More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1557 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1557  aspartate aminotransferase  100 
 
 		 552 aa  1138    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.122519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3840  aminotransferase class I and II  52.73 
 
 		 548 aa  585  1e-166  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.157118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1258  aspartate aminotransferase  47.18 
 
 		 540 aa  525  1e-147  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000391079  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1984  aspartate aminotransferase  51.97 
 
 		 538 aa  519  1e-146  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0142877 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3891  aspartate aminotransferase  50.66 
 
 		 554 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1946  aspartate aminotransferase  48.88 
 
 		 589 aa  511  1e-144  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.346248  normal  0.0292973 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2709  aspartate aminotransferase  50.09 
 
 		 541 aa  499  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.625011  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0790  aspartate aminotransferase  49.71 
 
 		 554 aa  498  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.545983 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3914  aspartate aminotransferase  48.58 
 
 		 531 aa  493  9.999999999999999e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.550794  normal  0.103832 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0095  aspartate aminotransferase  47.66 
 
 		 530 aa  489  1e-137  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0859207  normal  0.737001 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3483  aspartate aminotransferase  46.82 
 
 		 534 aa  483  1e-135  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.284147  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0621  aminotransferase class I and II  48.41 
 
 		 530 aa  469  1.0000000000000001e-131  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0325  aspartate aminotransferase  44 
 
 		 528 aa  444  1e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0327  aspartate aminotransferase  43.64 
 
 		 528 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1070  hypothetical protein  50 
 
 		 159 aa  159  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000222922  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3192  aminotransferase, class I and II  34.23 
 
 		 399 aa  87.8  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.593441  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2569  aminotransferase class I and II  27.82 
 
 		 397 aa  82  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121169  normal  0.359659 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4119  aminotransferase  32.45 
 
 		 400 aa  80.5  0.00000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  31.03 
 
 		 395 aa  79.3  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0881  hypothetical protein  26.62 
 
 		 385 aa  78.6  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1626  aminotransferase, class I and II  30.99 
 
 		 383 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.608674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1696  aminotransferase, class I and II  28.87 
 
 		 397 aa  77.4  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0798597  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1684  aspartate aminotransferase  33.79 
 
 		 396 aa  77.4  0.0000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.121725  normal  0.0684909 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2202  aspartate aminotransferase  32.41 
 
 		 393 aa  77  0.0000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1629  aminotransferase, class I and II  29.17 
 
 		 389 aa  77  0.0000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  28.29 
 
 		 404 aa  77  0.0000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2233  aspartate aminotransferase  31.68 
 
 		 400 aa  76.3  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.117897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7660  aspartate aminotransferase  32.89 
 
 		 404 aa  76.3  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.394739  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2997  aspartate aminotransferase  31.65 
 
 		 400 aa  76.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308174  normal  0.423377 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0536  L-aspartate aminotransferase  31.95 
 
 		 396 aa  76.6  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1427  hypothetical protein  22.77 
 
 		 402 aa  75.5  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0489615 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1295  L-aspartate aminotransferase  29.01 
 
 		 392 aa  75.5  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2736  aspartate aminotransferase  31.06 
 
 		 400 aa  75.5  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0888724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1087  aminotransferase  33.1 
 
 		 392 aa  75.9  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2564  aminotransferase class I and II  30.71 
 
 		 386 aa  75.1  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2980  aminotransferase  30.28 
 
 		 383 aa  75.1  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.289509  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2674  aminotransferase  32.17 
 
 		 393 aa  75.5  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1414  aminotransferase class I and II  30.97 
 
 		 407 aa  74.7  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.445663  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0363  aminotransferase  28.86 
 
 		 390 aa  74.7  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1924  aspartate aminotransferase  30.38 
 
 		 397 aa  74.7  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1395  aminotransferase class I and II  26.19 
 
 		 381 aa  74.3  0.000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2204  aminotransferase class I and II  27.72 
 
 		 390 aa  74.3  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81808 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6897  aspartate aminotransferase  26.16 
 
 		 388 aa  74.3  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  31.91 
 
 		 396 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1859  aminotransferase, class I and II  25.96 
 
 		 383 aa  74.3  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2238  aminotransferase class I and II  29.17 
 
 		 396 aa  73.9  0.000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.105743  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0150  aminotransferase class I and II  30.95 
 
 		 386 aa  74.3  0.000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.870631  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2022  aspartate aminotransferase  30.67 
 
 		 393 aa  73.9  0.000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.776343  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0323  aspartate aminotransferase  28.65 
 
 		 417 aa  73.6  0.000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00219132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0701  aspartate aminotransferase  28.77 
 
 		 392 aa  73.9  0.000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2271  aspartate aminotransferase  27.84 
 
 		 398 aa  73.6  0.000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.738688  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3728  aminotransferase class I and II  31.76 
 
 		 387 aa  73.6  0.000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3007  hypothetical protein  31.13 
 
 		 390 aa  72.8  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0525  aspartate aminotransferase  27.87 
 
 		 397 aa  72.8  0.00000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1602  aminotransferase, class I and II  29.73 
 
 		 397 aa  73.6  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0934572  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2408  aminotransferase class I and II  32.05 
 
 		 383 aa  73.2  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.987173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4126  aromatic amino acid aminotransferase  33.11 
 
 		 394 aa  72.8  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4591  aminotransferase class I and II  34.04 
 
 		 386 aa  72.8  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0643  aminotransferase class I and II  26.05 
 
 		 399 aa  73.2  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0312  aminotransferase class I and II  26.4 
 
 		 413 aa  72.8  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3240  aminotransferase, class I and II  32.37 
 
 		 388 aa  73.2  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1128  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  26.03 
 
 		 394 aa  72.8  0.00000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0429  aminotransferase class I and II  28.74 
 
 		 390 aa  72.8  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07311  aminotransferases class-I  23.84 
 
 		 392 aa  72.4  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.719619  hitchhiker  0.00557892 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0106  L-aspartate aminotransferase  23.84 
 
 		 392 aa  72.4  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0798  aspartate aminotransferase  25.16 
 
 		 387 aa  72.8  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0041  aminotransferase class I and II  30 
 
 		 402 aa  72  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.782752  normal  0.197817 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2208  aminotransferase class I and II  28.86 
 
 		 387 aa  72.8  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_89248  predicted protein  27.95 
 
 		 452 aa  72.4  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.113989 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0707  aspartate aminotransferase  28.08 
 
 		 392 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.498645  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1642  aspartate aminotransferase  28.39 
 
 		 397 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5709  aspartate transaminase  28.09 
 
 		 393 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0048  aminotransferase class I and II  28.77 
 
 		 401 aa  71.6  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00536151  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6257  aminotransferase class I and II  31.39 
 
 		 399 aa  72  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1138  aminotransferase, class I and II  29.73 
 
 		 395 aa  71.6  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.025669  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1182  aminotransferase class-I  28.05 
 
 		 393 aa  72  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2513  aminotransferase  27.27 
 
 		 385 aa  72  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0124388  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0881  aminotransferase, class I and II  26.17 
 
 		 402 aa  71.6  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1672  aspartate aminotransferase  32.28 
 
 		 400 aa  72  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0519  aminotransferase class I and II  28.74 
 
 		 398 aa  71.6  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13598  aspartate aminotransferase  31.85 
 
 		 388 aa  72  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0143941  normal  0.389087 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0863  aspartate aminotransferase  28.42 
 
 		 393 aa  71.6  0.00000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.252217  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3888  aminotransferase  28.74 
 
 		 406 aa  71.2  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14321  aminotransferases class-I  26.59 
 
 		 392 aa  71.2  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0165  aminotransferase, class I and II  25.54 
 
 		 390 aa  71.2  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1297  aspartate aminotransferase  31.01 
 
 		 400 aa  71.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1457  aminotransferase class I and II  31.29 
 
 		 400 aa  71.2  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0784  aminotransferase  31.65 
 
 		 403 aa  71.6  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0364994 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2501  aminotransferase, class I and II  28.87 
 
 		 397 aa  71.2  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000255264  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28200  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  27.81 
 
 		 379 aa  71.6  0.00000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000110278  normal  0.621857 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0770  aminotransferase, class I and II  23.76 
 
 		 397 aa  71.2  0.00000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0102863 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3243  aminotransferase class I and II  31.16 
 
 		 400 aa  71.2  0.00000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.922268 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07891  aspartate aminotransferase  30.54 
 
 		 409 aa  71.2  0.00000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1817  aminotransferase class I and II  29.38 
 
 		 385 aa  71.2  0.00000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0740  aminotransferase, class I and II  28.99 
 
 		 400 aa  71.2  0.00000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1411  aminotransferase class I and II  24.31 
 
 		 393 aa  70.9  0.00000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0507  aspartate aminotransferase  29.8 
 
 		 393 aa  70.9  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1955  aminotransferase  31.08 
 
 		 392 aa  70.9  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0276062 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  32.5 
 
 		 388 aa  70.9  0.00000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1904  aminotransferase, class I and II  24.21 
 
 		 392 aa  70.5  0.00000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>