More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0325 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_0325  aspartate aminotransferase  100 
 
 
528 aa  1068    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0327  aspartate aminotransferase  96.76 
 
 
528 aa  1028    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3840  aminotransferase class I and II  45.11 
 
 
548 aa  457  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.157118  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1557  aspartate aminotransferase  44 
 
 
552 aa  444  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.122519  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2709  aspartate aminotransferase  44.42 
 
 
541 aa  430  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.625011  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3891  aspartate aminotransferase  43.77 
 
 
554 aa  429  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1984  aspartate aminotransferase  43.4 
 
 
538 aa  430  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0142877 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3914  aspartate aminotransferase  42.29 
 
 
531 aa  421  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.550794  normal  0.103832 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0095  aspartate aminotransferase  42.03 
 
 
530 aa  420  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0859207  normal  0.737001 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0790  aspartate aminotransferase  43.07 
 
 
554 aa  420  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.545983 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1946  aspartate aminotransferase  42.8 
 
 
589 aa  420  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.346248  normal  0.0292973 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3483  aspartate aminotransferase  41.43 
 
 
534 aa  413  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.284147  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0621  aminotransferase class I and II  44.34 
 
 
530 aa  411  1e-113  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1258  aspartate aminotransferase  41.48 
 
 
540 aa  401  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000391079  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1070  hypothetical protein  39.35 
 
 
159 aa  111  3e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000222922  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1128  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  30.98 
 
 
394 aa  85.9  0.000000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1427  hypothetical protein  29.05 
 
 
402 aa  81.6  0.00000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0489615 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  33.92 
 
 
388 aa  80.9  0.00000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0150  aminotransferase class I and II  34.13 
 
 
386 aa  76.3  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.870631  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0325  aminotransferase class I and II  28.57 
 
 
375 aa  75.9  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.303015  hitchhiker  0.000770827 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1587  aminotransferase class I and II  28.57 
 
 
375 aa  75.9  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.472479  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3192  aminotransferase, class I and II  30.82 
 
 
399 aa  75.9  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.593441  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1411  aminotransferase class I and II  29.61 
 
 
393 aa  75.5  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0517  aminotransferase  28.12 
 
 
375 aa  75.1  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2107  aspartate aminotransferase  26.89 
 
 
400 aa  75.5  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1558  aminotransferase class I and II  27.45 
 
 
386 aa  74.7  0.000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0317788  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1817  aminotransferase class I and II  27.06 
 
 
385 aa  74.3  0.000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4119  aminotransferase  27.84 
 
 
400 aa  74.3  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0863  aspartate aminotransferase  32.5 
 
 
393 aa  74.3  0.000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.252217  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1235  aminotransferase class I and II  31.32 
 
 
393 aa  73.9  0.000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0045  aromatic amino acid aminotransferase  28.92 
 
 
391 aa  73.9  0.000000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0907  aspartate aminotransferase  30.12 
 
 
415 aa  73.9  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.149386 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  27.18 
 
 
390 aa  73.9  0.000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1672  aspartate aminotransferase  26.05 
 
 
400 aa  73.6  0.000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3728  aminotransferase class I and II  28.12 
 
 
387 aa  73.6  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0740  aminotransferase, class I and II  31.82 
 
 
400 aa  73.2  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1414  aminotransferase class I and II  27.87 
 
 
407 aa  73.2  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.445663  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2569  aminotransferase class I and II  26.7 
 
 
397 aa  73.2  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121169  normal  0.359659 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1904  aminotransferase, class I and II  29.17 
 
 
392 aa  73.2  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0535  aminotransferase class I and II  28.57 
 
 
401 aa  73.2  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.169316  normal  0.0112885 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5033  hypothetical protein  30.57 
 
 
396 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145667  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5040  hypothetical protein  29.94 
 
 
396 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  28.47 
 
 
396 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0744  aminotransferase  28.82 
 
 
394 aa  72  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0285306  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0617  aminotransferase  25.51 
 
 
394 aa  72.4  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3150  aspartate aminotransferase  26.33 
 
 
400 aa  72.4  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5045  hypothetical protein  29.94 
 
 
396 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2793  aminotransferase  24.63 
 
 
386 aa  72.8  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2238  aminotransferase class I and II  29.38 
 
 
396 aa  72  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.105743  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07871  aminotransferase class-I  25.15 
 
 
393 aa  72.4  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.404062  hitchhiker  0.00724094 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1448  aspartate aminotransferase  25.22 
 
 
400 aa  72.4  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.7202  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1495  aspartate aminotransferase  24.93 
 
 
400 aa  71.6  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.473774  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1200  aminotransferase  30.46 
 
 
393 aa  72  0.00000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.241319  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1066  aminotransferase, class I and II  28.74 
 
 
401 aa  71.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.824593 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05340  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  26.06 
 
 
377 aa  71.6  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1377  aromatic amino acid aminotransferase  29.52 
 
 
400 aa  71.6  0.00000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.907839  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0525  aspartate aminotransferase  26.51 
 
 
397 aa  71.6  0.00000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0962  aminotransferase  27.93 
 
 
393 aa  71.2  0.00000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.124285 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0770  aminotransferase, class I and II  29.65 
 
 
397 aa  71.6  0.00000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0102863 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0201  hypothetical protein  29.94 
 
 
396 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.39659  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4771  hypothetical protein  29.94 
 
 
396 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4611  hypothetical protein  29.94 
 
 
396 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4633  hypothetical protein  29.94 
 
 
396 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2564  aminotransferase class I and II  31.65 
 
 
386 aa  70.9  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_89248  predicted protein  28.67 
 
 
452 aa  70.9  0.00000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.113989 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5133  hypothetical protein  29.94 
 
 
396 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5012  hypothetical protein  29.94 
 
 
396 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0048  aminotransferase class I and II  31.25 
 
 
401 aa  70.9  0.00000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00536151  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0627  aminotransferase class I and II  28.81 
 
 
369 aa  70.9  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2233  aspartate aminotransferase  30.25 
 
 
400 aa  71.2  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.117897  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0388  aminotransferase class I and II  33.56 
 
 
392 aa  70.9  0.00000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1859  aminotransferase, class I and II  28.41 
 
 
383 aa  70.9  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1502  aminotransferase class I and II  25.12 
 
 
388 aa  70.5  0.00000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000290558  normal  0.783372 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3007  hypothetical protein  27.69 
 
 
390 aa  70.5  0.00000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2997  aspartate aminotransferase  27.06 
 
 
409 aa  70.5  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2066  aminotransferase class I and II  25.86 
 
 
400 aa  70.1  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0959735  normal  0.858432 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4358  aminotransferase class I and II  28.57 
 
 
406 aa  70.1  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0895  aminotransferase  29.44 
 
 
393 aa  70.1  0.00000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.515472  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2143  aminotransferase class I and II  28.09 
 
 
356 aa  69.3  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1192  aminotransferase class I and II  28.14 
 
 
375 aa  69.3  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0513  aminotransferase class I and II  25.26 
 
 
383 aa  69.7  0.0000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00548158 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1745  aminotransferase class I and II  27.12 
 
 
393 aa  69.7  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1457  aminotransferase class I and II  29.61 
 
 
400 aa  70.1  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0217  aminotransferase class I and II  29.41 
 
 
521 aa  69.3  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2182  aminotransferase, class I and II  25.42 
 
 
405 aa  69.7  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100524  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1766  aminotransferase class I and II  24.62 
 
 
377 aa  69.3  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0185  aminotransferase, class I and II  29.28 
 
 
388 aa  69.3  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603276  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2980  aminotransferase  27.27 
 
 
383 aa  68.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.289509  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2300  aspartate aminotransferase  30.77 
 
 
400 aa  69.3  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10725  normal  0.390936 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5800  aminotransferase class I and II  28.03 
 
 
402 aa  68.9  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.799353  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2860  aminotransferase, class I and II  27.45 
 
 
406 aa  69.3  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0313  aspartate aminotransferase  27.17 
 
 
401 aa  69.3  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000311454  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  30.13 
 
 
395 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4551  aspartate aminotransferase  30.57 
 
 
402 aa  69.3  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.146004  normal  0.171022 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6368  aspartate aminotransferase  31.14 
 
 
400 aa  69.3  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2793  aminotransferase  30.51 
 
 
390 aa  69.3  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2737  aminotransferase class I and II  33.13 
 
 
400 aa  68.2  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.388362  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2501  aminotransferase, class I and II  31.47 
 
 
397 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000255264  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4723  hypothetical protein  28.66 
 
 
396 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14321  aminotransferases class-I  25.53 
 
 
392 aa  68.6  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>