More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0083 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0083  Beta-lactamase-like  100 
 
 		 304 aa  619  1e-176  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0756  beta-lactamase domain protein  52.51 
 
 		 306 aa  328  7e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0157  Beta-lactamase-like  48.81 
 
 		 314 aa  259  4e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0258  putative beta lactamase protein  46.95 
 
 		 319 aa  258  9e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.11853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4226  beta-lactamase-like  44.55 
 
 		 306 aa  258  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.733966  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4274  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  48.37 
 
 		 306 aa  248  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.050684 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0118  beta-lactamase domain protein  44.27 
 
 		 317 aa  247  2e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.464415 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0431  beta-lactamase domain-containing protein  43.23 
 
 		 309 aa  246  4.9999999999999997e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0436  beta-lactamase domain protein  47.97 
 
 		 306 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0161  beta-lactamase domain-containing protein  47.54 
 
 		 306 aa  238  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0111  beta-lactamase domain protein  45.31 
 
 		 317 aa  236  4e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.524145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0121  beta-lactamase-like protein  47.99 
 
 		 309 aa  232  7.000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.381436  normal  0.658094 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4770  beta-lactamase domain protein  41.47 
 
 		 309 aa  226  3e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2059  beta-lactamase domain-containing protein  44.75 
 
 		 310 aa  225  8e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0322253 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4202  beta-lactamase domain-containing protein  42.03 
 
 		 317 aa  222  4.9999999999999996e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0515  beta-lactamase domain-containing protein  44 
 
 		 308 aa  222  4.9999999999999996e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0129365 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3580  beta-lactamase-like  43.3 
 
 		 308 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1264  beta-lactamase domain-containing protein  42.14 
 
 		 319 aa  219  3.9999999999999997e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0583  beta-lactamase domain-containing protein  42.26 
 
 		 307 aa  217  2e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.266418 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0531  beta-lactamase domain protein  43.33 
 
 		 308 aa  216  5e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1288  beta-lactamase-like protein  28.86 
 
 		 329 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  26.83 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1986  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.67 
 
 		 278 aa  67  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4113  beta-lactamase domain protein  24.12 
 
 		 355 aa  66.6  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.011437  normal  0.053603 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1494  beta-lactamase domain-containing protein  27.71 
 
 		 307 aa  66.2  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.321503  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2064  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.37 
 
 		 257 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.455867  normal  0.0515167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1663  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.67 
 
 		 242 aa  64.7  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.44689 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0069  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.51 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  29.96 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0467  metallo-beta-lactamase family protein  24.15 
 
 		 262 aa  63.9  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.56187 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2769  metallo-beta-lactamase family protein  29.89 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0093  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.66 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.117082 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3993  beta-lactamase domain-containing protein  28.4 
 
 		 321 aa  63.2  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000582662 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1321  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.66 
 
 		 254 aa  61.2  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.47741  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0415  beta-lactamase domain protein  31.44 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.354703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12170  beta-lactamase domain protein  27.88 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265397  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2184  beta-lactamase domain-containing protein  33.54 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0861591  normal  0.0986326 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0614  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.51 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.362443  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2186  beta-lactamase domain protein  28.32 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.704345 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  25 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0373  beta-lactamase-like protein  27.83 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.717136 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1077  beta-lactamase domain protein  31.67 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1171  beta-lactamase domain protein  26.94 
 
 		 303 aa  58.9  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4394  beta-lactamase domain protein  31.9 
 
 		 304 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0859  metallo-beta-lactamase family protein  27.27 
 
 		 209 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3948  beta-lactamase domain-containing protein  29.41 
 
 		 352 aa  58.5  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.288018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3270  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.65 
 
 		 256 aa  58.9  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0508  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.05 
 
 		 255 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.11609  normal  0.0226917 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1578  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.2 
 
 		 256 aa  58.5  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156565 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1731  beta-lactamase domain protein  26.58 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00010066  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2629  Beta-lactamase-like  27.71 
 
 		 342 aa  58.2  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4036  glyoxalase II  30.51 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4375  metallo-beta-lactamase family protein  27.27 
 
 		 209 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2691  putative hydroxyacylglutathione hydrolase  29.25 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.25235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1446  beta-lactamase domain-containing protein  30.65 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2026  beta-lactamase domain protein  29.3 
 
 		 209 aa  58.2  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000455404 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04020  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  28.57 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.626574 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0466  hydroxyacylglutathione hydrolase  26.27 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.991116  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1308  beta-lactamase domain-containing protein  24.51 
 
 		 246 aa  57.4  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0215  beta-lactamase domain-containing protein  28.31 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.755925 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.31 
 
 		 215 aa  57  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.31 
 
 		 215 aa  57  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  29.05 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.31 
 
 		 215 aa  57  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.31 
 
 		 215 aa  57  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.31 
 
 		 215 aa  57  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_002950  PG1306  metallo-beta-lactamase family protein  28.64 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1462  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.39 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0144845  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0780  beta-lactamase domain-containing protein  26.03 
 
 		 287 aa  56.2  0.0000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.63 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1678  hydroxyacylglutathione hydrolase  27.37 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  30.46 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0390  beta-lactamase domain protein  23.88 
 
 		 318 aa  56.2  0.0000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2327  beta-lactamase domain protein  27.61 
 
 		 319 aa  56.2  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4346  beta-lactamase domain protein  32.17 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3127  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 310 aa  55.8  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.257865  normal  0.300589 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5069  beta-lactamase domain protein  27.03 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.137937  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1469  beta-lactamase domain-containing protein  22.69 
 
 		 321 aa  55.8  0.0000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7609  putative hydroxyacylglutathione hydrolase (glyoxalase II)  27.73 
 
 		 255 aa  55.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0185313  normal  0.217404 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2901  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 310 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.605946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1522  Beta-lactamase-like  28.08 
 
 		 214 aa  55.1  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2734  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 		 214 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  31.68 
 
 		 207 aa  55.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1863  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.38 
 
 		 260 aa  55.1  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.255866  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1936  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  28.38 
 
 		 257 aa  55.1  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  29.89 
 
 		 215 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4003  metallo-beta-lactamase family protein  26.67 
 
 		 209 aa  54.3  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1257  hydroxyacylglutathione hydrolase (glyoxalase II)  25.61 
 
 		 254 aa  55.1  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0923  hydroxyacylglutathione hydrolase  27.97 
 
 		 260 aa  54.7  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.319486  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2552  hydroxyacylglutathione hydrolase  26.72 
 
 		 256 aa  54.7  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.964384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0253  metallo-beta-lactamase family protein  24.81 
 
 		 365 aa  54.7  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.921693 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1975  hydroxyacylglutathione hydrolase  26.57 
 
 		 259 aa  55.1  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  29.89 
 
 		 215 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  26.36 
 
 		 209 aa  54.7  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  29.89 
 
 		 215 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3024  beta-lactamase domain protein  31.9 
 
 		 310 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0101087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1625  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 		 214 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.224285  normal  0.185558 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  29.89 
 
 		 215 aa  54.3  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2853  beta-lactamase domain protein  27.88 
 
 		 210 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5378  beta-lactamase domain protein  30.39 
 
 		 293 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13255  normal  0.647715 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  29.89 
 
 		 215 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>