More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1984 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3914  aspartate aminotransferase  61.67 
 
 		 531 aa  659    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.550794  normal  0.103832 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2709  aspartate aminotransferase  79.47 
 
 		 541 aa  885    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.625011  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0790  aspartate aminotransferase  73.21 
 
 		 554 aa  802    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.545983 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3891  aspartate aminotransferase  71.7 
 
 		 554 aa  793    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0095  aspartate aminotransferase  61.98 
 
 		 530 aa  675    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0859207  normal  0.737001 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1984  aspartate aminotransferase  100 
 
 		 538 aa  1109    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0142877 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3483  aspartate aminotransferase  63.98 
 
 		 534 aa  687    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.284147  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0621  aminotransferase class I and II  57.97 
 
 		 530 aa  622  1e-177  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1557  aspartate aminotransferase  51.97 
 
 		 552 aa  519  1e-146  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.122519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3840  aminotransferase class I and II  50.94 
 
 		 548 aa  508  9.999999999999999e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.157118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1258  aspartate aminotransferase  45.73 
 
 		 540 aa  466  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000391079  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1946  aspartate aminotransferase  47.03 
 
 		 589 aa  466  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.346248  normal  0.0292973 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0325  aspartate aminotransferase  43.4 
 
 		 528 aa  430  1e-119  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0327  aspartate aminotransferase  42.26 
 
 		 528 aa  423  1e-117  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1070  hypothetical protein  49.68 
 
 		 159 aa  146  1e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000222922  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1791  aminotransferase class I and II  31 
 
 		 400 aa  84  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.033856 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0073  hypothetical protein  24.62 
 
 		 392 aa  78.2  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0085  hypothetical protein  24.62 
 
 		 392 aa  77.4  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2344  aminotransferase class I and II  29.5 
 
 		 400 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2070  aminotransferase class I and II  29.5 
 
 		 400 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.117536 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1360  aminotransferase, class I and II  27.83 
 
 		 397 aa  75.1  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2233  aspartate aminotransferase  26.61 
 
 		 400 aa  74.7  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.117897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2030  aminotransferase class I and II  28.86 
 
 		 400 aa  74.7  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128582  normal  0.337144 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1241  aminotransferase class I and II  26.98 
 
 		 400 aa  73.9  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0312  aminotransferase class I and II  29.52 
 
 		 413 aa  73.9  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1414  aminotransferase class I and II  27.02 
 
 		 407 aa  73.6  0.000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.445663  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  31.33 
 
 		 404 aa  73.6  0.000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2069  aminotransferase, class I and II  28.95 
 
 		 375 aa  73.6  0.000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.708727 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1087  aminotransferase  24.81 
 
 		 392 aa  73.6  0.000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28200  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  26.95 
 
 		 379 aa  73.2  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000110278  normal  0.621857 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  26.28 
 
 		 390 aa  72.8  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1760  aminotransferase class I and II  23.99 
 
 		 393 aa  73.2  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2997  aspartate aminotransferase  31.87 
 
 		 400 aa  72.4  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308174  normal  0.423377 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2736  aspartate aminotransferase  31.87 
 
 		 400 aa  72.4  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0888724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_89248  predicted protein  27.91 
 
 		 452 aa  72  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.113989 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1801  aspartate aminotransferase  25.7 
 
 		 401 aa  71.6  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.81932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2569  aminotransferase class I and II  26.05 
 
 		 397 aa  72  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121169  normal  0.359659 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0313  aspartate aminotransferase  30.22 
 
 		 401 aa  71.6  0.00000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000311454  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1200  aminotransferase  28.86 
 
 		 393 aa  71.6  0.00000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.241319  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1545  aspartate aminotransferase  25.6 
 
 		 423 aa  71.2  0.00000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1924  aspartate aminotransferase  26.59 
 
 		 397 aa  70.9  0.00000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1684  aspartate aminotransferase  23.2 
 
 		 396 aa  70.9  0.00000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.121725  normal  0.0684909 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0630  aspartate aminotransferase  25.13 
 
 		 394 aa  70.9  0.00000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1755  aminotransferase, class I and II  22.9 
 
 		 394 aa  70.5  0.00000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2798  aminotransferase class I and II  31.47 
 
 		 396 aa  69.7  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2564  aminotransferase class I and II  33.33 
 
 		 386 aa  70.1  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1959  aminotransferase class I and II  28.71 
 
 		 400 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1135  aminotransferase  27.5 
 
 		 400 aa  69.7  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.309528  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1319  aminotransferase  22.4 
 
 		 398 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.399658  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2238  aminotransferase class I and II  27.43 
 
 		 396 aa  69.7  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.105743  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07350  putative aspartate aminotransferase  26.59 
 
 		 399 aa  69.7  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.95272  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0045  aromatic amino acid aminotransferase  29.94 
 
 		 391 aa  69.3  0.0000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1056  aspartate aminotransferase A  27.55 
 
 		 400 aa  68.9  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4119  aminotransferase  28.67 
 
 		 400 aa  68.9  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1729  aminotransferase  31.52 
 
 		 385 aa  69.3  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118879  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1128  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  31.49 
 
 		 394 aa  69.3  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1490  L-aspartate aminotransferase  26.98 
 
 		 396 aa  68.2  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1103  aspartate aminotransferase  28.43 
 
 		 400 aa  68.2  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3192  aminotransferase, class I and II  29.8 
 
 		 399 aa  68.6  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.593441  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7660  aspartate aminotransferase  25.89 
 
 		 404 aa  68.2  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.394739  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2107  aspartate aminotransferase  25.32 
 
 		 400 aa  68.6  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3626  aminotransferase  25.71 
 
 		 411 aa  68.6  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0179909  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  22.69 
 
 		 395 aa  68.6  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0798  aspartate aminotransferase  26.27 
 
 		 387 aa  68.2  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4122  aspartate aminotransferase  28.43 
 
 		 401 aa  67.8  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  31.13 
 
 		 396 aa  68.2  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1427  hypothetical protein  26.42 
 
 		 402 aa  68.2  0.0000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0489615 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8484  aminotransferase class I and II  24.74 
 
 		 409 aa  68.2  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245208  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3160  aminotransferase class I and II  27.88 
 
 		 410 aa  67.8  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1479  aspartate aminotransferase  25.28 
 
 		 400 aa  67.8  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0669082 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3821  aminotransferase class I and II  27.09 
 
 		 400 aa  67.8  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.292304  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0519  aminotransferase class I and II  28.93 
 
 		 398 aa  67.4  0.0000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0938  aminotransferase, class I and II  29.52 
 
 		 400 aa  67.4  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0881  aminotransferase, class I and II  26.94 
 
 		 402 aa  67.4  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1377  aromatic amino acid aminotransferase  28.57 
 
 		 400 aa  67.4  0.0000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.907839  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0994  aspartate aminotransferase  25.25 
 
 		 395 aa  67  0.0000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00992397  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3888  aminotransferase  27.13 
 
 		 406 aa  67.4  0.0000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1642  aspartate aminotransferase  26.01 
 
 		 397 aa  67.4  0.0000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1136  aspartate aminotransferase  25.25 
 
 		 395 aa  67  0.0000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.358682  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1627  aminotransferase, class I and II  26.28 
 
 		 393 aa  67  0.0000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.703964 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5040  hypothetical protein  26.92 
 
 		 396 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0111  putative aspartate transaminase  26.6 
 
 		 401 aa  66.6  0.000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4551  aspartate aminotransferase  24.14 
 
 		 402 aa  66.6  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.146004  normal  0.171022 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1297  aspartate aminotransferase  27.41 
 
 		 400 aa  66.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1747  aminotransferase, class I and II  27.19 
 
 		 396 aa  66.2  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07871  aminotransferase class-I  27.06 
 
 		 393 aa  66.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.404062  hitchhiker  0.00724094 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1034  aminotransferase  25.16 
 
 		 440 aa  66.2  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6368  aspartate aminotransferase  24.14 
 
 		 400 aa  66.6  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0412  aspartate aminotransferase  26.18 
 
 		 400 aa  66.6  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1838  aromatic amino acid aminotransferase  33.8 
 
 		 397 aa  66.6  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0863  aspartate aminotransferase  29.08 
 
 		 393 aa  66.6  0.000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.252217  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1248  aminotransferase  27.71 
 
 		 409 aa  65.9  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4771  hypothetical protein  26.5 
 
 		 396 aa  65.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4611  hypothetical protein  26.5 
 
 		 396 aa  65.9  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4633  hypothetical protein  26.5 
 
 		 396 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1569  aminotransferase  25.6 
 
 		 398 aa  66.2  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5133  hypothetical protein  26.5 
 
 		 396 aa  65.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0627  aminotransferase class I and II  25.15 
 
 		 369 aa  66.2  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0707  aspartate aminotransferase  26.67 
 
 		 392 aa  66.2  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.498645  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2839  aminotransferase class I and II  27.22 
 
 		 395 aa  65.9  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00326737 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>