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.164208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2246  major facilitator superfamily MFS_1  22.73 
 
 		 427 aa  75.1  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1368  major facilitator superfamily MFS_1  27.22 
 
 		 415 aa  70.1  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.16217  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3501  major facilitator transporter  25.76 
 
 		 429 aa  64.3  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0690392 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3530  major facilitator superfamily transporter 4- hydroxybenzoate transporter  33.11 
 
 		 464 aa  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244381  normal  0.102712 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3708  major facilitator superfamily transporter  34.17 
 
 		 441 aa  51.6  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0913  general substrate transporter  33.67 
 
 		 465 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0686  major facilitator superfamily MFS_1  23.42 
 
 		 411 aa  48.9  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.626773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1871  major facilitator transporter  26.68 
 
 		 423 aa  49.3  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00153919  normal  0.351915 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1099  MFS permease  29.24 
 
 		 420 aa  48.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00745709  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2097  major facilitator transporter  35.24 
 
 		 459 aa  47  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.201063 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0168  major facilitator transporter  24.16 
 
 		 426 aa  47.4  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3935  major facilitator transporter  25.84 
 
 		 431 aa  46.2  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2316  major facilitator superfamily MFS_1  25.76 
 
 		 446 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2453  major facilitator superfamily MFS_1  28.78 
 
 		 414 aa  46.2  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.21371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2219  major facilitator superfamily MFS_1  30.3 
 
 		 441 aa  46.2  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.200056 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3484  major facilitator superfamily MFS_1  30.59 
 
 		 438 aa  45.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5623  MFS family transporter  25.35 
 
 		 446 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  26.83 
 
 		 451 aa  44.3  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3370  major facilitator transporter  25.34 
 
 		 453 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278479  normal  0.891983 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3357  major facilitator transporter  24.9 
 
 		 423 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0473601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64750  putative MFS transporter  25.09 
 
 		 446 aa  43.9  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4376  major facilitator transporter  24.41 
 
 		 430 aa  43.5  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1735  major facilitator transporter  29.11 
 
 		 443 aa  43.5  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  23.8 
 
 		 448 aa  43.5  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5803  major facilitator transporter  24.41 
 
 		 430 aa  42.7  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5057  major facilitator transporter  24.41 
 
 		 430 aa  42.7  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.195392  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5027  major facilitator transporter  30.56 
 
 		 457 aa  42.7  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>