15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1070 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_1070  hypothetical protein  100 
 
 
159 aa  328  2e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000222922  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1258  aspartate aminotransferase  97.42 
 
 
540 aa  314  2e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000391079  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3840  aminotransferase class I and II  59.09 
 
 
548 aa  196  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.157118  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1946  aspartate aminotransferase  52.9 
 
 
589 aa  164  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.346248  normal  0.0292973 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1557  aspartate aminotransferase  50 
 
 
552 aa  159  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.122519  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1984  aspartate aminotransferase  49.68 
 
 
538 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0142877 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0790  aspartate aminotransferase  48.39 
 
 
554 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.545983 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3891  aspartate aminotransferase  47.1 
 
 
554 aa  141  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3483  aspartate aminotransferase  45.45 
 
 
534 aa  138  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.284147  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2709  aspartate aminotransferase  45.81 
 
 
541 aa  137  7e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.625011  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0095  aspartate aminotransferase  46.1 
 
 
530 aa  136  8.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0859207  normal  0.737001 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0621  aminotransferase class I and II  46.1 
 
 
530 aa  133  8e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3914  aspartate aminotransferase  46.1 
 
 
531 aa  132  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.550794  normal  0.103832 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0325  aspartate aminotransferase  39.35 
 
 
528 aa  111  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0327  aspartate aminotransferase  39.35 
 
 
528 aa  110  7.000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>