More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1946 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1946  aspartate aminotransferase  100 
 
 		 589 aa  1222    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.346248  normal  0.0292973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3840  aminotransferase class I and II  57.36 
 
 		 548 aa  605  1.0000000000000001e-171  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.157118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1258  aspartate aminotransferase  47.61 
 
 		 540 aa  532  1e-150  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000391079  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1557  aspartate aminotransferase  48.88 
 
 		 552 aa  511  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.122519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3891  aspartate aminotransferase  48.68 
 
 		 554 aa  482  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0790  aspartate aminotransferase  48.48 
 
 		 554 aa  481  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.545983 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1984  aspartate aminotransferase  47.03 
 
 		 538 aa  466  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0142877 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2709  aspartate aminotransferase  47.48 
 
 		 541 aa  462  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.625011  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0095  aspartate aminotransferase  45.09 
 
 		 530 aa  458  1e-127  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0859207  normal  0.737001 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3483  aspartate aminotransferase  45.28 
 
 		 534 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.284147  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0621  aminotransferase class I and II  47.84 
 
 		 530 aa  454  1.0000000000000001e-126  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3914  aspartate aminotransferase  44.8 
 
 		 531 aa  441  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.550794  normal  0.103832 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0325  aspartate aminotransferase  42.8 
 
 		 528 aa  420  1e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0327  aspartate aminotransferase  41.86 
 
 		 528 aa  410  1e-113  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1070  hypothetical protein  52.9 
 
 		 159 aa  164  5.0000000000000005e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000222922  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0519  aminotransferase class I and II  29.65 
 
 		 398 aa  72.8  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2238  aminotransferase class I and II  28.27 
 
 		 396 aa  68.2  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.105743  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1838  aromatic amino acid aminotransferase  29.69 
 
 		 397 aa  67.4  0.0000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0549  aminotransferase class I and II  28.87 
 
 		 401 aa  66.6  0.000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0063  aspartate aminotransferase  27.37 
 
 		 396 aa  66.6  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2610  aminotransferase class I and II  30.99 
 
 		 399 aa  66.2  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  2.63591e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0333  aminotransferase  26.67 
 
 		 404 aa  65.5  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0617  aminotransferase  27.72 
 
 		 394 aa  65.5  0.000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1242  aspartate aminotransferase  26.58 
 
 		 396 aa  63.5  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1684  aspartate aminotransferase  28.23 
 
 		 396 aa  62  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.121725  normal  0.0684909 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1128  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  28.83 
 
 		 394 aa  61.6  0.00000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0962  aminotransferase  28.52 
 
 		 393 aa  61.2  0.00000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.124285 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4119  aminotransferase  29 
 
 		 400 aa  60.8  0.00000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0744  aminotransferase  30.81 
 
 		 394 aa  60.5  0.00000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0285306  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0313  aspartate aminotransferase  26.97 
 
 		 401 aa  59.3  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000311454  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0027  alanine aminotransferase  24.88 
 
 		 400 aa  59.3  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1377  aromatic amino acid aminotransferase  25.44 
 
 		 400 aa  59.3  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.907839  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1182  aspartate aminotransferase  26.46 
 
 		 395 aa  58.9  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.410689  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1621  aspartate aminotransferase  23.83 
 
 		 395 aa  58.5  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.624357  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0546  class I/II aminotransferase  24.85 
 
 		 456 aa  58.2  0.0000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0863  aspartate aminotransferase  24.04 
 
 		 393 aa  58.2  0.0000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.252217  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2271  aspartate aminotransferase  24.6 
 
 		 398 aa  58.2  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.738688  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0770  aminotransferase, class I and II  26.62 
 
 		 397 aa  57.8  0.0000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0102863 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0643  aminotransferase class I and II  30.17 
 
 		 399 aa  57.8  0.0000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2143  aminotransferase class I and II  26.89 
 
 		 356 aa  57.8  0.0000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0044  aromatic amino acid aminotransferase  29.21 
 
 		 395 aa  57.8  0.0000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0045  aromatic amino acid aminotransferase  29.17 
 
 		 391 aa  57.4  0.0000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0102  aminotransferase, class I and II  29.59 
 
 		 401 aa  56.6  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.848816  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2066  aminotransferase class I and II  24.46 
 
 		 400 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0959735  normal  0.858432 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1200  aminotransferase  25.32 
 
 		 393 aa  56.6  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.241319  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2204  aminotransferase class I and II  26.67 
 
 		 390 aa  56.6  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81808 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0535  aminotransferase class I and II  31.11 
 
 		 401 aa  57  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.169316  normal  0.0112885 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0525  aspartate aminotransferase  25.23 
 
 		 397 aa  56.2  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0111  putative aspartate transaminase  27.59 
 
 		 401 aa  56.2  0.000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3334  putative aminotransferase  21.93 
 
 		 385 aa  54.7  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.946068  hitchhiker  0.000376908 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1232  aminotransferase  23.92 
 
 		 399 aa  54.7  0.000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3007  hypothetical protein  23.08 
 
 		 390 aa  54.7  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1502  aminotransferase class I and II  23.35 
 
 		 388 aa  54.7  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000290558  normal  0.783372 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2070  aminotransferase class I and II  27.06 
 
 		 400 aa  54.3  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.117536 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4968  aminotransferase class I and II  28.23 
 
 		 404 aa  53.9  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.121403 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2344  aminotransferase class I and II  27.06 
 
 		 400 aa  54.3  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1518  aminotransferase class I and II  28.78 
 
 		 374 aa  53.5  0.000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.489896 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07871  aminotransferase class-I  24.87 
 
 		 393 aa  53.5  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.404062  hitchhiker  0.00724094 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07311  aminotransferases class-I  24.16 
 
 		 392 aa  53.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.719619  hitchhiker  0.00557892 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1317  putative aminotransferase  26.7 
 
 		 382 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0106  L-aspartate aminotransferase  23.89 
 
 		 392 aa  53.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  24.15 
 
 		 390 aa  53.5  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1295  L-aspartate aminotransferase  26.01 
 
 		 392 aa  53.5  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  24.83 
 
 		 396 aa  53.1  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4435  putative aminotransferase  23.58 
 
 		 384 aa  53.5  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4358  aminotransferase class I and II  30.81 
 
 		 406 aa  53.5  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2408  aminotransferase class I and II  27.55 
 
 		 383 aa  53.1  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.987173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1791  aminotransferase class I and II  27.81 
 
 		 400 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.033856 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5695  transaminase  30.23 
 
 		 374 aa  53.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.679406 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0325  aminotransferase class I and II  26.2 
 
 		 375 aa  52.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.303015  hitchhiker  0.000770827 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2030  aminotransferase class I and II  27.22 
 
 		 400 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128582  normal  0.337144 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1587  aminotransferase class I and II  26.2 
 
 		 375 aa  52.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.472479  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1411  aminotransferase class I and II  27.73 
 
 		 393 aa  52.8  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1924  aspartate aminotransferase  22.09 
 
 		 397 aa  52.4  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14940  putative aminotransferase  26.7 
 
 		 382 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.779314 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1192  aminotransferase class I and II  25.58 
 
 		 375 aa  52  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05340  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  25.3 
 
 		 377 aa  52  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.89 
 
 		 479 aa  52.4  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.892437  normal  0.704953 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4257  transaminase  26.73 
 
 		 374 aa  52.4  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2569  aminotransferase class I and II  21.97 
 
 		 397 aa  52  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121169  normal  0.359659 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1516  aminotransferase, class I and II  26.44 
 
 		 377 aa  51.6  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28200  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  23.9 
 
 		 379 aa  51.6  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000110278  normal  0.621857 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0085  hypothetical protein  24.32 
 
 		 392 aa  51.6  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1565  aminotransferase class I and II  26.44 
 
 		 377 aa  51.6  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0798  aspartate aminotransferase  23.63 
 
 		 387 aa  51.6  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1959  aminotransferase class I and II  28.4 
 
 		 400 aa  51.6  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1731  L-aspartate aminotransferase  25.64 
 
 		 400 aa  51.6  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0135  aminotransferase class I and II  27.32 
 
 		 407 aa  51.2  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.062979  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0895  aminotransferase  27.42 
 
 		 393 aa  51.2  0.00005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.515472  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0752  aminotransferase, class I and II  23.85 
 
 		 399 aa  51.6  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3018  aminotransferase class I and II  26.4 
 
 		 383 aa  51.2  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0388  aminotransferase class I and II  24.07 
 
 		 392 aa  51.2  0.00006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0346  aspartate aminotransferase  26.74 
 
 		 399 aa  51.2  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.550604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1904  aminotransferase, class I and II  29.44 
 
 		 392 aa  50.8  0.00006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1629  aminotransferase, class I and II  24.3 
 
 		 389 aa  50.8  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0289  aminotransferase class I and II  22.15 
 
 		 393 aa  51.2  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2798  aminotransferase class I and II  29.01 
 
 		 396 aa  50.8  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0429  aminotransferase class I and II  22.78 
 
 		 390 aa  50.8  0.00007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0777  aromatic amino acid aminotransferase  25 
 
 		 390 aa  50.8  0.00007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1794  hypothetical protein  26.5 
 
 		 393 aa  50.4  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000759831  normal  0.944472 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>