More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4804 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4804  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 325 aa  657    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2246  alpha/beta hydrolase fold protein  68.08 
 
 		 311 aa  425  1e-118  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.1275  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2756  alpha/beta hydrolase fold  67.97 
 
 		 311 aa  421  1e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.623251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1074  alpha/beta hydrolase fold  61.54 
 
 		 313 aa  382  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253414  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1153  alpha/beta hydrolase fold  67.1 
 
 		 307 aa  378  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1589  alpha/beta hydrolase fold  56.43 
 
 		 343 aa  374  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3775  alpha/beta hydrolase fold protein  61.27 
 
 		 309 aa  362  5.0000000000000005e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2699  alpha/beta hydrolase  59.15 
 
 		 299 aa  358  9e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2772  putative hydrolase protein  50.16 
 
 		 312 aa  296  2e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1074  alpha/beta hydrolase fold protein  50.33 
 
 		 305 aa  287  2e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.444129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1098  Alpha/beta hydrolase fold  50.33 
 
 		 297 aa  287  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0978  alpha/beta hydrolase fold  50.17 
 
 		 305 aa  285  8e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.754776  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1135  putative hydrolase protein  49.51 
 
 		 307 aa  268  1e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1062  alpha/beta hydrolase fold  51.83 
 
 		 297 aa  266  4e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00192187  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1684  alpha/beta fold family hydrolase  47.52 
 
 		 300 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.163104  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2704  alpha/beta fold family hydrolase  47.52 
 
 		 340 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3131  alpha/beta fold family hydrolase  47.52 
 
 		 296 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2571  alpha/beta fold family hydrolase  47.52 
 
 		 349 aa  250  2e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1459  alpha/beta fold family hydrolase  47.52 
 
 		 296 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2625  alpha/beta fold family hydrolase  47.52 
 
 		 296 aa  250  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738195  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2186  alpha/beta fold family hydrolase  47.19 
 
 		 296 aa  246  4e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1900  alpha/beta fold family hydrolase  46.86 
 
 		 296 aa  245  6e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1767  alpha/beta hydrolase fold  46.58 
 
 		 339 aa  241  1e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00963183 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2138  alpha/beta hydrolase fold  45.87 
 
 		 296 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2011  alpha/beta hydrolase fold  45.54 
 
 		 296 aa  239  4e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000219515 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2119  alpha/beta hydrolase fold  44.88 
 
 		 296 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0124464 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5407  Alpha/beta hydrolase  44.88 
 
 		 296 aa  231  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.632759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5976  alpha/beta hydrolase fold  44.55 
 
 		 296 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.609999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2101  alpha/beta hydrolase fold  44.55 
 
 		 296 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1579  putative hydrolase  46.38 
 
 		 294 aa  229  7e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.144323  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2554  alpha/beta hydrolase fold  45.39 
 
 		 294 aa  228  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000366635  normal  0.152292 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1173  alpha/beta hydrolase fold  45.21 
 
 		 296 aa  226  3e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.95564  decreased coverage  0.000000135804 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1433  alpha/beta hydrolase fold protein  44.12 
 
 		 302 aa  212  7e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0363  Alpha/beta hydrolase fold  38.92 
 
 		 295 aa  192  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.176486  unclonable  0.0000000552802 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2400  alpha/beta hydrolase fold  39.22 
 
 		 309 aa  186  5e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3230  Alpha/beta hydrolase fold  37.42 
 
 		 289 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.95582  normal  0.900687 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0437  alpha/beta hydrolase fold protein  39.1 
 
 		 300 aa  181  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.885291  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3251  alpha/beta hydrolase fold  32.55 
 
 		 292 aa  130  4.0000000000000003e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0874027  normal  0.232162 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4707  alpha/beta hydrolase fold protein  36.18 
 
 		 289 aa  130  4.0000000000000003e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  31.68 
 
 		 289 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  31.21 
 
 		 289 aa  112  7.000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 		 327 aa  107  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  29.1 
 
 		 300 aa  105  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  30.13 
 
 		 285 aa  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0691  alpha/beta hydrolase  28.96 
 
 		 290 aa  82  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.363782  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2483  alpha/beta hydrolase fold  37.04 
 
 		 359 aa  80.1  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.436597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4953  alpha/beta hydrolase fold  27.95 
 
 		 360 aa  78.2  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45778  predicted protein  26.21 
 
 		 359 aa  75.9  0.0000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2805  alpha/beta hydrolase fold  23.3 
 
 		 315 aa  75.1  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.011133  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  32.33 
 
 		 2762 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1935  alpha/beta fold family hydrolase  32.93 
 
 		 311 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1572  alpha/beta hydrolase fold  35.1 
 
 		 306 aa  73.2  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1897  alpha/beta hydrolase fold  31.15 
 
 		 288 aa  72.8  0.000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0651937  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01378  hypothetical protein  35 
 
 		 284 aa  71.6  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1890  alpha/beta hydrolase fold  31.15 
 
 		 288 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0538139  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2027  Alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 		 284 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.56393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2470  alpha/beta hydrolase  28.15 
 
 		 289 aa  70.5  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.890486  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2582  alpha/beta fold family hydrolase  29.08 
 
 		 288 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1863  alpha/beta hydrolase fold  30.6 
 
 		 288 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.164632  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2429  alpha/beta hydrolase fold protein  30.6 
 
 		 288 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0133787  normal  0.21299 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10140  alpha/beta hydrolase  30.58 
 
 		 300 aa  68.6  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0243415  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2178  alpha/beta hydrolase fold  30.72 
 
 		 288 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.100362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2255  alpha/beta hydrolase fold  30.72 
 
 		 288 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.170585  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1408  hypothetical protein  24.68 
 
 		 283 aa  68.2  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0907  putative hydrolase  26.64 
 
 		 289 aa  67.8  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43540  putative hydrolase  35.06 
 
 		 286 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1760  alpha/beta hydrolase fold  32.93 
 
 		 288 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0231247  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1914  alpha/beta fold family hydrolase  37.38 
 
 		 243 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1366  alpha/beta hydrolase fold  25.96 
 
 		 291 aa  67  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3651  putative hydrolase  35.37 
 
 		 286 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.403227  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1655  alpha/beta hydrolase fold  39.84 
 
 		 331 aa  66.6  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2124  alpha/beta hydrolase fold  28.31 
 
 		 294 aa  65.9  0.0000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321379 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2687  alpha/beta hydrolase fold  32.37 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.646881 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5050  alpha/beta hydrolase fold  33.71 
 
 		 243 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1624  alpha/beta hydrolase fold  24.64 
 
 		 306 aa  65.5  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.142246  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2387  alpha/beta hydrolase fold  30.12 
 
 		 288 aa  65.5  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0869571  normal  0.603358 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3158  alpha/beta hydrolase fold  26.26 
 
 		 297 aa  64.7  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0533  hypothetical protein  28 
 
 		 282 aa  65.1  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0509  hypothetical protein  28 
 
 		 282 aa  64.7  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1863  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 		 293 aa  64.7  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.302111  normal  0.224548 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1819  alpha/beta hydrolase fold  34.38 
 
 		 331 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.091231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2109  alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 		 294 aa  63.5  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.139583  normal  0.535795 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004091  predicted hydrolase/acyltransferase  29.79 
 
 		 284 aa  63.5  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2154  alpha/beta fold family hydrolase  27.53 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0592253  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1592  hypothetical protein  25.45 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2189  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 311 aa  63.2  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00113055  hitchhiker  0.000974583 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2449  alpha/beta hydrolase fold  38.4 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.21931  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3104  alpha/beta hydrolase fold  28.16 
 
 		 296 aa  63.5  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3489  alpha/beta hydrolase fold  27.73 
 
 		 284 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1703  alpha/beta hydrolase fold  27.73 
 
 		 284 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4719  alpha/beta hydrolase fold protein  28.43 
 
 		 282 aa  63.2  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1714  alpha/beta hydrolase fold  24.65 
 
 		 290 aa  62.8  0.000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3527  alpha/beta hydrolase fold protein  27.14 
 
 		 294 aa  62.8  0.000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0524  Alpha/beta hydrolase  45.21 
 
 		 246 aa  62  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0610982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0837  putative esterase  23.32 
 
 		 258 aa  62  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0579  alpha/beta hydrolase fold  30.29 
 
 		 302 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1058  alpha/beta hydrolase fold  30.29 
 
 		 302 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2009  alpha/beta hydrolase fold  25.47 
 
 		 294 aa  61.6  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2524  alpha/beta hydrolase fold  32.07 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  26.99 
 
 		 291 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>