More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0621 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0621  aminotransferase class I and II  100 
 
 
530 aa  1083    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1984  aspartate aminotransferase  57.97 
 
 
538 aa  636    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0142877 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2709  aspartate aminotransferase  59.22 
 
 
541 aa  631  1e-180  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.625011  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0095  aspartate aminotransferase  56.11 
 
 
530 aa  625  1e-178  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0859207  normal  0.737001 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0790  aspartate aminotransferase  57.6 
 
 
554 aa  624  1e-177  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.545983 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3891  aspartate aminotransferase  57.36 
 
 
554 aa  623  1e-177  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3483  aspartate aminotransferase  56.12 
 
 
534 aa  609  1e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.284147  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3914  aspartate aminotransferase  54.53 
 
 
531 aa  591  1e-167  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.550794  normal  0.103832 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1557  aspartate aminotransferase  48.78 
 
 
552 aa  486  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.122519  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3840  aminotransferase class I and II  47.74 
 
 
548 aa  484  1e-135  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.157118  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1946  aspartate aminotransferase  48.03 
 
 
589 aa  468  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.346248  normal  0.0292973 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1258  aspartate aminotransferase  44.38 
 
 
540 aa  434  1e-120  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000391079  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0325  aspartate aminotransferase  44.34 
 
 
528 aa  426  1e-118  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0327  aspartate aminotransferase  43.95 
 
 
528 aa  422  1e-117  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1070  hypothetical protein  46.1 
 
 
159 aa  133  6.999999999999999e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000222922  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2798  aminotransferase class I and II  28.82 
 
 
396 aa  89  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1087  aminotransferase  28.33 
 
 
392 aa  88.2  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  36.36 
 
 
396 aa  87.8  5e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1755  aminotransferase, class I and II  24.62 
 
 
394 aa  87.4  6e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1425  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  27.65 
 
 
444 aa  87.4  6e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5045  hypothetical protein  28.44 
 
 
396 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4633  hypothetical protein  29.13 
 
 
396 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0201  hypothetical protein  28.91 
 
 
396 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.39659  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5040  hypothetical protein  28.44 
 
 
396 aa  82  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5012  hypothetical protein  29.13 
 
 
396 aa  82  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4771  hypothetical protein  29.13 
 
 
396 aa  82  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4611  hypothetical protein  29.13 
 
 
396 aa  82  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5133  hypothetical protein  29.13 
 
 
396 aa  82  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4723  hypothetical protein  28.44 
 
 
396 aa  81.3  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1128  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  32.26 
 
 
394 aa  80.9  0.00000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0549  aminotransferase class I and II  25 
 
 
401 aa  80.5  0.00000000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1427  hypothetical protein  26.67 
 
 
402 aa  80.1  0.00000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0489615 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2709  aspartate aminotransferase  24.75 
 
 
405 aa  80.1  0.00000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0229127 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  30.24 
 
 
390 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5033  hypothetical protein  28.44 
 
 
396 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145667  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0073  hypothetical protein  25.3 
 
 
392 aa  78.6  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0945  aminotransferase class I and II  25.68 
 
 
392 aa  79  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.090244  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1760  aminotransferase class I and II  28.66 
 
 
393 aa  79  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2997  aspartate aminotransferase  25.37 
 
 
409 aa  78.2  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0085  hypothetical protein  25 
 
 
392 aa  78.2  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2238  aminotransferase class I and II  29.95 
 
 
396 aa  78.2  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.105743  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0257  aminotransferase class I and II  24.65 
 
 
402 aa  77.8  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  25.7 
 
 
395 aa  77.4  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1629  aminotransferase, class I and II  33.1 
 
 
389 aa  77.4  0.0000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21060  aspartate aminotransferase  25.06 
 
 
410 aa  77  0.0000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0566  aspartate aminotransferase  26.96 
 
 
402 aa  76.3  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0045  aromatic amino acid aminotransferase  33.53 
 
 
391 aa  76.6  0.000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17330  aspartate aminotransferase  23.98 
 
 
402 aa  75.9  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1684  aspartate aminotransferase  31.97 
 
 
396 aa  75.5  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.121725  normal  0.0684909 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0313  aspartate aminotransferase  27.53 
 
 
401 aa  75.1  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000311454  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0063  aspartate aminotransferase  30.11 
 
 
396 aa  74.7  0.000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2610  aminotransferase class I and II  30 
 
 
399 aa  74.3  0.000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  2.63591e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1241  aminotransferase class I and II  28.05 
 
 
400 aa  74.3  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28200  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  34.25 
 
 
379 aa  73.9  0.000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000110278  normal  0.621857 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  27.66 
 
 
404 aa  73.9  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_89248  predicted protein  26.18 
 
 
452 aa  74.3  0.000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.113989 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07871  aminotransferase class-I  26.95 
 
 
393 aa  73.9  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.404062  hitchhiker  0.00724094 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3113  aminotransferase  22.6 
 
 
398 aa  73.6  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.274828  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2664  aminotransferase class I and II  28.92 
 
 
393 aa  73.6  0.000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0937488  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0519  aminotransferase class I and II  29.71 
 
 
398 aa  73.6  0.000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2569  aminotransferase class I and II  26.51 
 
 
397 aa  72.8  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121169  normal  0.359659 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3007  hypothetical protein  28.29 
 
 
390 aa  73.2  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1414  aminotransferase class I and II  30.36 
 
 
407 aa  73.2  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.445663  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0048  aminotransferase class I and II  33.82 
 
 
401 aa  72.8  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00536151  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0895  aminotransferase  24.92 
 
 
393 aa  73.2  0.00000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.515472  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24020  aspartate aminotransferase  25.76 
 
 
414 aa  72.4  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.871071  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2654  aspartate aminotransferase  26.94 
 
 
400 aa  72.4  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.24242  decreased coverage  0.00639864 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1627  aminotransferase, class I and II  24.34 
 
 
393 aa  72.4  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.703964 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2501  aminotransferase, class I and II  25.08 
 
 
397 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000255264  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14321  aminotransferases class-I  26.35 
 
 
392 aa  72  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4119  aminotransferase  27.38 
 
 
400 aa  71.6  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1319  aminotransferase  27.22 
 
 
398 aa  72  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.399658  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3192  aminotransferase, class I and II  29.08 
 
 
399 aa  71.6  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.593441  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2271  aspartate aminotransferase  26.82 
 
 
398 aa  71.6  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.738688  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2202  aspartate aminotransferase  28.67 
 
 
393 aa  71.6  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1747  aminotransferase, class I and II  25.1 
 
 
396 aa  71.2  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1490  L-aspartate aminotransferase  28.32 
 
 
396 aa  71.2  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0446  aminotransferase  27.98 
 
 
389 aa  71.6  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.317433  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2182  aminotransferase, class I and II  28.78 
 
 
405 aa  71.6  0.00000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100524  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0938  aminotransferase, class I and II  23.96 
 
 
400 aa  71.6  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0897  aspartate aminotransferase  25.67 
 
 
389 aa  71.2  0.00000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0789129  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2938  aminotransferase  28.92 
 
 
396 aa  71.2  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0333  aminotransferase  29.55 
 
 
404 aa  71.2  0.00000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1182  aspartate aminotransferase  30.91 
 
 
395 aa  70.9  0.00000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.410689  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0962  aminotransferase  31.48 
 
 
393 aa  70.9  0.00000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.124285 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  30.56 
 
 
390 aa  70.9  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3276  aminotransferase  30.43 
 
 
394 aa  71.2  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1838  aromatic amino acid aminotransferase  29.95 
 
 
397 aa  71.2  0.00000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2066  aminotransferase class I and II  28.74 
 
 
400 aa  70.9  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0959735  normal  0.858432 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2408  aminotransferase class I and II  29.59 
 
 
383 aa  70.5  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.987173  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6368  aspartate aminotransferase  25.79 
 
 
400 aa  70.1  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6897  aspartate aminotransferase  25 
 
 
388 aa  70.5  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1687  aminotransferase class I and II  28.47 
 
 
393 aa  70.1  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1138  aminotransferase, class I and II  26.46 
 
 
395 aa  69.3  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.025669  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1135  aminotransferase  28.75 
 
 
400 aa  70.1  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.309528  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1712  aspartate aminotransferase  23.3 
 
 
395 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000959703  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1479  aspartate aminotransferase  25.63 
 
 
400 aa  70.1  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0669082 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2321  aminotransferase class I and II  28.41 
 
 
397 aa  69.7  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000744146  hitchhiker  0.00241893 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0177  alanine aminotransferase  31.01 
 
 
391 aa  70.1  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.127101 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2022  aspartate aminotransferase  28.47 
 
 
393 aa  70.1  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>