More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3914 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_0095  aspartate aminotransferase  70.88 
 
 
530 aa  795    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0859207  normal  0.737001 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2709  aspartate aminotransferase  62.69 
 
 
541 aa  674    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.625011  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3914  aspartate aminotransferase  100 
 
 
531 aa  1088    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.550794  normal  0.103832 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1984  aspartate aminotransferase  61.67 
 
 
538 aa  659    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0142877 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3483  aspartate aminotransferase  69.04 
 
 
534 aa  770    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.284147  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0790  aspartate aminotransferase  59.89 
 
 
554 aa  634  1e-180  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.545983 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3891  aspartate aminotransferase  59.47 
 
 
554 aa  630  1e-179  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0621  aminotransferase class I and II  54.34 
 
 
530 aa  578  1e-164  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3840  aminotransferase class I and II  50.19 
 
 
548 aa  503  1e-141  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.157118  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1557  aspartate aminotransferase  48.58 
 
 
552 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.122519  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1258  aspartate aminotransferase  44.59 
 
 
540 aa  469  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000391079  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1946  aspartate aminotransferase  44.8 
 
 
589 aa  441  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.346248  normal  0.0292973 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0325  aspartate aminotransferase  42.29 
 
 
528 aa  421  1e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0327  aspartate aminotransferase  41.81 
 
 
528 aa  415  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1070  hypothetical protein  46.1 
 
 
159 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000222922  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07871  aminotransferase class-I  26.36 
 
 
393 aa  77.8  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.404062  hitchhiker  0.00724094 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  31.58 
 
 
404 aa  76.6  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1360  aminotransferase, class I and II  23.91 
 
 
397 aa  73.9  0.000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1755  aminotransferase, class I and II  24.62 
 
 
394 aa  72  0.00000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2238  aminotransferase class I and II  27.66 
 
 
396 aa  71.6  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.105743  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3596  L-aspartate aminotransferase  23.03 
 
 
390 aa  70.5  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2569  aminotransferase class I and II  28.93 
 
 
397 aa  70.5  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121169  normal  0.359659 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1545  aspartate aminotransferase  28.74 
 
 
423 aa  69.7  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0081  aminotransferase, class I and II  26.19 
 
 
398 aa  69.3  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0150  aminotransferase class I and II  28.1 
 
 
386 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.870631  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0041  aminotransferase class I and II  25.79 
 
 
402 aa  69.3  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.782752  normal  0.197817 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0630  aspartate aminotransferase  28.19 
 
 
394 aa  69.3  0.0000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3192  aminotransferase, class I and II  28.57 
 
 
399 aa  68.6  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.593441  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2204  aminotransferase class I and II  29.17 
 
 
390 aa  68.6  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81808 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2182  aminotransferase, class I and II  23.19 
 
 
405 aa  68.6  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100524  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1087  aminotransferase  28.38 
 
 
392 aa  68.2  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  28.19 
 
 
390 aa  67.4  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_89248  predicted protein  30.07 
 
 
452 aa  67.4  0.0000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.113989 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0073  hypothetical protein  28.67 
 
 
392 aa  67  0.0000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0549  aminotransferase class I and II  26.11 
 
 
401 aa  67  0.0000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1471  aspartate aminotransferase  28.15 
 
 
400 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.219389  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0085  hypothetical protein  28.67 
 
 
392 aa  66.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  27.59 
 
 
396 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2980  aminotransferase  29.14 
 
 
383 aa  66.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.289509  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1660  aminotransferase class I and II  24.55 
 
 
404 aa  66.6  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.582625 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1319  aminotransferase  22.29 
 
 
398 aa  65.5  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.399658  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0519  aminotransferase class I and II  26.04 
 
 
398 aa  65.5  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1760  aminotransferase class I and II  29.56 
 
 
393 aa  65.1  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4358  aminotransferase class I and II  28.24 
 
 
406 aa  65.1  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3007  hypothetical protein  27.05 
 
 
390 aa  65.5  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2069  aminotransferase, class I and II  26.97 
 
 
375 aa  65.1  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.708727 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1684  aspartate aminotransferase  29.86 
 
 
396 aa  65.1  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.121725  normal  0.0684909 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2664  aminotransferase class I and II  26.63 
 
 
393 aa  65.1  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0937488  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1745  aminotransferase class I and II  25.25 
 
 
393 aa  65.1  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0178  aminotransferase class I and II  23.99 
 
 
396 aa  65.1  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1903  aminotransferase, class I and II  24.44 
 
 
396 aa  64.7  0.000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1490  L-aspartate aminotransferase  25.26 
 
 
396 aa  64.7  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1623  aspartate aminotransferase  26.94 
 
 
397 aa  64.7  0.000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.399039  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0201  hypothetical protein  25 
 
 
396 aa  64.7  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.39659  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5045  hypothetical protein  26.9 
 
 
396 aa  64.3  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0165  aminotransferase, class I and II  20.36 
 
 
390 aa  64.3  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2564  aminotransferase class I and II  23.96 
 
 
386 aa  64.3  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5012  hypothetical protein  26.9 
 
 
396 aa  64.3  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5040  hypothetical protein  26.9 
 
 
396 aa  64.3  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4771  hypothetical protein  26.9 
 
 
396 aa  64.3  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4611  hypothetical protein  26.9 
 
 
396 aa  64.3  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4633  hypothetical protein  26.9 
 
 
396 aa  64.3  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5133  hypothetical protein  26.9 
 
 
396 aa  64.3  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0048  aminotransferase class I and II  22.85 
 
 
401 aa  64.3  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00536151  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1791  aminotransferase class I and II  31.36 
 
 
400 aa  63.9  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.033856 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1626  aminotransferase, class I and II  28.48 
 
 
383 aa  63.5  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.608674  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5033  hypothetical protein  24.47 
 
 
396 aa  63.5  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145667  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0323  aspartate aminotransferase  25.64 
 
 
417 aa  63.5  0.000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00219132  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0962  aminotransferase  28.8 
 
 
393 aa  63.5  0.000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.124285 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2839  aminotransferase class I and II  28.97 
 
 
395 aa  63.2  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00326737 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1411  aminotransferase class I and II  28.38 
 
 
393 aa  63.2  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0770  aminotransferase, class I and II  28.94 
 
 
397 aa  63.2  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0102863 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0798  aspartate aminotransferase  25.69 
 
 
387 aa  63.2  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14321  aminotransferases class-I  25 
 
 
392 aa  63.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2403  aminotransferase class I and II  22.38 
 
 
387 aa  62.8  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0215397  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1781  aminotransferase class I and II  24.14 
 
 
405 aa  63.2  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0832  aspartate aminotransferase  26.98 
 
 
384 aa  63.2  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0198108  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2798  aminotransferase class I and II  29.05 
 
 
396 aa  63.2  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1128  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  26.29 
 
 
394 aa  63.2  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2047  aminotransferase class I and II  28.38 
 
 
396 aa  63.5  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0730244  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7544  aspartate aminotransferase  26.87 
 
 
403 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1502  aminotransferase class I and II  29.44 
 
 
388 aa  62  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000290558  normal  0.783372 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1602  aminotransferase, class I and II  27.59 
 
 
397 aa  62.4  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0934572  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0865  aminotransferase  25.83 
 
 
381 aa  62.4  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.424405  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1014  aspartate aminotransferase  30.64 
 
 
400 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1495  aspartate aminotransferase  30.64 
 
 
400 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2066  aminotransferase class I and II  26.59 
 
 
400 aa  62  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0959735  normal  0.858432 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2022  aspartate aminotransferase  28.86 
 
 
393 aa  61.6  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0627  aminotransferase class I and II  28.42 
 
 
369 aa  61.6  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1427  hypothetical protein  28.47 
 
 
402 aa  62  0.00000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0489615 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0388  aminotransferase class I and II  26.9 
 
 
392 aa  61.6  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0701  aspartate aminotransferase  24 
 
 
392 aa  61.6  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1205  putative aspartate aminotransferase  29.87 
 
 
397 aa  62  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1377  aspartate aminotransferase  29.45 
 
 
400 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.489913  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2987  aminotransferase class I and II  24.42 
 
 
393 aa  61.6  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1687  aminotransferase class I and II  28.86 
 
 
393 aa  61.6  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3728  aminotransferase class I and II  27.62 
 
 
387 aa  61.2  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1200  aminotransferase  28.1 
 
 
393 aa  61.6  0.00000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.241319  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0707  aspartate aminotransferase  24 
 
 
392 aa  61.2  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.498645  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1729  aminotransferase  27.78 
 
 
385 aa  61.6  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118879  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>