More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0790 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A2709  aspartate aminotransferase  77.53 
 
 
541 aa  869    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.625011  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0790  aspartate aminotransferase  100 
 
 
554 aa  1134    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.545983 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3891  aspartate aminotransferase  90.61 
 
 
554 aa  1039    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1984  aspartate aminotransferase  73.21 
 
 
538 aa  802    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0142877 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0095  aspartate aminotransferase  62.36 
 
 
530 aa  664    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0859207  normal  0.737001 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3483  aspartate aminotransferase  61.66 
 
 
534 aa  655    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.284147  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3914  aspartate aminotransferase  59.89 
 
 
531 aa  634  1e-180  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.550794  normal  0.103832 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0621  aminotransferase class I and II  57.6 
 
 
530 aa  610  1e-173  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1557  aspartate aminotransferase  49.71 
 
 
552 aa  498  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.122519  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3840  aminotransferase class I and II  48.79 
 
 
548 aa  495  1e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.157118  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1946  aspartate aminotransferase  48.48 
 
 
589 aa  481  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.346248  normal  0.0292973 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1258  aspartate aminotransferase  46.04 
 
 
540 aa  481  1e-134  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000391079  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0325  aspartate aminotransferase  43.07 
 
 
528 aa  420  1e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0327  aspartate aminotransferase  42.48 
 
 
528 aa  413  1e-114  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1070  hypothetical protein  48.39 
 
 
159 aa  145  2e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000222922  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0150  aminotransferase class I and II  31.33 
 
 
386 aa  73.9  0.000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.870631  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0740  aminotransferase, class I and II  30.13 
 
 
400 aa  73.6  0.000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2674  aminotransferase  27.37 
 
 
393 aa  73.6  0.000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1791  aminotransferase class I and II  26.73 
 
 
400 aa  73.6  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.033856 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1602  aminotransferase, class I and II  31.94 
 
 
397 aa  73.2  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0934572  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3192  aminotransferase, class I and II  28.43 
 
 
399 aa  72.8  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.593441  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3626  aminotransferase  27.43 
 
 
411 aa  72.4  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0179909  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_89248  predicted protein  30.28 
 
 
452 aa  71.6  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.113989 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4119  aminotransferase  29.33 
 
 
400 aa  71.2  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0707  aspartate aminotransferase  26.51 
 
 
392 aa  71.2  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.498645  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0897  aspartate aminotransferase  28.51 
 
 
389 aa  71.2  0.00000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0789129  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1490  L-aspartate aminotransferase  25.9 
 
 
396 aa  70.9  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3243  aminotransferase class I and II  29.49 
 
 
400 aa  70.5  0.00000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.922268 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2344  aminotransferase class I and II  26.73 
 
 
400 aa  70.9  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1684  aspartate aminotransferase  33.33 
 
 
396 aa  70.5  0.00000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.121725  normal  0.0684909 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0701  aspartate aminotransferase  25.9 
 
 
392 aa  70.5  0.00000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1589  aminotransferase class I and II  27.11 
 
 
388 aa  70.1  0.00000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.570274  normal  0.997375 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2070  aminotransferase class I and II  26.73 
 
 
400 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.117536 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1411  aminotransferase class I and II  31.41 
 
 
393 aa  69.7  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2564  aminotransferase class I and II  33.09 
 
 
386 aa  69.7  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2664  aminotransferase class I and II  27.43 
 
 
393 aa  69.7  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0937488  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0177  alanine aminotransferase  25.91 
 
 
391 aa  68.9  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.127101 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0962  aminotransferase  29.76 
 
 
393 aa  68.9  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.124285 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1360  aminotransferase, class I and II  25 
 
 
397 aa  68.9  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1241  aminotransferase class I and II  27.33 
 
 
400 aa  68.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1087  aminotransferase  25.95 
 
 
392 aa  68.6  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0519  aminotransferase class I and II  29.31 
 
 
398 aa  68.2  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2238  aminotransferase class I and II  26.14 
 
 
396 aa  68.2  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.105743  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1760  aminotransferase class I and II  28 
 
 
393 aa  67.8  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2069  aminotransferase, class I and II  29.27 
 
 
375 aa  67.8  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.708727 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6257  aminotransferase class I and II  26.45 
 
 
399 aa  67.4  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110785  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1755  aminotransferase, class I and II  25 
 
 
394 aa  67.4  0.0000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2793  aminotransferase  28.87 
 
 
386 aa  67  0.0000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1377  aromatic amino acid aminotransferase  28.57 
 
 
400 aa  67  0.0000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.907839  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0085  hypothetical protein  26.76 
 
 
392 aa  66.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2233  aspartate aminotransferase  28.12 
 
 
400 aa  66.6  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.117897  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0323  aspartate aminotransferase  28 
 
 
417 aa  66.6  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00219132  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  29.68 
 
 
396 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1034  aminotransferase  25.73 
 
 
440 aa  66.6  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07350  putative aspartate aminotransferase  28.37 
 
 
399 aa  66.6  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.95272  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1232  aspartate aminotransferase A protein  26.19 
 
 
404 aa  65.9  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0739615 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0928  aspartate aminotransferase  28.16 
 
 
392 aa  65.9  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.436477  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  22.76 
 
 
395 aa  65.9  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0363  aminotransferase  28.08 
 
 
390 aa  65.9  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0630  aspartate aminotransferase  25.15 
 
 
394 aa  65.9  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2127  aspartate aminotransferase  26.74 
 
 
388 aa  65.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2030  aminotransferase class I and II  25.25 
 
 
400 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128582  normal  0.337144 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1545  aspartate aminotransferase  25.15 
 
 
423 aa  65.9  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  28.77 
 
 
404 aa  65.9  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1801  aspartate aminotransferase  26.11 
 
 
401 aa  65.9  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.81932  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1319  aminotransferase  25.62 
 
 
398 aa  65.9  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.399658  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2569  aminotransferase class I and II  26.62 
 
 
397 aa  65.9  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121169  normal  0.359659 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0257  aminotransferase class I and II  28.86 
 
 
402 aa  65.5  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3160  aminotransferase class I and II  27.11 
 
 
410 aa  65.1  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7660  aspartate aminotransferase  25.73 
 
 
404 aa  65.1  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.394739  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1414  aminotransferase class I and II  30.56 
 
 
407 aa  65.1  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.445663  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  25.87 
 
 
390 aa  65.1  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0073  hypothetical protein  26.06 
 
 
392 aa  65.5  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1696  aminotransferase, class I and II  26.32 
 
 
397 aa  65.1  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0798597  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0333  aminotransferase  24.26 
 
 
398 aa  65.1  0.000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0411  aspartate aminotransferase  28.5 
 
 
388 aa  65.5  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1629  aminotransferase, class I and II  30.83 
 
 
389 aa  65.5  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2610  aminotransferase class I and II  24.26 
 
 
399 aa  65.1  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  2.63591e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1838  aromatic amino acid aminotransferase  29.27 
 
 
397 aa  65.5  0.000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0045  aromatic amino acid aminotransferase  30.99 
 
 
391 aa  65.1  0.000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1817  aminotransferase class I and II  24.39 
 
 
385 aa  64.7  0.000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1248  aminotransferase  28.05 
 
 
409 aa  64.7  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14321  aminotransferases class-I  26.35 
 
 
392 aa  64.7  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2798  aminotransferase class I and II  27.89 
 
 
396 aa  64.3  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1128  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  27.33 
 
 
394 aa  64.7  0.000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3500  aminotransferase, class I and II  37.04 
 
 
431 aa  64.7  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00165234  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5177  class I/II aminotransferase  25.09 
 
 
388 aa  64.3  0.000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530188  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0863  aspartate aminotransferase  28.37 
 
 
393 aa  64.3  0.000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.252217  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1427  hypothetical protein  26.06 
 
 
402 aa  64.3  0.000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0489615 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5434  aminotransferase class I and II  31.65 
 
 
392 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.472913 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3007  hypothetical protein  25.12 
 
 
390 aa  63.9  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0549  aminotransferase class I and II  26.7 
 
 
401 aa  63.9  0.000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0081  aminotransferase, class I and II  27.33 
 
 
398 aa  63.9  0.000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0185  aminotransferase, class I and II  32.41 
 
 
388 aa  63.5  0.000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603276  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1479  aspartate aminotransferase  25.75 
 
 
400 aa  63.5  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0669082 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_3820  predicted protein  26.2 
 
 
376 aa  63.2  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2997  aspartate aminotransferase  28.12 
 
 
400 aa  63.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308174  normal  0.423377 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5800  aminotransferase class I and II  28.03 
 
 
402 aa  63.5  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.799353  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2736  aspartate aminotransferase  28.12 
 
 
400 aa  62.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0888724  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0938  aminotransferase, class I and II  25.48 
 
 
400 aa  63.2  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>