215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0888 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0888  Ferritin Dps family protein  100 
 
 		 194 aa  403  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.505389 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4114  Ferritin Dps family protein  64.71 
 
 		 186 aa  259  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3866  Ferritin, Dps family protein  72.02 
 
 		 184 aa  251  5.000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3513  Ferritin, Dps family protein  69.59 
 
 		 181 aa  243  9.999999999999999e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2836  Ferritin Dps family protein  69.59 
 
 		 181 aa  243  9.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.596859  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3021  Ferritin Dps family protein  58.08 
 
 		 191 aa  206  1e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.331122 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4734  Ferritin, Dps family protein  58.68 
 
 		 176 aa  203  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000711152 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4856  bacterioferritin, putative  59.01 
 
 		 168 aa  202  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192046  hitchhiker  0.00133905 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0147  Ferritin Dps family protein  58.43 
 
 		 185 aa  202  3e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0139  Ferritin Dps family protein  58.43 
 
 		 185 aa  201  4e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4648  Ferritin Dps family protein  58.49 
 
 		 176 aa  201  5e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.732955  normal  0.0579106 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4913  Ferritin Dps family protein  57.49 
 
 		 176 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000032437 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2901  rubrerythrin:Ferritin and Dps  54.17 
 
 		 187 aa  197  9e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.778034  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0567  Ferritin and Dps  56.25 
 
 		 176 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.8657  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4906  bacterioferritin, putative  55.35 
 
 		 179 aa  196  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4448  Ferritin and Dps  55.7 
 
 		 180 aa  195  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1702  Ferritin Dps family protein  51.61 
 
 		 196 aa  193  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.766547 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5602  putative bacterioferritin  55.35 
 
 		 177 aa  192  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1509  Ferritin Dps family protein  53.41 
 
 		 181 aa  192  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.55793  normal  0.936849 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2233  putative bacterioferritin (cytochrome b1)  50.79 
 
 		 192 aa  192  4e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.305727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64520  putative bacterioferritin  54.72 
 
 		 177 aa  191  4e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02642  bacterioferritin  54.72 
 
 		 186 aa  185  4e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5724  ferritin Dps family protein  53.12 
 
 		 181 aa  184  6e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0602256  normal  0.927599 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6426  Ferritin Dps family protein  49.1 
 
 		 174 aa  174  9e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.714636  normal  0.449726 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2657  Ferritin Dps family protein  56.1 
 
 		 190 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.454229  normal  0.6432 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1459  bacterioferritin  51.91 
 
 		 190 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.491219  normal  0.567081 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2663  Ferritin and Dps  50.94 
 
 		 257 aa  157  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0895  Ferritin Dps family protein  46.99 
 
 		 187 aa  145  4.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.743965 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1402  Ferritin, Dps family protein  37.08 
 
 		 182 aa  105  5e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0131  Ferritin and Dps  34.97 
 
 		 164 aa  94  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0906  Ferritin, Dps family protein  37.68 
 
 		 164 aa  94  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000158924  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2517  Ferritin Dps family protein  35.66 
 
 		 167 aa  93.6  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.239409 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1706  Ferritin Dps family protein  34.27 
 
 		 167 aa  91.7  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0104  Ferritin Dps family protein  32.87 
 
 		 167 aa  87.8  8e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0092  Ferritin Dps family protein  34.75 
 
 		 164 aa  85.5  5e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.523921  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2196  Ferritin Dps family protein  34.04 
 
 		 164 aa  84.3  9e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.717028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1979  bacterioferritin  33.57 
 
 		 164 aa  83.6  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2674  Ferritin, Dps family protein  34.75 
 
 		 164 aa  82.8  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00193061  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0582  bacterioferritin  32.62 
 
 		 164 aa  81.6  0.000000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0017201  normal  0.223999 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0085  Ferritin Dps family protein  33.33 
 
 		 165 aa  79.3  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0104  Ferritin Dps family protein  32.62 
 
 		 164 aa  77.8  0.00000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0011  Ferritin Dps family protein  35.92 
 
 		 138 aa  75.5  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1760  Ferritin and Dps  32.12 
 
 		 171 aa  74.3  0.000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0955  bacterioferritin domain-containing protein  34.97 
 
 		 275 aa  63.2  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0154546  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1387  Ferritin Dps family protein  32.61 
 
 		 179 aa  62.8  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00351498  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0133  bacterioferritin  30.88 
 
 		 179 aa  61.6  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000103829  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2408  Ferritin Dps family protein  27.97 
 
 		 156 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2930  Ferritin Dps family protein  33.33 
 
 		 156 aa  60.5  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00884055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0839  rubrerythrin  33.09 
 
 		 275 aa  59.3  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.170782  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1981  Ferritin Dps family protein  28.57 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1748  Ferritin Dps family protein  29.58 
 
 		 168 aa  58.5  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0346837  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1070  rubrerythrin  28.3 
 
 		 172 aa  58.5  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2926  DNA protection protein DPS  29.86 
 
 		 183 aa  58.2  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00617656  hitchhiker  0.00193455 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5727  Ferritin Dps family protein  25.87 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.517178  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1247  bacterioferritin  29.37 
 
 		 158 aa  57.4  0.0000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0793  Ferritin Dps family protein  32.5 
 
 		 167 aa  57.4  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000048868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0293  Ferritin Dps family protein  28.36 
 
 		 179 aa  57.4  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3139  bacterioferritin  30.14 
 
 		 159 aa  57.4  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214002  normal  0.840824 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0066  Ferritin Dps family protein  27.86 
 
 		 179 aa  57  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2218  Ferritin Dps family protein  30.5 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.471897 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6042  bacterioferritin  31.21 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2437  bacterioferritin  33.1 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.174977  normal  0.415462 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1706  Ferritin and Dps  25 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1742  Ferritin and Dps  25.17 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4488  Ferritin Dps family protein  26.76 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.642539  normal  0.883174 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0588  bacterioferritin  32.65 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.865953  normal  0.942884 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0389  Ferritin, Dps family protein  31.03 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0951533 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1675  Ferritin, Dps family protein  26.72 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04013  bacterioferritin  32.41 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3342  bacterioferritin  32.19 
 
 		 165 aa  54.3  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.95444  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1908  bacterioferritin  32.88 
 
 		 155 aa  53.9  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000155674  hitchhiker  0.0000000236672 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0171  Ferritin Dps family protein  31.03 
 
 		 182 aa  53.9  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2818  bacterioferritin  31.91 
 
 		 159 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_2993  bacterioferritin  32.19 
 
 		 165 aa  53.9  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.720861 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00052  bacterioferritin  35 
 
 		 172 aa  53.9  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_826  bacterioferritin domain protein  32.37 
 
 		 275 aa  54.3  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1546  bacterioferritin  33.33 
 
 		 161 aa  53.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2432  bacterioferritin  32.14 
 
 		 157 aa  53.9  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00217295  normal  0.283401 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2776  bacterioferritin  31.72 
 
 		 158 aa  53.1  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000706514  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0254  Rubrerythrin  30.66 
 
 		 170 aa  53.1  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2475  bacterioferritin  32.12 
 
 		 160 aa  52.8  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0616  bacterioferritin  30 
 
 		 161 aa  52.8  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.250309  normal  0.347955 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1628  Ferritin Dps family protein  31.03 
 
 		 181 aa  52.8  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2144  bacterioferritin  29.71 
 
 		 160 aa  52.4  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0155041 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002302  bacterioferritin  33.57 
 
 		 158 aa  52.4  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.215823  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2250  bacterioferritin  32.64 
 
 		 157 aa  52  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0153548  decreased coverage  0.00706074 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0197  bacterioferritin  31.91 
 
 		 161 aa  51.6  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4273  bacterioferritin  33.57 
 
 		 161 aa  51.6  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1400  Ferritin and Dps  24.48 
 
 		 154 aa  51.6  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2087  Ferritin Dps family protein  25 
 
 		 169 aa  51.2  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4317  Ferritin Dps family protein  25.53 
 
 		 144 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000113171  hitchhiker  0.0023195 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1765  bacterioferritin  30.28 
 
 		 161 aa  50.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.472691  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2903  bacterioferritin  31.39 
 
 		 160 aa  51.2  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.697742  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3043  bacterioferritin  27.21 
 
 		 159 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0657083  normal  0.301453 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4256  Ferritin Dps family protein  25.53 
 
 		 144 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5224  Ferritin Dps family protein  26.42 
 
 		 184 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.166873 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2579  bacterioferritin  31.43 
 
 		 162 aa  49.7  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0971213 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0943  Ferritin Dps family protein  27.21 
 
 		 183 aa  50.1  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0999203  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3445  bacterioferritin  29.2 
 
 		 160 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0660653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1332  bacterioferritin  31.85 
 
 		 160 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.2166 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>