More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3891 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A2709  aspartate aminotransferase  77.47 
 
 
541 aa  858    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.625011  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0095  aspartate aminotransferase  61.63 
 
 
530 aa  673    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0859207  normal  0.737001 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3891  aspartate aminotransferase  100 
 
 
554 aa  1132    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3483  aspartate aminotransferase  61.6 
 
 
534 aa  659    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.284147  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1984  aspartate aminotransferase  71.7 
 
 
538 aa  793    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0142877 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0790  aspartate aminotransferase  90.61 
 
 
554 aa  1039    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.545983 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3914  aspartate aminotransferase  59.47 
 
 
531 aa  630  1e-179  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.550794  normal  0.103832 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0621  aminotransferase class I and II  57.36 
 
 
530 aa  609  1e-173  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1557  aspartate aminotransferase  50.66 
 
 
552 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.122519  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3840  aminotransferase class I and II  48.98 
 
 
548 aa  504  1e-141  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.157118  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1258  aspartate aminotransferase  45.97 
 
 
540 aa  483  1e-135  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000391079  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1946  aspartate aminotransferase  48.68 
 
 
589 aa  482  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.346248  normal  0.0292973 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0325  aspartate aminotransferase  43.77 
 
 
528 aa  429  1e-119  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0327  aspartate aminotransferase  43.18 
 
 
528 aa  424  1e-117  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1070  hypothetical protein  47.1 
 
 
159 aa  141  3e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000222922  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2569  aminotransferase class I and II  28.48 
 
 
397 aa  77  0.0000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121169  normal  0.359659 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1602  aminotransferase, class I and II  32.64 
 
 
397 aa  74.7  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0934572  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6257  aminotransferase class I and II  29.22 
 
 
399 aa  74.3  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110785  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4119  aminotransferase  30 
 
 
400 aa  73.9  0.000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2069  aminotransferase, class I and II  29.38 
 
 
375 aa  73.2  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.708727 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0150  aminotransferase class I and II  31.93 
 
 
386 aa  72.8  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.870631  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2238  aminotransferase class I and II  27.27 
 
 
396 aa  72.4  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.105743  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3192  aminotransferase, class I and II  27.94 
 
 
399 aa  72.8  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.593441  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_89248  predicted protein  26.7 
 
 
452 aa  71.6  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.113989 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2233  aspartate aminotransferase  26.18 
 
 
400 aa  71.6  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.117897  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1623  aspartate aminotransferase  28.74 
 
 
397 aa  70.9  0.00000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.399039  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0519  aminotransferase class I and II  29.28 
 
 
398 aa  70.9  0.00000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2997  aspartate aminotransferase  30 
 
 
400 aa  70.5  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308174  normal  0.423377 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2736  aspartate aminotransferase  30 
 
 
400 aa  70.5  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0888724  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1629  aminotransferase, class I and II  32.33 
 
 
389 aa  69.7  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2047  aminotransferase class I and II  25.65 
 
 
396 aa  69.7  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0730244  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2980  aminotransferase  29.34 
 
 
383 aa  69.7  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.289509  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1672  aspartate aminotransferase  29.01 
 
 
400 aa  70.1  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1490  L-aspartate aminotransferase  31.29 
 
 
396 aa  69.3  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  27.5 
 
 
390 aa  70.1  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3626  aminotransferase  26.7 
 
 
411 aa  69.7  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0179909  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1838  aromatic amino acid aminotransferase  29.65 
 
 
397 aa  70.1  0.0000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0045  aromatic amino acid aminotransferase  30.91 
 
 
391 aa  70.1  0.0000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1626  aminotransferase, class I and II  29.34 
 
 
383 aa  68.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.608674  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1589  aminotransferase class I and II  27.11 
 
 
388 aa  68.9  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.570274  normal  0.997375 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0928  aspartate aminotransferase  29.31 
 
 
392 aa  68.9  0.0000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.436477  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1411  aminotransferase class I and II  31.48 
 
 
393 aa  69.3  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0962  aminotransferase  30.95 
 
 
393 aa  68.6  0.0000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.124285 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1791  aminotransferase class I and II  25.74 
 
 
400 aa  68.6  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.033856 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2664  aminotransferase class I and II  26.99 
 
 
393 aa  68.6  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0937488  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3007  hypothetical protein  27.01 
 
 
390 aa  68.6  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1360  aminotransferase, class I and II  24.88 
 
 
397 aa  68.6  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3500  aminotransferase, class I and II  38.89 
 
 
431 aa  68.6  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00165234  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1319  aminotransferase  24.78 
 
 
398 aa  68.6  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.399658  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3243  aminotransferase class I and II  29.49 
 
 
400 aa  68.6  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.922268 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0897  aspartate aminotransferase  28.32 
 
 
389 aa  68.2  0.0000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0789129  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0707  aspartate aminotransferase  26.9 
 
 
392 aa  67.8  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.498645  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2271  aspartate aminotransferase  30.29 
 
 
398 aa  68.2  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.738688  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2062  aminotransferase class I and II  26.97 
 
 
374 aa  68.2  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.928457  normal  0.422192 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1545  aspartate aminotransferase  25.77 
 
 
423 aa  67.8  0.0000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0630  aspartate aminotransferase  25.77 
 
 
394 aa  67.8  0.0000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1427  hypothetical protein  28.17 
 
 
402 aa  67.8  0.0000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0489615 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0740  aminotransferase, class I and II  28.85 
 
 
400 aa  67.8  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2344  aminotransferase class I and II  25.74 
 
 
400 aa  67.8  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2564  aminotransferase class I and II  31.65 
 
 
386 aa  67.4  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1696  aminotransferase, class I and II  25.26 
 
 
397 aa  67.4  0.0000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0798597  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2070  aminotransferase class I and II  25.74 
 
 
400 aa  67.4  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.117536 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0784  aminotransferase  26.88 
 
 
403 aa  67  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0364994 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07350  putative aspartate aminotransferase  24.68 
 
 
399 aa  67.4  0.0000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.95272  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0701  aspartate aminotransferase  26.21 
 
 
392 aa  67  0.0000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  29.68 
 
 
396 aa  67  0.0000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0063  aspartate aminotransferase  26.67 
 
 
396 aa  67  0.0000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1959  aminotransferase class I and II  26.38 
 
 
400 aa  67  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1087  aminotransferase  23.71 
 
 
392 aa  67  0.0000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1502  aminotransferase class I and II  31.52 
 
 
388 aa  66.2  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000290558  normal  0.783372 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0257  aminotransferase class I and II  27.5 
 
 
402 aa  66.6  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0376  aminotransferase, class I and II  27.43 
 
 
373 aa  66.6  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.276364  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0201  hypothetical protein  35.14 
 
 
396 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.39659  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0363  aminotransferase  28.77 
 
 
390 aa  66.6  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1495  aspartate aminotransferase  27.78 
 
 
400 aa  66.2  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.473774  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1448  aspartate aminotransferase  27.78 
 
 
400 aa  65.9  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.7202  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2793  aminotransferase  26.5 
 
 
386 aa  65.9  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2674  aminotransferase  25.26 
 
 
393 aa  66.2  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2030  aminotransferase class I and II  24.75 
 
 
400 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128582  normal  0.337144 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5040  hypothetical protein  34.23 
 
 
396 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4771  hypothetical protein  34.23 
 
 
396 aa  65.1  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3551  aminotransferase  27.33 
 
 
400 aa  65.5  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.547606 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4611  hypothetical protein  34.23 
 
 
396 aa  65.1  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4633  hypothetical protein  34.23 
 
 
396 aa  65.5  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5133  hypothetical protein  34.23 
 
 
396 aa  65.1  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5012  hypothetical protein  34.23 
 
 
396 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  28.77 
 
 
404 aa  65.1  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5800  aminotransferase class I and II  28.66 
 
 
402 aa  65.1  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.799353  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2610  aminotransferase class I and II  24.71 
 
 
399 aa  65.1  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  2.63591e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0048  aminotransferase class I and II  29.2 
 
 
401 aa  65.5  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00536151  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5045  hypothetical protein  34.23 
 
 
396 aa  65.5  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0185  aminotransferase, class I and II  31.65 
 
 
388 aa  64.7  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603276  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1377  aromatic amino acid aminotransferase  26.76 
 
 
400 aa  64.7  0.000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.907839  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1479  aspartate aminotransferase  26.18 
 
 
400 aa  64.7  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0669082 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1232  aspartate aminotransferase A protein  25.6 
 
 
404 aa  64.3  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0739615 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0549  aminotransferase class I and II  27.22 
 
 
401 aa  64.3  0.000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05340  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  28 
 
 
377 aa  64.7  0.000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0312  aminotransferase class I and II  27.11 
 
 
413 aa  64.3  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1684  aspartate aminotransferase  30.82 
 
 
396 aa  64.7  0.000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.121725  normal  0.0684909 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1414  aminotransferase class I and II  29.86 
 
 
407 aa  64.3  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.445663  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>