More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1258 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1258  aspartate aminotransferase  100 
 
 		 540 aa  1108    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000391079  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3840  aminotransferase class I and II  52.85 
 
 		 548 aa  597  1e-169  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.157118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1946  aspartate aminotransferase  47.61 
 
 		 589 aa  532  1e-150  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.346248  normal  0.0292973 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1557  aspartate aminotransferase  47.18 
 
 		 552 aa  525  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.122519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3891  aspartate aminotransferase  45.97 
 
 		 554 aa  483  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0790  aspartate aminotransferase  46.04 
 
 		 554 aa  481  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.545983 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0095  aspartate aminotransferase  46.15 
 
 		 530 aa  474  1e-132  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0859207  normal  0.737001 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3914  aspartate aminotransferase  44.59 
 
 		 531 aa  469  1.0000000000000001e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.550794  normal  0.103832 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3483  aspartate aminotransferase  45.58 
 
 		 534 aa  466  9.999999999999999e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.284147  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1984  aspartate aminotransferase  45.73 
 
 		 538 aa  466  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0142877 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2709  aspartate aminotransferase  45.25 
 
 		 541 aa  460  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.625011  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0621  aminotransferase class I and II  44.2 
 
 		 530 aa  426  1e-118  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0325  aspartate aminotransferase  41.48 
 
 		 528 aa  401  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0327  aspartate aminotransferase  40.89 
 
 		 528 aa  392  1e-108  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1070  hypothetical protein  97.42 
 
 		 159 aa  314  1.9999999999999998e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000222922  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1128  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  26.47 
 
 		 394 aa  68.6  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2569  aminotransferase class I and II  27.34 
 
 		 397 aa  67.4  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121169  normal  0.359659 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07350  putative aspartate aminotransferase  24.36 
 
 		 399 aa  63.5  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.95272  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1629  aminotransferase, class I and II  29.25 
 
 		 389 aa  62.4  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0388  aminotransferase class I and II  26.88 
 
 		 392 aa  60.5  0.00000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0525  aspartate aminotransferase  24.77 
 
 		 397 aa  59.7  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0549  aminotransferase class I and II  28.29 
 
 		 401 aa  58.5  0.0000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2664  aminotransferase class I and II  21.99 
 
 		 393 aa  58.2  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0937488  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  24.7 
 
 		 404 aa  57.8  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3793  hypothetical protein  23.68 
 
 		 391 aa  57  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  31.63 
 
 		 396 aa  55.8  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0056  aspartate aminotransferase  24.35 
 
 		 379 aa  55.8  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2454  hypothetical protein  23.6 
 
 		 388 aa  56.2  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0928  aspartate aminotransferase  28.74 
 
 		 392 aa  55.8  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.436477  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2501  aminotransferase, class I and II  27.81 
 
 		 397 aa  56.2  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000255264  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2860  aminotransferase, class I and II  25.13 
 
 		 406 aa  55.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2069  aminotransferase, class I and II  27.4 
 
 		 375 aa  55.5  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.708727 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_89248  predicted protein  29.86 
 
 		 452 aa  55.8  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.113989 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3898  aminotransferase, class I and II  25.62 
 
 		 409 aa  55.8  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.157846 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1427  hypothetical protein  25.9 
 
 		 402 aa  55.1  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0489615 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3133  aminotransferase  35.85 
 
 		 370 aa  55.5  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.367697  normal  0.475875 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1417  aspartate aminotransferase  25 
 
 		 400 aa  55.1  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.557805 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3012  aminotransferase, class I and II  27.03 
 
 		 395 aa  55.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.250896  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4119  aminotransferase  27.33 
 
 		 400 aa  55.5  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2598  hypothetical protein  23.6 
 
 		 388 aa  54.7  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0429  aminotransferase class I and II  25.49 
 
 		 390 aa  54.7  0.000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2440  aminotransferase, class I and II  27.52 
 
 		 399 aa  54.7  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3500  aminotransferase, class I and II  33.33 
 
 		 431 aa  54.7  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00165234  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1395  aminotransferase class I and II  26.95 
 
 		 381 aa  54.7  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0333  aminotransferase  23.46 
 
 		 404 aa  54.7  0.000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1838  aromatic amino acid aminotransferase  29.45 
 
 		 397 aa  55.1  0.000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0376  aminotransferase, class I and II  23.05 
 
 		 373 aa  54.3  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.276364  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4723  hypothetical protein  34.48 
 
 		 396 aa  54.3  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3263  aminotransferase class I and II  20.97 
 
 		 382 aa  54.3  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14321  aminotransferases class-I  32.95 
 
 		 392 aa  54.7  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1621  aspartate aminotransferase  24.68 
 
 		 395 aa  54.3  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.624357  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1377  aspartate aminotransferase  23.72 
 
 		 400 aa  54.7  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.489913  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0519  aminotransferase class I and II  28.92 
 
 		 398 aa  54.7  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0081  aminotransferase, class I and II  23.48 
 
 		 398 aa  54.3  0.000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1121  aminotransferase class I and II  21.35 
 
 		 381 aa  53.9  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0617  aminotransferase  27.4 
 
 		 394 aa  53.9  0.000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1626  aminotransferase, class I and II  24 
 
 		 383 aa  53.9  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.608674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3497  aminotransferase class I and II  26.76 
 
 		 393 aa  53.9  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.683607  normal  0.548543 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2047  aminotransferase class I and II  25.21 
 
 		 396 aa  53.9  0.000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0730244  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1377  aromatic amino acid aminotransferase  29.45 
 
 		 400 aa  53.9  0.000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.907839  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5045  hypothetical protein  30.61 
 
 		 396 aa  53.5  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0694  2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  27.49 
 
 		 396 aa  53.5  0.000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.519768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0201  hypothetical protein  30.61 
 
 		 396 aa  53.5  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.39659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  27.18 
 
 		 395 aa  53.5  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2006  aminotransferase class I and II  26.75 
 
 		 390 aa  53.5  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.449815 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5040  hypothetical protein  30.61 
 
 		 396 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1745  aminotransferase class I and II  26.25 
 
 		 393 aa  53.1  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4771  hypothetical protein  30.61 
 
 		 396 aa  53.5  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4611  hypothetical protein  30.61 
 
 		 396 aa  53.5  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4633  hypothetical protein  30.61 
 
 		 396 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5012  hypothetical protein  30.61 
 
 		 396 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2980  aminotransferase  24 
 
 		 383 aa  53.5  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.289509  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1760  aspartate aminotransferase  26.17 
 
 		 402 aa  53.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.801832  normal  0.0251287 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5133  hypothetical protein  30.61 
 
 		 396 aa  53.5  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0517  aminotransferase  24 
 
 		 375 aa  52.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1034  aminotransferase  21.96 
 
 		 440 aa  53.5  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0421  aspartate aminotransferase  20.15 
 
 		 380 aa  52.8  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.248364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1476  aspartate aminotransferase  25.81 
 
 		 384 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1087  aminotransferase  27.33 
 
 		 392 aa  52.8  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3276  aminotransferase  29.05 
 
 		 394 aa  52.8  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1684  aspartate aminotransferase  27.87 
 
 		 396 aa  52.8  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.121725  normal  0.0684909 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4206  aminotransferase  25.87 
 
 		 390 aa  52.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0003  aminotransferase class I and II  24.42 
 
 		 388 aa  52  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00871395 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2661  aspartate aminotransferase  23.73 
 
 		 402 aa  52.4  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.975518  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0325  aminotransferase class I and II  24 
 
 		 375 aa  52.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.303015  hitchhiker  0.000770827 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0217  aminotransferase class I and II  30.41 
 
 		 521 aa  52.4  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5033  hypothetical protein  30.61 
 
 		 396 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145667  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2513  aminotransferase  25.85 
 
 		 385 aa  52.4  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0124388  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0003  aminotransferase, class I and II  32.99 
 
 		 385 aa  52.4  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5290  aspartate aminotransferase  25.27 
 
 		 384 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.482624  normal  0.084891 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  29.9 
 
 		 390 aa  52.8  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1205  putative aspartate aminotransferase  29.7 
 
 		 397 aa  52.8  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0777  aromatic amino acid aminotransferase  27.93 
 
 		 390 aa  52.8  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0881  aminotransferase, class I and II  23.02 
 
 		 402 aa  52  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28200  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  24.71 
 
 		 379 aa  51.6  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000110278  normal  0.621857 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2183  aminotransferase, class I and II  23.47 
 
 		 395 aa  52  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.328944  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0346  aspartate aminotransferase  23.42 
 
 		 399 aa  51.6  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.550604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1417  aminotransferase, class I and II  25.9 
 
 		 406 aa  52  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.581012  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1426  aspartate aminotransferase  23.73 
 
 		 395 aa  51.6  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2977  aminotransferase class I and II  25.18 
 
 		 385 aa  51.2  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.792823  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>