More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1132 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0770  amidohydrolase  75.25 
 
 
403 aa  642    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1132  amidohydrolase  100 
 
 
402 aa  823    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0444  amidohydrolase  76.36 
 
 
401 aa  634    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186163  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0453  amidohydrolase  76.62 
 
 
401 aa  636    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1248  amidohydrolase  74.5 
 
 
425 aa  644    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.144528  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  72.5 
 
 
404 aa  622  1e-177  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  71.93 
 
 
398 aa  620  1e-176  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3615  peptidase M20D, amidohydrolase  68.84 
 
 
397 aa  586  1e-166  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  69.44 
 
 
402 aa  584  1.0000000000000001e-165  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3092  hippurate hydrolase  67.09 
 
 
397 aa  569  1e-161  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0333  amidohydrolase  66.25 
 
 
401 aa  560  1e-158  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  65.41 
 
 
397 aa  537  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  65.08 
 
 
397 aa  532  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  63.16 
 
 
396 aa  531  1e-150  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  62.66 
 
 
396 aa  521  1e-146  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  62.41 
 
 
396 aa  519  1e-146  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  62.44 
 
 
396 aa  514  1e-144  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0472  putative hippurate carboxypeptidase, M20D- type  61 
 
 
423 aa  504  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745924  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  60.25 
 
 
398 aa  500  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  60.4 
 
 
397 aa  498  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2533  peptidase M20D, amidohydrolase  63.07 
 
 
397 aa  490  1e-137  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0030908 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5843  amidohydrolase  59.8 
 
 
396 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575611  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4653  amidohydrolase  59.5 
 
 
415 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0295739  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5626  amidohydrolase  58.81 
 
 
399 aa  462  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.528848  normal  0.0552178 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5651  amidohydrolase  59.5 
 
 
396 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.146235 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3715  peptidase M20D, amidohydrolase  59.5 
 
 
415 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410848  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0071  peptidase M20D, amidohydrolase  56.22 
 
 
389 aa  432  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5224  amidohydrolase  52.5 
 
 
401 aa  404  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220885  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2466  amidohydrolase  56.53 
 
 
390 aa  399  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.293537  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4523  peptidase M20D, amidohydrolase  51.77 
 
 
390 aa  390  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  51.29 
 
 
387 aa  388  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0943  amidohydrolase  53.25 
 
 
417 aa  385  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  51.03 
 
 
387 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  51.03 
 
 
387 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2476  amidohydrolase  52.25 
 
 
398 aa  385  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.738512  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  50.52 
 
 
387 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  48.37 
 
 
390 aa  379  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  50.26 
 
 
387 aa  379  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  51.03 
 
 
387 aa  380  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  48.99 
 
 
387 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  50.52 
 
 
387 aa  381  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  49.23 
 
 
387 aa  375  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  48.1 
 
 
412 aa  375  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  48.12 
 
 
395 aa  375  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  49.61 
 
 
394 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6268  amidohydrolase  49.35 
 
 
395 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.843577  normal  0.0558872 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4012  amidohydrolase  50 
 
 
392 aa  375  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.873821 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6670  amidohydrolase  49.35 
 
 
395 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3821  peptidase M20D, amidohydrolase  49.61 
 
 
394 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.961686  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6067  amidohydrolase  49.09 
 
 
395 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6435  peptidase M20D, amidohydrolase  49.35 
 
 
395 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  49.61 
 
 
394 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1298  peptidase M20D, amidohydrolase  49.61 
 
 
394 aa  372  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653843  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  49.87 
 
 
396 aa  372  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0021  peptidase M20D, amidohydrolase  49.25 
 
 
425 aa  373  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6364  amidohydrolase  49.09 
 
 
395 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.557183  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0958  hippurate hydolase  49.87 
 
 
396 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1941  hippurate hydolase  49.87 
 
 
396 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2220  hippurate hydolase  49.87 
 
 
396 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1662  hypothetical protein  49.61 
 
 
396 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0295  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  49.61 
 
 
396 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5519  amidohydrolase  47.33 
 
 
396 aa  371  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.5258  normal  0.111633 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1245  hippurate hydolase  49.87 
 
 
396 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0689013  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4102  amidohydrolase  50.13 
 
 
394 aa  371  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5133  amidohydrolase  52.71 
 
 
407 aa  369  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.519765  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4728  amidohydrolase  47.5 
 
 
393 aa  371  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.848291 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  49.1 
 
 
394 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0205  amidohydrolase family protein  49.61 
 
 
396 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0687  amidohydrolase  50.51 
 
 
408 aa  365  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.422759  normal  0.057643 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4433  amidohydrolase  48.84 
 
 
394 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1090  amidohydrolase  51.54 
 
 
424 aa  366  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  47.18 
 
 
403 aa  366  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4896  amidohydrolase  48.61 
 
 
396 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.873901  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2175  peptidase M20D, amidohydrolase  49.5 
 
 
396 aa  365  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.20985 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3769  amidohydrolase  48.88 
 
 
396 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2379  amidohydrolase  50 
 
 
402 aa  367  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  48.13 
 
 
406 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5374  amidohydrolase  48.12 
 
 
399 aa  365  1e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2992  peptidase M20D, amidohydrolase  48.12 
 
 
399 aa  365  1e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  47.1 
 
 
389 aa  364  1e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5250  amidohydrolase  48.37 
 
 
396 aa  364  2e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0935  amidohydrolase  49.23 
 
 
415 aa  364  2e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0665  amidohydrolase  50.26 
 
 
408 aa  363  2e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.382123  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1813  peptidase M20D, amidohydrolase  50.52 
 
 
388 aa  363  2e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.301487  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2671  peptidase M20D, amidohydrolase  47.65 
 
 
394 aa  364  2e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00976662  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6019  amidohydrolase  49.87 
 
 
389 aa  363  2e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  47.87 
 
 
387 aa  363  3e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2229  amidohydrolase  49.87 
 
 
395 aa  363  4e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359386  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2871  peptidase M20D, amidohydrolase  53.23 
 
 
391 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4721  amidohydrolase  48.37 
 
 
396 aa  362  6e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0252  peptidase M20D, amidohydrolase  47.61 
 
 
396 aa  361  1e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24772  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1734  peptidase M20D, amidohydrolase  48.13 
 
 
389 aa  361  1e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.0172136 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  47.87 
 
 
387 aa  361  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5935  amidohydrolase  48.27 
 
 
396 aa  360  2e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1288  amidohydrolase  49.37 
 
 
388 aa  359  6e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0866095  normal  0.389955 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2573  amidohydrolase  50 
 
 
387 aa  359  6e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0165265  normal  0.498174 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0984  peptidase M20D, amidohydrolase  47.39 
 
 
397 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3565  peptidase M20D, amidohydrolase  46.88 
 
 
390 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2692  amidohydrolase  49.37 
 
 
388 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4250  amidohydrolase  48.88 
 
 
390 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.456638  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>